加一行代碼,讓你的Python的運算速度加快100倍

加一行代碼,讓你的Python的運算速度加快100倍

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#注釋 此文章轉自魚C論壇,原作者:jerryxjr1220 原地址:bbs.fishc.com/thread-90


python一直被病垢運行速度太慢,但是實際上python的執行效率並不慢,慢的是python用的解釋器Cpython運行效率太差。

「一行代碼讓python的運行速度提高100倍」這絕不是嘩眾取寵的論調。

我們來看一下這個最簡單的例子,從1一直累加到1億。

原始代碼:

import timedef foo(x,y): tt = time.time() s = 0 for i in range(x,y): s += i print(Time used: {} sec.format(time.time()-tt)) return sprint(foo(1,100000000))

結果:

Time used: 6.779874801635742 sec

4999999950000000

from numba import jitimport time@jitdef foo(x,y): tt = time.time() s = 0 for i in range(x,y): s += i print(Time used: {} sec.format(time.time()-tt)) return sprint(foo(1,100000000))

結果: Time used: 0.04680037498474121 sec 4999999950000000

是不是快了100多倍呢?


那麼下面就分享一下「為啥numba庫的jit模塊那麼牛掰?」(轉自:hyry.dip.jp/tech/slice/

NumPy的創始人Travis Oliphant在離開Enthought之後,創建了CONTINUUM,致力於將Python大數據處理方面的應用。最近推出的Numba項目能夠將處理NumPy數組的Python函數JIT編譯為機器碼執行,從而上百倍的提高程序的運算速度。

Numba項目的主頁上有Linux下的詳細安裝步驟。編譯LLVM需要花一些時間。 Windows用戶可以從Unofficial Windows Binaries for Python Extension Packages下載安裝LLVMPy、meta和numba等幾個擴展庫。

下面我們看一個例子:

import numba as nbfrom numba import jit@jit(f8(f8[:]))def sum1d(array): s = 0.0 n = array.shape[0] for i in range(n): s += array[i] return simport numpy as nparray = np.random.random(10000)%timeit sum1d(array)%timeit np.sum(array)%timeit sum(array)10000 loops, best of 3: 38.9 us per loop10000 loops, best of 3: 32.3 us per loop100 loops, best of 3: 12.4 ms per loop

numba中提供了一些修飾器,它們可以將其修飾的函數JIT編譯成機器碼函數,並返回一個可在Python中調用機器碼的包裝對象。為了能將Python函數編譯成能高速執行的機器碼,我們需要告訴JIT編譯器函數的各個參數和返回值的類型。我們可以通過多種方式指定類型信息,在上面的例子中,類型信息由一個字元串』f8(f8[:])』指定。其中』f8』表示8個位元組雙精度浮點數,括弧前面的』f8』表示返回值類型,括弧里的表示參數類型,』[:]』表示一維數組。因此整個類型字元串表示sum1d()是一個參數為雙精度浮點數的一維數組,返回值是一個雙精度浮點數。

需要注意的是,JIT所產生的函數只能對指定的類型的參數進行運算:

print sum1d(np.ones(10, dtype=np.int32))print sum1d(np.ones(10, dtype=np.float32))print sum1d(np.ones(10, dtype=np.float64))1.2095376009e-3121.46201599944e+18510.0

如果希望JIT能針對所有類型的參數進行運算,可以使用autojit:

from numba import autojit@autojitdef sum1d2(array): s = 0.0 n = array.shape[0] for i in range(n): s += array[i] return s%timeit sum1d2(array)print sum1d2(np.ones(10, dtype=np.int32))print sum1d2(np.ones(10, dtype=np.float32))print sum1d2(np.ones(10, dtype=np.float64))10000 loops, best of 3: 143 us per loop10.010.010.0

autoit雖然可以根據參數類型動態地產生機器碼函數,但是由於它需要每次檢查參數類型,因此計算速度也有所降低。numba的用法很簡單,基本上就是用jit和autojit這兩個修飾器,和一些類型對象。下面的程序列出numba所支持的所有類型:

print [obj for obj in nb.__dict__.values() if isinstance(obj, nb.minivect.minitypes.Type)][size_t, Py_uintptr_t, uint16, complex128, float, complex256, void, int , long double, unsigned PY_LONG_LONG, uint32, complex256, complex64, object_, npy_intp, const char *, double, unsigned short, float, object_, float, uint64, uint32, uint8, complex128, uint16, int, int , uint8, complex64, int8, uint64, double, long double, int32, double, long double, char, long, unsigned char, PY_LONG_LONG, int64, int16, unsigned long, int8, int16, int32, unsigned int, short, int64, Py_ssize_t]

