基因檢測產業的過去、現在和未來
《時間簡史》的作者斯蒂芬·霍金、微軟的創立者之一保羅·艾倫、DNA的發現者沃森、蘋果的喬幫主,這些人和我們有什麼區別?可能有很多差別,但其中一個很有趣的差別是:這些人都知道他們的全基因組序列。
這些人為什麼要對自己的基因組測序?通過了解房子的結構,我們能預測它能抵抗幾級的大風;通過了解一個國家的政治構成,我們能知道它應對危機的能力;同樣,因為個人基因組包含了他/她的健康信息,所以通過了解個人基因組序列,可以一定程度預測他/她在不同情況下可能的健康狀況。
利用基因組信息進行健康評估,需要兩個條件。首先需要弄清楚個人的基因組全序列;其次是要知道特定的基因組DNA序列與健康狀況的關係。技術與基礎研究的進步使這兩個條件為可能。一方面,應用新一代DNA測序技術能夠了解個人基因組信息。而迅速發展的技術創新使測序日益便捷,成本不斷下降。現在全球的很多傑出研究人員都在努力向1000美金一個個人基因組的目標邁進,因此基因組DNA測序有可能逐步發展為民用。另一方面,迅速發展的全基因組關聯研究(Genome-Wide AssociationStudy,GWAS)能夠建立起特異的個人基因序列與疾病的關係。個人基因序列與疾病相關性資料庫在迅速擴大。因此,通過結合個人基因組測序分析和GWAS,人類就有可能根據個人DNA序列破譯健康密碼。
沒有人不關心自己和家人的健康。如果能在任何時候甚至出生前就了解自己關心的人的健康信息,那無疑對於治病防病都有非常深遠的意義。因此,基於個人基因組DNA信息的健康評估有潛在的市場,有可能發展成為一個新興的龐大產業。那麼,個人DNA信息諮詢產業到底能提供哪些服務?有哪些公司在從事這樣的服務?他們成功失敗的教訓有哪些?普通大眾對這項服務的接受度有多大?這個產業的發展趨勢怎樣?中國自己的個人DNA信息諮詢有怎樣的前景?我試圖通過系統梳理相關信息,回答上述問題。
一、背景:個人全基因組測序vs全基因組關聯研究(GWAS)
人類基因組大約30億鹼基分布在23對染色體上。人際之間的基因組99.5%-99.9%都是相同的,但是也存在0.1%-0.5%的差異。人群中任何DNA序列的不同被稱為多態性。正是這些多態性,導致了人類各種性狀的千差萬別。這些多態性是由自然選擇過程固定在人類基因組之內的。
這些DNA多態性分為很多種。
首先是序列變異。序列變異包括單個DNA鹼基的不同,DNA插入,以及缺失。一個物種的不同成員之間單個核酸的差異叫做單核苷酸多態性,通常被稱為SNPs。據估計,人類基因組中含有1000到3000萬的SNPs。占序列變異的90%以上。其中,3%-5%的SNPs是有功能的,也就是對人類性狀有影響。
其次是結構變異。一個物種內部各成員之間在染色體結構上的不同屬於結構變異,包括拷貝數變異,缺失,反轉,插入和複製。根據2007年對DNA的發現者沃森和合成生物學大牛Craig Venter的DNA測序發現,人類基因組中結構變異的數量遠遠超過序列變異。
表觀遺傳學變異。DNA通常會有各種的修飾,因此除了DNA的序列和結構上的差異,物種內部各個個體之間還存在著這些DNA修飾的差異,被稱為為表觀遺傳學變異。
很多基因變異能夠影響人類的性狀。全基因組關聯研究就是一種研究基因變異和性狀之間關係的方法。目前,GWAS主要針對的是序列變異中的SNPs同性狀之間的關係。第一個成功的GWAS項目完成於2005年,發現了兩個和老年黃斑變性相關的SNPs。隨後,GWAS呈指數增長,成百上千的與各種疾病相關的SNPs已經被發現。
二、個人DNA測序技術的應用
目前,個人DNA測序主要用於科研。然而個人DNA測序成為民用是大勢所趨,因此,很多公司紛紛成立,希望佔領測序市場。現在的針對普通百姓的DNA測序主要有哪些服務項目呢?
