研究人員發布表觀基因組資料庫MethBank 3.0

中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組資料庫MethBank 3.0，並將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在 Nucleic Acids Research 上。

Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化數據。作為表觀修飾的重要組成部分，DNA甲基化在人類疾病與衰老、動物胚胎髮育以及植物生長發育過程都起重要作用。MethBank 3.0提供了4577個健康人外周血樣本的450K晶元數據，並編審成34個不同年齡組的參比甲基化組（consensus reference methylomes，CRMs）；提供不同年齡組健康人基因組胞嘧啶位點甲基化水平的分布範圍，整合5個重要經濟作物（水稻、大豆、木薯、菜豆和番茄）不同發育階段多個組織的336個單鹼基精度甲基化組（single-base resolution methylomes，STMs）和兩個模式動物（斑馬魚和小鼠）的配子與早期胚胎髮育的18個單鹼基精度甲基化組。相比於之前版本，MethBank 3.0有更加詳細、系統的注釋與分析，識別了692個年齡相關甲基化位點、2371個與年齡無關的位點、304886個差異甲基化啟動子（DMPs）、53680個年齡特異的甲基化位點（age-specific DMCs）、1716個年齡特異的甲基化區域（age-specific DMRs）以及693825個甲基化的CpG島。此外，Methbank 3.0提供兩個分析工具（Age Predictor和IDMP）分別用於預測人的甲基化年齡和識別差異甲基化啟動子。

Methbank 3.0配備友好的瀏覽、查詢與可視化功能，用戶可通過基因ID/ymbol、基因組位置等檢索甲基化信息，瀏覽指定物種差異甲基化啟動子或高甲基化CpG島，通過ftp下載所有相關注釋數據與分析結果。

研究工作得到了中科院戰略性先導科技專項、中科院國際合作計劃、國家科技攻關計劃、國家高技術研究發展計劃（863計劃）、中科院百人計劃等的資助。

來源：中國科學院北京基因組研究所

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