基化基因區分肺腺癌和肺鱗癌
在各種組織學類型的非小細胞肺癌(NSCLC)中存在基因異常甲基化的顯著差異,其包括腺癌(AC)和鱗狀細胞癌(SCC)。由於其獨特的遺傳和表觀遺傳特徵,應對兩種NSCLC亞型施用不同的化學治療方案。這項薈萃分析的目的是生成AC和SCC之間差異甲基化基因的列表。我們的薈萃分析包括對12946名AC和10243名SCC患者的108項基因進行的151項研究。我們的研究結果顯示兩個低甲基化基因(CDKN2A和MGMT)和三個高甲基化基因(CDH13,RUNX3和APC)在AC中與SCC相比。此外,我們的結果顯示CDH13和APC的合併特異性和靈敏度值高於CDKN2A,MGMT和RUNX3。我們的研究結果可能提供一種區分兩種NSCLC亞型的替代方法。
肺癌仍然是主要的貢獻者癌症相關死亡率,224210新發病例和死亡病例159260在美國於2014年,雖然肺癌的發病率已經從2000年下降。非小細胞肺癌(NSCLC)占肺癌的近84%,包括兩種組織學亞型腺癌(AC)和鱗狀細胞癌(SCC),其源自上皮細胞,排列在較大的氣道和外周小氣道分別為。
AC和SCC之間的鑒別診斷具有臨床意義。根據國家綜合癌症網路(NCCN)對NSCLC的指導,AC和SCC的化療方案是不同的。例如,培美曲塞是多酶抑製劑,其被用在AC患者,而不是在SCC患者。目前鑒別診斷的方法通常涉及完整手術切除標本的免疫組織化學染色。染色蛋白由AC陽性標記(TTF-1,CK7,Muci和NapsinA)和SCC陽性標記(CK5/6,HMWCK,NTRK1/2和p63)組成。最廣泛使用的TTF-1的敏感性僅為62%,這表明需要開發用於鑒別診斷的新標記]。此外,幾乎25%的分化不良的NSCLC患者不能由TTF-1分類,這表明需要互補的標記,以提高特異性。
在人類癌症的多步驟發展過程中,表觀遺傳修飾已被證明是一種重要的調節機制。不同外遺傳修飾和不同微RNA和基因表達圖譜中發現的AC和SCC,這表明有兩種亞型[之間不同的分子簽名]。一些研究報告說的甲基化率APC,CDH13,RARβ,LINE-1,RASSF1和RUNX3均AC比SCC,而較高的甲基化率DAPK,TIMP3,TGIF和SFRP4更經常在SCC觀察相比AC。此外,AC和SCC之間存在顯著不同的化療結果。
由於證據量越來越大,有必要通過綜合文獻綜述建立一個簡短的甲基化基因列表。Meta分析可以克服單項研究中小樣本的局限性,通過各種研究的組合和定量評估,實現更可靠和完整的後果。在這項研究中,我們系統地回顧了最近的甲基化研究,並總結了AC和SCC之間的差異基因甲基化,旨在提供一些表觀遺傳學線索,以闡明不同組織學亞型NSCLC的分子生物標誌物。
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