SF3B1基因K700E突變驅動的MDS/白血病案例分析

來自專欄基於基因組學診斷的癌症靶向治療5 人贊了文章

最近有病人家屬看到我之前寫的關於白血病必須測序的文章， 然後讓病人做了全外顯子測序並將報告發給我，這裡我寫一下簡單的遺傳分析。

首先，測序公司發現SF3B1基因存在K700E錯義突變，鑒於有相關報道，報告認為這是致病突變，這一點我沒有異議。

SF3B1編碼剪接體中一個重要蛋白，突變以後影響RNA的剪接過程， 機制見下圖。

另外交待一下， SF3B1突變是血液病中常見的一個突變，下面的這篇新英格蘭醫學雜誌文章就有報道：

其中血液病中最常見的就是K700E突變，見下圖：

SF3B1 K700E突變的存在並不一定代表致病， 真正的實錘是下面這篇以老鼠為模型的Cancer Cell文章，在造血幹細胞中引入一個拷貝的SF3B1 K700E突變，發現可以致病。

到這一步， 我才放心的告訴病人SF3B1 K700E是致病突變。

但是事情並沒有結束，存在兩個問題，第一是有沒有針對SF3B1突變的靶向藥物，第二是病人該如何治療。這時候我要求做測序公司做重分析， 重點看TP53, DNMT3A, TET2, SETDB1和ASXL1這5個基因， 我就不解釋為什麼了。

結果發現TET2有無義突變，意味著一半的TET2蛋白沒有功能， 另外TP53 存在P72R錯義突變。 這時候我建議病人使用低劑量地西他濱治療，原因是因為我之前寫的文章，Tim Ley在新英格蘭醫學雜誌上發表結果，報道存在TP53突變的MDS/AML病人對地西他濱的反應比較好。

這個案例可以讓你了解，拿到測序報告以後我做的事情中冰山的一角， 閱讀測序報告，搜索突變資料庫，查閱醫學研究文獻並進行分析，出具結論，所有這些步驟都需要時間。

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