四行代碼畫出你需要的熱圖

四行代碼畫出你需要的熱圖

今天給大家分享一下如何快速畫出熱圖,這裡教大家只用四行代碼畫出熱圖,多一行就算我們輸。

數據準備

我們需要準備一個差異基因表達的矩陣文件,命令為GEO.txt,如下圖:

將這個GEO.txt文件放在heatmap文件夾

四行代碼

第一行代碼:

setwd("C:\Users\scikuangren\Desktop\heatmap") #設定工作目錄

第二行代碼:

inputdata<-read.table("GEO.txt",header = T,sep=" ",row.names = 1)

#讀取文件數據

第三行代碼:

inputdata<-as.matrix(inputdata) #將數據框轉化為矩陣

第四行代碼:

heatmap(inputdata[1:20,]) #畫熱圖

熱圖展示

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