推薦幾款個人使用的科研軟體
09-11
推薦幾款個人使用的科研軟體
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前兩天，有個准研究生在微信上問我：「我使用的是哪款型號的PC能帶動這麼多科研軟體？」得了，既然如此，那我就推薦一下我的PC上已經在使用的科研軟體，同時也來談談這些科研軟體所需的最低配置。
我從大腦研究的技術手段開始，從EEG/ERP、fNIRS、TMS以及刺激呈現等的幾大類來推薦。EEG/ERP腦電分析儀從我前面的推文中，大家應該可以發現，我主要使用的Brain Products腦電廠家的設備，所以商業類我僅推薦BP的軟體。商業類：（商業類的軟體是需要加密狗或者其它加密文件）名稱：Brain Vision Analyzer分析軟體
介紹理由：這款分析軟體非常穩定，可讀取不同設備採集的EEG信號數據格式可達25+以上。對於用戶來說，分析界面非常的友好，不需要編程技術基礎，但你能做到數據的預處理、分段、疊加、獨立成分分析（ICA）、小波分析、頻譜分析，更高級的MR correction、TMS correction等。PC配置：操作系統：Window XP、Window 7、Window 8、Window10所需最低配置：Intel Pentium IV or higher, 512 MB of RAM, 8 GB hard disk,graphics adapter with 64 MB of RAM推薦閱讀：獨立成分分析（ICA）BP設備採集的數據修改Marker標記點名稱：Brain Vision Recorder記錄軟體介紹理由：這款是BP設備的採集EEG信號的記錄軟體，可自由定製workspace，可單/雙導聯採集。當然，最重要的是穩定。
PC配置：同上推薦閱讀：BrainVision Recorder中的使用技巧名稱：Brain Vision Pycorder記錄軟體介紹理由：這款是基於Python語言開發的適用於BP中的一款放大器進行數據採集的軟體，這款軟體最大的優勢在於，對於腦機介面的在線數據分析能實時的讀取設備進行數據分析。PC配置：同上名稱：BESA_Research_6.1介紹理由：這款軟體是用於溯源分析的，當然也能進行EEG信號的數據預處理、分析等。功能是比較強大的，就看如何作分析。開源類名稱：MATLAB 2012a
介紹理由：matlab是一款非常強大的編程語言，在它的基礎上有很多數據包可以進行腦電、近紅外、核磁的數據分析等。PC配置：當前的主流PC基本上都能運行。名稱：eeglab13_3_2b介紹理由：基於matlab下用於分析腦電數據的插件，基本能讀取當前市場上的主流設備的數據格式，這款軟體的分析需要一定的編程基礎，當然也可根據其中的函數語句自有定製數據分析。推薦閱讀：腦電分析之眼電糾正名稱：letswave6 https://github.com/NOCIONS/letswave6介紹理由：這款軟體也是基於matlab下的分析EEG信號的數據包，這個相比於eeglab來說，可視化圖比較友好，分析也能達到預期的效果。名稱：Python介紹理由：免費的開源性語言，Python最大的優勢是非常容易上手，需要分析哪些數據就會有一些庫的支持，只需要調用即可。
名稱：MNE http://www.martinos.org/mne/stable/index.html介紹理由：用於探索，可視化和分析人類神經生理學數據的開源Python軟體：MEG，EEG，sEEG，ECoG等，視圖很漂亮。操作有一定的困難，不過我在學。推薦閱讀：MNE-Python學習資料名稱：sLORETA 2008-11-04 http://www.uzh.ch/keyinst/loreta.htm 介紹理由：從Analyzer的導出的數據可用於這款軟體的溯源分析，進一步對EEG信號的源定位分析。fNIRS近紅外腦成像同樣，在前面一直寫的關於近紅外的資料也是在NIRX廠家的相關資料下推薦的，所以在商業軟體方面，我只推薦NIRX的軟體。商業類（商業類的軟體是需要加密狗或者其它加密文件）名稱：NIRStar 15-2數據採集