首先就是包括親子鑒定,種族,血統,家譜等基因檢測。因為DNA序列能夠揭示最為複雜和隱秘的人與人之間的關係,所以有很多這樣的服務公司。
DNA測序最有潛力的應用,是在個人健康評估上,可是因為與疾病相關的所有DNA變異還沒有被全部揭示,因此這項服務還有局限。另外,基因變異只是和健康狀況相關的一極,另一極則是複雜的環境因素。儘管如此,個人DNA信息諮詢服務還是一個快速發展的領域。
三、個人基因諮詢服務公司
與個人基因諮詢相關的公司很多,大多數公司的服務局限於關係鑒定比如親子鑒定,種族血統分析等方面。這裡只談和健康諮詢有關的公司。
· 先說說已經倒閉的公司
Bioresolve。成立於2008年或者更早,總部位於加拿大渥太華。提供針對多種疾病的DNA分析。2009年3月,公司發布了旗艦產品:299美元的基因檢測試劑盒,可以根據個人基因組信息預測患各種疾病的潛在幾率。2009年5月,他們增加了豬流感和世界性流行病情況下個人生存幾率的DNA檢測服務。2012年2月,這家公司倒閉。
DeCODE Genetics。成立於1996年,總部位於冰島的Reykjavík。這家公司最初致力於發現和疾病有關的基因。隨後,該公司雄心勃勃地希望建立一個覆蓋所有冰島人的醫療記錄、家系和基因信息的資料庫。因為涉及個人隱私,這個資料庫項目引發了巨大的爭議。2003年11月,冰島最高法院否決了這個項目。在隨後的幾年裡,這家公司一直在虧損,每年虧損上千萬美金。2006年年末,公司的財政赤字達到5.3億美金。同時期,這家公司也經歷很多員工的電腦欺詐,以及隱私泄露等問題。2007年11月,這家公司推出了一款叫做DeCODEme的服務,該服務以985美金的價格,利用客戶的口腔粘膜進行DNA檢測,從而發現疾病風險以及家系血統。這是第一款以網路為依託的個人全基因組掃描服務,覆蓋超過100萬的SNPs。2008年11月24日,DeCODE Genetics下架納斯達克股票。2009年11月,有報道稱公司向美國法院申請破產,當時公司資產為7000萬美金,而負債高達3.1億美金。2012年12月,DeCODEGenetics以4.15億美金的價格被生物公司Amgen收購,並將不再提供基因組分析的服務。
· 再說說還在運作的公司
DNA Traits,總部位於德州休斯頓。主要致力於基於DNA信息的遺傳病檢測。
Geneplanet,總部位於斯洛維尼亞。這家公司現在提供兩款服務。一款是499美金的個人基因組分析。這項服務可以評估包括癌症,心腦血管疾病,免疫系統疾病在內的20種疾病的風險,5種常用藥物的反應,以及包括酒精代謝、記憶力、肌肉結構等近20種特徵分析。另一款是399美金的基於基因基礎的個人營養指南。包括合適的藥物、膳食選擇等。
Genelex,總部位於西雅圖。這家公司主要針對藥物反應的個體差異,因此他們集中於與藥物代謝相關的酶的基因多態性分析,而不是全基因組上的關鍵SNPs。
Knome,成立於2007年,總部位於麻省劍橋。這是第一家真正的個人全基因組分析公司。其它大多數公司包括DeCODE、23andme、Navigenetics都是只檢測人類基因組中的某些SNPs,而Knome則實現真正意義上的全基因組序列分析,也就是檢測人類30億個DNA鹼基全序列。價格包括軟體結果分析一共約12.5萬美金每人。
Navigenics,成立於2007年,總部在加州的Foster城。同Geneplanet類似,這家公司提供包括阿爾茨海默病、2型糖尿病、幾種癌症在內的基因組分析。2009年,這項服務的價格下降到999美金。
Pathway Genomics,成立於2008年,總部加州聖地亞哥。這家公司提供個人基因信息、藥物反應、家系分析等服務。
23andMe,成立於2006年四月,總部加州山景城。主打產品是一款涵蓋近100萬個疾病相關SNPs的檢測,價格僅僅99美金。是目前最便宜的個人基因組服務產品。
· 個人基因信息諮詢公司如何運作?