工作原理

numba的通過meta模塊解析Python函數的ast語法樹,對各個變數添加相應的類型信息。然後調用llvmpy生成機器碼,最後再生成機器碼的Python調用介面。

meta模塊

通過研究numba的工作原理,我們可以找到許多有用的工具。例如meta模塊可在程序源碼、ast語法樹以及Python二進位碼之間進行相互轉換。下面看一個例子:

def add2(a, b): return a + b

decompile_func能將函數的代碼對象反編譯成ast語法樹,而str_ast能直觀地顯示ast語法樹,使用這兩個工具學習Python的ast語法樹是很有幫助的。

from meta.decompiler import decompile_funcfrom meta.asttools import str_astprint str_ast(decompile_func(add2))FunctionDef(args=arguments(args=[Name(ctx=Param(), id=a), Name(ctx=Param(), id=b)], defaults=[], kwarg=None, vararg=None), body=[Return(value=BinOp(left=Name(ctx=Load(), id=a), op=Add(), right=Name(ctx=Load(), id=b)))], decorator_list=[], name=add2)

而python_source可以將ast語法樹轉換為Python源代碼:

from meta.asttools import python_sourcepython_source(decompile_func(add2))def add2(a, b): return (a + b)

decompile_pyc將上述二者結合起來,它能將Python編譯之後的pyc或者pyo文件反編譯成源代碼。下面我們先寫一個tmp.py文件,然後通過py_compile將其編譯成tmp.pyc。

with open("tmp.py", "w") as f: f.write("""def square_sum(n): s = 0 for i in range(n): s += i**2 return s""")import py_compilepy_compile.compile("tmp.py")

下面調用decompile_pyc將tmp.pyc顯示為源代碼:

with open("tmp.pyc", "rb") as f: decompile_pyc(f)def square_sum(n): s = 0 for i in range(n): s += (i ** 2) return s

llvmpy模塊

LLVM是一個動態編譯器,llvmpy則可以通過Python調用LLVM動態地創建機器碼。直接通過llvmpy創建機器碼是比較繁瑣的,例如下面的程序創建一個計算兩個整數之和的函數,並調用它計算結果。

from llvm.core import Module, Type, Builderfrom llvm.ee import ExecutionEngine, GenericValue# Create a new module with a function implementing this:## int add(int a, int b) {# return a + b;# }#my_module = Module.new(my_module)ty_int = Type.int()ty_func = Type.function(ty_int, [ty_int, ty_int])f_add = my_module.add_function(ty_func, "add")f_add.args[0].name = "a"f_add.args[1].name = "b"bb = f_add.append_basic_block("entry")# IRBuilder for our basic blockbuilder = Builder.new(bb)tmp = builder.add(f_add.args[0], f_add.args[1], "tmp")builder.ret(tmp)# Create an execution engine object. This will create a JIT compiler# on platforms that support it, or an interpreter otherwiseee = ExecutionEngine.new(my_module)# Each argument needs to be passed as a GenericValue object, which is a kind# of variantarg1 = GenericValue.int(ty_int, 100)arg2 = GenericValue.int(ty_int, 42)# Now lets compile and run!retval = ee.run_function(f_add, [arg1, arg2])# The return value is also GenericValue. Lets print it.print "returned", retval.as_int()returned 142

f_add就是一個動態生成的機器碼函數,我們可以把它想像成C語言編譯之後的函數。在上面的程序中,我們通過ee.run_function調用此函數,而實際上我們還可以獲得它的地址,然後通過Python的ctypes模塊調用它。

首先通過ee.get_pointer_to_function獲得f_add函數的地址:

addr = ee.get_pointer_to_function(f_add)addr2975997968L

然後通過ctypes.PYFUNCTYPE創建一個函數類型:

import ctypesf_type = ctypes.PYFUNCTYPE(ctypes.c_int, ctypes.c_int, ctypes.c_int)

最後通過f_type將函數的地址轉換為可調用的Python函數,並調用它:

f = f_type(addr)f(100, 42)142

numba所完成的工作就是:

解析Python函數的ast語法樹並加以改造,添加類型信息;

將帶類型信息的ast語法樹通過llvmpy動態地轉換為機器碼函數,然後再通過和ctypes類似的技術為機器碼函數創建包裝函數供Python調用。


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