介紹理由：這是NIRX的數據採集記錄軟體，可視化展示Oxy/deoxy 血氧濃度的變化，也可將數據輸出給第三方軟體進行實時數據處理。PC配置：操作系統：Window 7、Window 8、Window10所需最低配置：8GB of RAM, 2GB hard disk,graphics adapter with more than 256 colors名稱：nirsLAB數據分析 https://www.nitrc.org/frs/?group_id=651介紹理由：這款是分析fNIRS的數據分析軟體，完全能滿足數據的預處理，血氧濃度的計算，GLM分析等功能推薦閱讀：近紅外數據分析之流程光學近紅外腦成像原理開源類：
名稱：homer2_src_v2_3_10202017 http://homer-fnirs.org/documentation/ 介紹理由：這個也是基於matlab下開發的軟體。這款軟體來說，是目前近紅外腦成像分析最常用到的分析軟體，軟體的界面很友好，唯一的要求就是各廠商對於數據格式導入時需要進行數據的轉換。名稱：NIRS_SPM_v4_r1_2 https://www.nitrc.org/frs/?group_id=621介紹理由：這個也是基於matlab下的數據包。這款軟體主要是基於SPM8下的一階相關性分析，同時這款軟體對於探測的準確位置也能進行空間上的模擬演算。TMS經顱磁對於tms來說，我目前主要接觸比較多的是導航類的軟體，對於刺激的部位準確性有一定的要求。商業類：名稱：TMS neuronavigator介紹理由：這是一款TMS神經導航的軟體，可定位於刺激的準確位置。在以後的機會中，我會更新一些關於TMS的知識。刺激呈現：
名稱：E-prime 3.0介紹理由：這款軟體就不多說了，很多人都在使用。基本能滿足一些實驗的要求，但是對於實驗精度比較高的實驗，並不建議，有一定的刷新率延遲。推薦閱讀：E-prime軟體基本操作E-prime學習資料名稱：Presentation http://www.neurobs.com/介紹理由：這款軟體需要有一定的編程基礎，我覺得這款軟體的優勢在於延遲性要比E-prime低，而且還提供了一個月的免費試用時間，非常棒。推薦閱讀：Presentation軟體發marker方式名稱：Psychtoolbox-3 http://psychtoolbox.org
介紹理由：這個軟體是基於matlab下的數據包，非常的強大，特別對於一些視覺的實驗來說，呈現的延遲性會好很多，編程能力是一大要求。其它科研軟體：名稱：SPSS 25介紹理由：對於數據統計來說，這款軟體對於初學者來說是最友好不過了。強大的分析模塊，應有盡有，當然破解版更是層出不窮。名稱：EndNote8介紹理由：文獻管理的一大神器名稱：Brain Tutor介紹理由：這個軟體融合了多種大腦分區方法，同時支持手機版，所以值得大家知道。推薦閱讀：大腦可視化之軟體篇
對於大腦科研軟體，當然不僅僅只有這些，還有很多一些優秀的科研軟體，以上這些軟體，是我經常使用到的。希望能帶給一些初入大腦研究的學生們有幫助，再次回到PC的配置問題，其實大家可以看到在以上的軟體中最低配置，其實要求都不高，當前主流的PC配置下，我推薦處理器I5、運存8GB、硬碟500GB基本就能帶動了，想要更快的可使用固態硬碟，我個人使用的ThankPad X270。由於當前的一些科研軟體基本是window使用的居多，對於蘋果機來說，個人覺得有些不必要，當然也要看個人喜好了。總之，學好數據處理的方法及思想才是最重要的，對於PC機，個人覺得夠用就好，想要有一定的運行速度的可選擇固態硬碟，速度跑起來杠杠的。好了，今天就說到這了。如果你也有好的科研軟體，歡迎右下角留言來談談。文章僅限學習使用，不用於商業行為，若有侵權及疑問，請後台留言！
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