康乾盛世西域的百年之亂：女真與西蒙古準噶爾之戰

為了擴大實力，為了控制天山以南的回部民眾，噶爾丹採取扶持白山派，壓制黑山派。這個白山黑山表面上先是舉白旗黑旗，後來成為帽子顏色的區別，實際上都屬於西域久遠的回教蘇菲派。由來的說法也有好幾種，其中一種即為取得蒙古人支持的為白山派。其首領也都屬於所謂喀什噶爾的和卓家族，祖上在中亞各族中有一定聲望，但由於教義爭端慢慢變為政治鬥爭，幾百年下來，也從中亞地區的爭奪發展回新疆。黑山派在察合台後王伊思瑪業勒支持下，把白山派首領和卓伊達雅圖勒拉（即阿帕克和卓）驅逐出喀什噶爾，和卓伊達雅圖勒拉無處存身，在中亞一帶浪跡近10年，由克什米爾進入西藏，找到了五世達賴，不久，和卓伊達雅圖勒拉拿著達賴五世的信件投身噶爾丹麾下。達賴五世給噶爾丹的信中寫道：「你親自領兵，收復暴君統治的那些城池，讓阿帕克和卓登上王位，然後你再返回原地」。噶爾丹正好藉機一舉帶兵進入阿克蘇、烏什和喀什噶爾。葉爾羌汗國的國王伊斯瑪伊勒汗的兒子巴巴克蘇勒坦抵抗，兵敗身死。噶爾丹繼續進兵又奪占葉爾羌，俘伊斯瑪伊勒汗，威震西域，自此以後，準噶爾貴族統治南疆達80餘年之久。這一年是康熙十九年。 當然，後來就有很多國內研究者說明準噶爾部對回部居民十分殘暴，強行改變他們的信仰，盤剝的很厲害，為後來乾隆一統新疆奠定輿論。事實上，回部地區一直受和卓家族伯克制度管轄，準噶爾部在當地有強行修建寺廟的，也有一些強迫民眾改信喇嘛教的，這一點甚至不如當年蒙古初期，成吉思汗扎撒對信仰問題是寬容的，後面四大汗國的許多君主都不少回教化，不如早期蒙古政策寬容。而準噶爾部遵照的是1640年的《衛拉特蒙古法典》，堅決擁護藏傳佛教的地位，因此，在回部地區造成了不好影響，這是事實，所以新疆才會出現有哈密回王這樣擁戴清朝的回部貴族。但大多數時候，是和卓家族在控制，當然，和卓家族是站在準噶爾部一邊，即使到了乾隆時期，和卓家族也因為是準噶爾部同盟，加上乾隆對準噶爾部族人採取錯誤的暴力殺戮手段，根本沒有和平解決的可能，因此繼續對抗清朝，一直到兆惠等用武力征服南疆回部。當然，在歷史上畢竟西域各部厭倦了長年兵禍，對統一是嚮往的，甚至中亞各邦都承認滿清的統治，一直到後期清朝衰弱，浩罕國再起爭端。

在治理地方上，準噶爾部還是比較粗糙。主要還是軍事方面進行整肅，採取一系列保證兵源，改善裝備的措施，史載：「作小連環鎖甲，輕便如衣。射可穿，則殺工匠，又使回教火器，教戰，先鳥炮，次射，次擊刺。令甲士持鳥炮短槍，腰弓矢佩刀。駱駝馱大炮，出師則三分國中人相更番，遠近聞之咸懾服」。大大增強了戰鬥力。另外還採取一些發展生產的措施，噶爾丹「乃招徠歸附，禮謀臣，相土宜，課耕牧，修明法令，信賞罰，治戰攻器械」，當然，另一方面是準噶爾部在南疆的統治有明顯的壓迫性質，甚至要南疆各部都貢獻「質子」，自然難以真正獲取民心。對此，清代人蘇爾德在《新疆回部志》卷四作過評述：「回部舊受額勒特統轄，各項賦稅雖有定額，但其數頗重，回人艱於定納，凡販運各貨以及金銀布帛，多於額外越境抽收。又派在喀什噶爾、葉爾羌、阿克蘇、和闐四大城辦事之額勒特等將回人之銀錢、糧馬、婦女，鳥槍等項，恣意取擄回，回眾不堪其擾，如居水火，故多奔走逃避，未獲寧處。」不過，畢竟準噶爾部是需要強大的資金、糧食和兵器來持續戰爭，很少直接管理回部地區，扶持的白山派和卓在當地起得作用更明顯，就是準噶爾部消亡後，和卓家族在南疆也讓各部民眾生活困難，清朝統治也不是真正就讓各族過上了太平盛世，因此，南疆各族的生活情況需要一分為二看待，歷史真相是需要克服很多困難去尋找，更不能為了肯定一方就貶低另一方。

康熙二十年（1681年）之後，噶爾丹又連續向西擴張。1682年至1683年，噶爾丹率騎進攻哈薩克的頭克汗（又稱梯亞甫迦汗，1680-1718年任部落首領，其父楊吉爾汗曾於1643年大敗巴圖爾琿台吉），頭克汗用計誘噶爾丹軍人城，待雪夜哈薩克援軍一到，內外夾擊，準噶爾兵猝不及防，馬匹陷入雪坑，死傷過半。噶爾丹雖「喪師返國，未嘗挫銳氣，益徵兵訓練如初」，並遣使警擊，「汝不來降，則自今以往，歲用兵，夏蹂汝耕，秋燒汝稼，今我年未四十，迨至於發白齒落而後止」。次年，噶爾丹再發兵，攻下塔什干、賽里木等城，擒獲頭克汗之子作為人質，押往西藏。之後，準噶爾兵鋒直抵黑海沿岸的諾蓋人部族聚居區。1683-1685年噶爾丹與費爾干納的布魯特人、烏茲別克人進行戰爭。1683年秋在遠征布魯特人時，其部隊到了帕米爾的穆爾加布河，甚至遠徵到了薩雷闊里山。這個時候要注意的是，噶爾丹在西征戰役中扶持了策妄阿拉布坦等子侄輩，他們都成為獨當一面的將領，不久，準噶爾部佔領了費爾干納地區。