被忽視的真菌說：保護腸黏膜的細菌倒下，我上~ | 熱心腸日報

07-29

今天是第581期日報。

Cell子刊：兩種真菌可取代細菌，逆轉腸道屏障功能受損

Cell Host and Microbe[IF:14.946]

① 以往的很多研究明確了腸道有益細菌對黏膜屏障的保護作用，但很少有研究把關注點放到有益真菌上；② 用抗生素處理後的小鼠，腸屏障受損，對結腸炎和甲型流感病毒敏感，而在腸道單一定殖假絲酵母菌或釀酒酵母，就可有效逆轉這樣的狀況；③ 保護作用由真菌細胞壁上非常保守的組成——甘露聚糖介導，在腸道中，它自身就可以逆轉清除共生細菌後小鼠的疾病敏感性；④ 若要發揮保護作用，真菌需要長期在腸道定殖，並正向刺激保護性CD8+T細胞激活。

Commensal Fungi Recapitulate the Protective Benefits of Intestinal Bacteria

2017-11-23DOI:10.1016/j.chom.2017.10.013

Nature Reviews：建設可靠的全球病原體實時監控系統（綜述）

Nature Reviews Genetics[IF:40.282]

① 埃博拉和寨卡病毒的疫情提示需要持續監控、快速診斷和實時跟蹤新發傳染病；② 臨床宏基因組學、攜帶型測序儀等新技術可應用於快速反應診斷；③ 基因組診斷及流行病學分析，聯合創新型疾病檢測平台，促進了全球開放性數字化病原體監測系統的建設；④ 利用宏基因組學進行疫情的快速診斷及應對，面臨的挑戰不僅來自於病原體（基因組大小）及宿主（感染時期、病原體滴度），還來自於採樣、樣本處理、測序、信息分析與交流、有效的行動等環節。

Towards a genomics-informed, real-time, global pathogen surveillance system

2017-11-13DOI:10.1038/nrg.2017.88

MSR：利用質譜做腸-腦軸相關代謝組學研究（綜述）

Mass Spectrometry Reviews[IF:9.373]

① 腸道菌群通過改變腸道內穩態影響大腦功能，腸-腦互作的功能紊亂與多種神經退行性疾病相關；② 腸道菌群和宿主共代謝的小分子代謝物（SMM）包括多種神經遞質、色氨酸分解代謝產物、多不飽和脂肪酸、短鏈脂肪酸、膽汁酸等；③ 通過血流、迷走神經和腸神經系統，在腸-腦雙向交流中起到關鍵作用；④ 將多種主要質譜技術（液相色譜-質譜、氣相色譜-質譜、質譜成像等）應用於生物樣本的代謝組學分析，可鑒定出與神經退行性疾病相關的SMM。

Mass spectrometry-based metabolomics: Targeting the crosstalk between gut microbiota and brain in neurodegenerative disorders

2017-11-12DOI:10.1002/mas.21553

Neurotherapeutics：腸肽在焦慮與抑鬱中的作用（綜述）

Neurotherapeutics[IF:5.166]

① 焦慮和抑鬱等精神疾病與菌群-腸-腦軸緊密相關；② 消化道中不同位置和類型的腸內分泌細胞可分泌多種腸肽（神經肽Y家族、縮膽囊素、胰高血糖素樣肽、促皮質素釋放因子、催產素、飢餓素等）；③ 這些信號分子及其受體作用於消化道，並在大腦中廣泛表達，可通過迷走神經、血液循環和免疫系統，直接或間接影響大腦功能；④ 腸道菌群可調控腸肽的分泌和濃度；⑤ 通過精神益生菌手段（Psychobiotics）改善菌群以調控腸肽，可為精神疾病提供新療法。

Anxiety, Depression, and the Microbiome: A Role for Gut Peptides

2017-11-13DOI:10.1007/s13311-017-0585-0

FP：肺結核患者的腸道菌群變化

Frontiers in Physiology[IF:4.134]

① 收集37例肺結核（初治結核NTB、復治結核RTB）以及20例健康對照組樣本，對腸道菌群進行分析；② 基於丰度的覆蓋率估計（ACE）提示，RTB患者的菌群多樣性指數高於健康對照組；③ RTB患者糞便中，包含多種致病菌的放線菌門及變形菌門增高，包含多種有醫生共生菌的擬桿菌門降低；④ NTB和RTB患者中口腔來源的普氏菌屬、毛螺菌屬均顯著低於健康對照組；⑤ 腸道菌群與外周血CD4+T細胞正相關，維持腸道菌群生態平衡，對宿主恢復及預防結核複發有益。

Alternation of Gut Microbiota in Patients with Pulmonary Tuberculosis

2017-11-17DOI:10.3389/fphys.2017.00822

FM：抗生素改變小鼠的糖代謝

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 單一抗生素或抗生素組合處理後，小鼠的空腹血糖降低，但體重未受影響；② 抗生素組合、氨苄青黴素、萬古黴素處理引起葡萄糖耐受的改變；③ 抗生素改變迴腸及肝臟中的基因表達，並改變腸道菌群的α及β多樣性；④ 網路分析揭示了Akk菌與空腹血糖及肝臟法尼醇X受體（Fxr）的相關性，提示腸道細菌介導葡萄糖代謝的系統性變化的可能機制；⑤ 單形擬桿菌與肝臟Fxr正相關，與葡萄糖6-磷酸酶負相關。

Antibiotic-induced Alterations in Gut Microbiota are Associated with Changes in Glucose Metabolism in Healthy Mice

2017-11-22DOI:10.3389/fmicb.2017.02306

FI：益免疫菌——可有益調節免疫系統的益生菌

Frontiers in Immunology[IF:6.429]

① 益免疫菌（Immunobiotics）指可有益地調節宿主免疫系統的菌株；② 其或可預防和緩解感染，調控腸道TLR3的活化，減少局部炎症組織損傷，調節腸道上皮細胞的免疫轉錄應答，誘導產生I型干擾素和抗病毒因子，分化調控細胞因子、趨化因子和粘附分子；③ 並或可調控遠端粘膜免疫應答，改善呼吸系統感染預後，增強抗病毒免疫，防止繼發性細菌感染，減輕代謝紊亂嚴重程度，參與調控其他系統的炎症和代謝；④ 其免疫調控功能具有菌種和菌株特異性。

Immunobiotics-Interactions of Beneficial Microbes with the Immune System

2017-11-17DOI:10.3389/fimmu.2017.01580

NC：大腸桿菌的耐藥性操縱子促進DNA修復及外膜完整性

Nature Communications[IF:12.124]

① 在大腸桿菌的多重耐葯（mar）操縱子中，轉錄因子MarR和MarA調控流出泵和孔蛋白表達；② 鑒定出廣泛的MAR調節因子，PxseA為marA活化的啟動子，marA激活mla調節因子的轉錄，缺乏marA調控的xseA的細胞DNA鏈斷裂；③ 缺乏mlaFEDCB的細胞，屏障功能缺陷、表面疏水性增強，SoxS和Rob結合於xseA和mlaFEDCB啟動子；④ MarA激活DNA修復和脂類運輸所需基因的表達，從而減少抗生素進入細菌及喹諾酮誘導的DNA損傷。

The multiple antibiotic resistance operon of enteric bacteria controls DNA repair and outer membrane integrity

2017-11-13DOI:10.1038/s41467-017-01405-7

感謝本期日報的創作者：熱心腸先生，花開，mildbreeze，沈志勛