SNP：大波乾貨來襲，請您查收......

大家好，我就是SNP，集萬千寵愛於一身的SNP，中文名字：單核苷酸多態性，厲害吧！

為啥我能集萬千寵愛於一身呢？花草離不開我、小動物離不開我、甚至人類都離不開我。人類有研究稱，我引起的變異占人類基因組遺傳多態性的90%以上，你說說，我隨便的一個轉換、顛換、插入、缺失都可能引起人類重大疾病的發生，就這魄力，能不得到重視嗎？這不，人類已經專門為我定製了幾套服務。下面，就由我來向大家介紹一下吧。

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KASP

KASP^? 基因分型技術是一項獨特的競爭性等位基因特異性PCR，可對各種基因組DNA樣本，針對指定的SNP和InDel進行高精度雙等位基因分型，非常適用於SNP位點數小於30的樣本檢測。

KASP技術通過設計兩條等位基因特異性引物進行基因分型，共用反向引物來擴大靶區域，之後通過熒光信號的採集進行數據分析。

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TaqMan探針法通過設計PCR引物和針對於位點的熒光探針實現對SNP的分型檢測，適合少量SNP位點的分析。

其核心是利用Taq酶的3" -5" 外切核酸酶活性切斷探針產生熒光信號。體系中包括一對PCR引物和一條探針，探針只與模板特異性地結合，其結合位點在兩條引物之間，探針的5" 端標記有報告基因，3" 端標記有熒光淬滅基因，當探針完整的時候，報告基團所發射的熒光能量被淬滅基因吸收，儀器檢測不到信號，但是基於獨特的位點設計熒光探針，價格要比KASP需要的通用熒光探針高。

3SNaPshot

SNaPshot技術是一種基於熒游標記單鹼基延伸原理的分型技術，主要針對中等通量的SNP分型項目，通常用於10~30個SNP位點分析。

該技術使用引物擴增目標SNPs所在片段，使用測序酶、四種熒游標記ddNTP和 5" -端緊靠SNP位點的延伸引物進行PCR反應，引物延伸一個鹼基即終止，經ABI測序儀檢測後，根據峰的移動位置確定該延伸產物對應的SNP位點，根據峰的顏色可得知摻入的鹼基種類，從而確定該樣本的基因型，對於PCR產物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。

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MassARRAY分子量陣列技術通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術相結合，實現基因分型檢測，該技術適合大樣本、多位點SNP的基因分型檢測。

質譜技術的主要特點是，先通過PCR擴增目標序列（可高達40重反應），然後加入SNP序列特異延伸引物，在SNP位點上，延伸1個鹼基。激光照射使生物分子發生電離，離子在電場作用下飛過飛行管道，根據到達檢測器的飛行時間不同而被檢測，離子質量越小，就越快到達。

5晶元檢測

晶元檢測是通過DNA晶元與待檢測的序列進行雜交實現SNP分型，適合大樣本、多位點SNP的檢測。待測DNA經熒光染料標記後與已固定好的探針進行雜交，依據鹼基互補配對，存在單個錯配鹼基的序列不能與探針雜交，通過雜交分子之間的洗脫差異性即熒光強弱來檢測SNP位點。該技術的一個不足就是晶元定製的時間比較長且價格昂貴。

6多重PCR_SNP基因分型檢測

多重PCR_SNP基因分型檢測是一種多重PCR和高通量測序相結合的高效SNP檢測技術，可針對所有物種基因組DNA實現對大樣本、多位點SNP的高效檢測。

該技術針對待檢SNP位點設計特異性引物，在單管內實現多重PCR的擴增。多重PCR的前兩個階段完成對目標區域的擴增富集，第三階段時引物端會連接上測序接頭和barcode，實現對不同樣本的區分。文庫構建好之後應用Illumina主流測序平台實現對擴增子的高通量測序，最後通過生物信息學分析SNP變異檢測結果。

別看獨自擁有這麼多服務，本SNP可不是隨便用的。根據這些技術的優缺點，我是物盡其用，當我位點數少的時候呢，選擇KASP、TaqMan、SNaPshot為我服務，其中我最喜歡的還是KASP，效率高、周期短，名字也洋氣啊；當位點數多的時候呢，質譜、晶元、多重PCR_SNP基因分型檢測為我服務，其中我最喜歡多重PCR_SNP基因分型檢測，周期短、成本低、效果好，名字這麼長，一看就很踏實、穩重，妥妥的，沒毛病！

好嘞，炫耀完畢，不嘮了，本SNP該去工作了，拜。。。