TCGA miRNA數據挖掘文獻分享

昨天給大家分享了TCGA lncRNA數據挖掘的文獻 ~TCGA lncRNA數據挖掘文獻分享，今天給大家分享一下TCGA miRNA數據挖掘的文獻。

這篇文章的題目是：Seven protective miRNA signatures for prognosis of cervical cancer

論文摘要：

宮頸癌是20多歲和30多歲女性癌症死亡的第二個原因，但對其預後的研究卻很有限。本研究旨在鑒定與預後相關的miRNA並研究其功能。宮頸癌患者的TCGA數據用於建立具有單一臨床參數或miRNA表達水平的單變數Cox模型。使用臨床信息和miRNA表達水平構建多變數Cox模型。最後，STRING被用於豐富基因本體或途徑，用於顯著miRNA的驗證目標，並可視化他們之間的互動。使用單變數Cox模型與臨床參數，我們發現兩個臨床參數，煙草使用和臨床階段，和七個miRNA與生存狀態高度相關。僅使用miRNA特徵的表達水平，該模型可以成功地將患者分為高風險和低風險組。基於兩個臨床參數和七個miRNA提出了最佳特徵選擇模型。這七種miRNA的功能分析顯示它們與癌症相關的各種途徑相關，包括MAPK，VEGF和P53途徑。這些結果有助於確定靶向治療靶點的研究，這可能有助於為宮頸癌患者量身定製治療方案。

作者的主要工作：

1、篩選與預後相關的臨床參數

2、建立單因素的Cox回歸模型

3、建立多因素的Cox回歸模型

4、進行靶基因預測

5、對靶基因進行GO富集分析

6、對靶基因進行KEGG富集分析

7、對靶基因進行PPI分析

本文來源於微信公眾號SCI狂人，版權歸SCI狂人團隊所有。

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