四行代碼畫出你需要的熱圖
今天給大家分享一下如何快速畫出熱圖,這裡教大家只用四行代碼畫出熱圖,多一行就算我們輸。
數據準備
我們需要準備一個差異基因表達的矩陣文件,命令為GEO.txt,如下圖:
將這個GEO.txt文件放在heatmap文件夾
四行代碼
第一行代碼:
setwd("C:\Users\scikuangren\Desktop\heatmap") #設定工作目錄
第二行代碼:
inputdata<-read.table("GEO.txt",header = T,sep=" ",row.names = 1)
#讀取文件數據
第三行代碼:
inputdata<-as.matrix(inputdata) #將數據框轉化為矩陣
第四行代碼:
heatmap(inputdata[1:20,]) #畫熱圖
熱圖展示
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