PCR 引物不用愁，一個網站全搞定

來自專欄生物科研5 人贊了文章

還在為設計 PCR or qPCR 引物耗損腦細胞嗎？

還在為 P 不出條帶而不斷摸索條件費時費力嗎？

還在為 P 出了條帶，but，有 N 條條帶而糾結痛苦嗎？

下面，筆者將介紹一個神奇的網站，只有輸入你想研究的基因名，就能找到合適的引物。

PrimerBank

PrimerBank 是一個 PCR 引物的公共資料庫。 其引物可以用於 PCR 或 qPCR，共包含超過 306 800 個引物，涵蓋大多數已知的人和小鼠基因。

有幾種方法可以搜索 PrimerBank 上的引物：GenBank 登錄號，NCBI 蛋白質登錄號，NCBI 基因 ID，Gene Symbol，PrimerBank ID 或 Keyword。

下面將以 GAPDH 舉例說明怎麼利用 PrimerBank 來查找引物：

1打開網站主界面

2在 search for PCR primer 的 Search by 下拉菜單中選擇想通過所查基因的什麼信息來查找引物，一般知道基因名稱的話，選擇 NCBI gene symbol（如果不知道所查基因的基因名是否為 gene symbol，則選 Keyword。例如大家熟知的 β-acting，其 gene symbol，也就是官方大名其實是叫 ACTB）；

在 Species 中選擇物種 human or mouse；

For text 中填入想查基因的 gene symbol；

之後，Submit；

可以看到針對 GAPDH 的不同對引物，具體序列，長度，Tm 值以及在其 cDNA 上位置等一些列信息

點擊「Click here for cDNA and amplicon sequence」，可以得到這對引物擴增的片段序列及位置：

紅色標記為上下游引物，藍色標記為引物之間的擴增序列：

超級方便有木有，大家快去試試吧～