除了Knome這樣的提供全基因組測序的公司,其它基因服務公司主要的程序是這樣的:
· 在線註冊。由客戶完成;
· 收集口水:公司隨後寄出一個容器給註冊付款的客戶,客戶按照說明將口水存入容器,寄回公司;
· 完成測序以及分析:公司從口水中提取DNA,進行SNPs分析,主要應用的是Illumina的SNPs檢測產品。然後給出報告。全程耗時大約6到8周;
· 跟蹤服務:因為已知的同疾病相關的SNPs的研究不斷在更新,因此假如客戶願意付月費的話,會得到與自己的基因信息相關的更多更新的信息。
劍走偏鋒的Foundation Medicine
與上述個人基因服務公司針對健康人群不同,成立於2009年的FoundationMedicine專攻癌症患者。2011年這家公司推出第一款產品FoundationOne,對病人腫瘤樣本進行測序,提供的信息能有效指導病人的後續治療。
四、成敗得失
Bioresolve和DeCODE這兩家公司為什麼會倒閉?Bioresolve倒閉的原因據說主要是原因是客戶沒有能及時收到檢測結果,而公司對客戶的抱怨置之不理。也就是經營的原因。但是這應該不是主要原因。從DeCODE的例子可以看出,因為涉及個人隱私,從而引發民眾的擔憂和反感,市場收縮,無法盈利,才是公司倒閉的主要原因。
在那些還在運作的公司當中,現在看來最成功的個人基因服務公司應該是23andMe,而他們成功的最主要原因是低廉的價格。這是真相還是泡沫?我個人覺得還是泡沫。理由很簡單,首先是價格低得不靠譜。覆蓋100萬個SNPs的DNA檢測,價格只有99,難道是技術革新引發的成本下降?顯然不是,技術進步沒有這麼快。檢測的成本肯定超過99美金。其次是降價幅度太快。我們看DeCODE的降價過程就能得出這個結論:2003年之後,公司每年虧損近億元,可是公司還在不斷推出新產品,不斷降價,越是賠錢越要降價,越降價就越賠錢。所以23andMe也應該面臨同樣的情形。我敢肯定23andMe現在根本不賺錢。至於他們哪來的這麼多錢,主要是背後的風險投資在支持,他們都是在賭。他們賭的是贏得市場後,用後續服務賺錢。
五、個人基因信息諮詢服務的現在和未來
我和實驗室的一個德國女孩,一個印度女孩商量好要嘗試一下99美金的23andMe的DNA諮詢服務。誰知第二天那個德國女孩變卦了:她和她老公商量,老公反對,因為他們想要小孩,擔心結果會影響他們的決定,假如小孩有15%幾率先天性心臟病,他們不知道如何選擇。
個人基因諮詢最大的問題就是:報告結果不是一個具體的yes或no,而是一個幾率,環境的影響很大。所以會讓人有無所適從的感覺。
第二個問題就是隱私的問題。很多人擔心自己的隱私被被人利用,從而拒絕DNA檢測。
具體到中國呢?國人的一個心態特點是,有了病,砸鍋賣鐵,幹什麼都成,可是沒有病的時候,只根據一紙預測,大多數人不會信服的。另外,中國人喜歡算命。傳統的手相,八字直到現在的星座,大家玩得不亦樂乎。可是,大家並不見得多當真。而且,中國人算命之後是要破的,也就是把不好的命破掉,所謂破財免災,說的就是這種心態。DNA檢測結果很顯然是破不了的,只能認命,要戰戰兢兢,如履薄冰的預防。所以中國人對個人基因服務的認可度暫時不會太高。
隨著科學的進步,越來越多的疾病相關變異被確定,DNA檢測的結果會變得更加可靠。根據現在GWAS發展的速度,再有10年左右,DNA預測的準確度會增加很多。另外10年之後,可能人們通過立法等行為,對個人基因隱私的保護更可靠。只有到那個時候,這些基因諮詢公司才可能風生水起。中國的市場,由於文化傳統的影響,接受可能會更晚。
但是有兩個領域現在的市場就很大。
第一是針對病人的個人基因服務。比如FoundationMedicine的腫瘤DNA檢測。因為已經得病,肯定就會關心如何更好的治病。
第二是高危人群。有個美國女孩叫Allyn Rose,今年24歲。她獲得很多選美的獎牌,並將競選2013美國小姐。她的母親在27歲被診斷出乳腺癌,因此她計劃在參加完選美後實施乳房切除術,因為她的家族史決定了高乳腺癌發病幾率。可以想像,這樣的人是會迫不及待的希望進行DNA檢測,看她們是否需要實施乳房切除術。
六、結論
個人信息服務三步走:
第一步,針對病人,主要是腫瘤患者;
第二步,針對高危人群,或者有家族疾病史,或者經歷過嚴重的環境污染的人群。隨著人們對環境污染認識的加深,對個人健康的關注,這個市場可能在近期,比如3到5年左右開啟;
第三步,普通大眾,這個市場可能需要至少10年的積累。
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