在德國學習生物信息學

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作者 @宸宏 國內top5大學生物信息學本科，德國薩爾大學生物信息學碩士，海德堡大學/德國國家癌症研究中心(DKFZ)博士在讀。曾在中國科學院計算生物研究所、德國馬克斯普朗克研究中心(MPG)和德國多模式計算和交互設計精英集群(MMCI)等頂尖科研院所實習。了解各專業不同學位德國留學DIY流程。關鍵詞：生物信息學，計算機，大數據分析， 德國留學申請

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很高興能跟大家分享在德國學習生物信息學的經驗，希望能夠幫助到大家。如果你對從事生物醫療方面的數據分析感興趣，那麼不妨考慮一下，到德國加入本科、碩士或者博士方面的學習。以下是一些常見問題的回答，還有我自己在德國留學的經驗。

什麼是生物信息學？

生物信息學簡單來說就是用數學和計算機方法解決生物學問題，是一門融匯了生物學、數學、計算機科學和工程學的交叉學科。生物信息學的內容紛繁複雜，概括一下，主要解決兩類問題，一類是通過數據分析來驗證生物學假設，發展生物學理論；一類是為生物數據分析開發方法和工具。在很多項目中，我們都會應用到生物信息學技術，例如：通過測序數據分析病人情況，預測某些蛋白質的空間結構，比較不同物種之間的親緣關係，發現新的致病基因，設計新藥物並檢驗療效，收集和存儲生物數據等等。隨著信息科學，例如機器學習、計算機視覺和資料庫科學的普及，生物信息學又有了更多的內涵和更高大上的技術。

在德國學習生物信息學需要什麼樣的條件？

準備讀本科：如果你對解決生物學問題非常感興趣，有信心學好數學或計算機，那麼你就可以嘗試加入生物信息學的大家庭。其他就是語言、aps和國內本科1-3學期的學歷了。

準備讀碩士：生信本科當然沒有問題。擁有生物學、計算機科學、數學和物理學等專業的本科學歷，也可以申請德國大學的生物信息碩士。其他就是語言和aps了。

準備讀博士：未來的老闆已經寫在招聘網頁上了……

很多生物本科生可能會厭倦實驗室里的生活，但是又不想離開生物學的圈子，那麼轉行生物信息學可能是一條很好的出路。而對於計算機、數學或物理學科的學生來說，轉行生物信息也並不難。

生物信息學的一般知識和技能包括：分子生物學知識、統計學知識、linux操作、編程(python，R，C等)和常見生物信息學軟體的使用等。根據不同的興趣和方向，所需要的知識結構也不盡相同。

生物信息學將來的職業道路如何？

作為一名生物信息學專業的學生，我對生物信息學的就業前景還是很樂觀的。作為交叉學科，生物信息學融匯了很多不同的技能和方向，就像玩rpg遊戲一樣，選擇自己升級加點的路線，對將來找工作的方向也有影響。在就業市場上，生物信息學畢業生的工作選擇面非常廣，不僅可以繼續科研路線，留在學校或研究所中；也可以進軍工業界，在生物公司和製藥公司中找到不錯的職位。此外，諮詢業、軟體業、互聯網行業和數據分析業的就業機會也不少。讀博對於生信學生來說是很不錯的道路，德國博士頭銜不僅僅是一個閃光的title，也是很多高級職位的必須條件。隨著測序成本降低以及國家政策的扶持，生物信息學在未來應該會有更大的市場和更多的崗位。

為什麼要在德國學習？

來到德國學習，主要好處有以下幾點：1.自然環境和社會秩序良好，生活成本相對較低，留學生每年自保金8000-9000歐即可維持不錯的生活水準；絕大多數高校本科碩士免學費；讀博士有收入，無需家中開銷，甚至可略有盈餘。2.教育和科研水平高，德國文憑含金量也相對較高。3.畢業後若留德工作，薪水非常不錯；若回國則可能享受海歸待遇，對創業、就業和落戶都有幫助；若以德國作為跳板前往其他歐美國家也較為容易。4.德國的歷史、文化、工業、體育等方面都十分出眾，留學德國是許多德粉的圓夢之旅……

生物信息學如何擇校和申請？

根據今年DAAD的資料，開設生物信息碩士課程的大學包括：美因茨大學、慕尼黑大學、薩爾布呂肯大學、柏林自由大學、漢堡大學、哈勒大學、波茨坦大學、耶拿大學、法蘭克福大學、萊比錫大學、比勒菲爾德大學、吉森大學、蒂賓根大學和維爾道大學等。其中絕大多數學校都同時開設本科課程。每個學校的研究側重點和學制各有不同，申請之前建議大家仔細閱讀一下該校的課程設置和教學計劃，結合自身規劃選擇學校。在絕大多數學校里，生物信息學(也有的學校叫計算生物學或者其他名字的)專業一般都不是數量限制專業(Numerus Clausus)，因此申請的門檻也不是很高，慕尼黑、自由大學之類的學校也不是很難申請，可以多嘗試。申請流程很其他專業並無區別，在此不再贅述。

至於申請博士，這兩年德國各高等院校招收生信博士的數量相當可觀，很多濕實驗室也開始招收具有生物信息學背景的學生。博士途徑多種多樣，可以申請國際博士生項目獲得獎學金，也可以申請傳統的師徒制博士生並簽訂工作合同，或者在國內申請國家獎學金然後赴德讀博。德國博士學習時間一般是三到五年。申請博士的經驗將來我會再寫一篇和大家分享。

我的經歷和見聞

我在國內本科就是學生物信息的，可惜當時不懂學習的重要性，畢業成績一般，沒有發過文章，生信技能掌握得也不多，拿得出手的也就perl編程(然而感覺現在用perl的人現在越來越少了……)。畢業以後申請了幾所德國大學的生物信息學碩士，拿到了三所大學的錄取通知書，包括柏林自由大學、慕尼黑大學和薩爾大學。考慮到前兩所學校雖然名氣更大，但是德語授課，而我當時還沒有過DSH2或德福，只能拿到帶條件的Zulassung；而薩爾大學是英語授課，並且與馬克思-普朗克研究所關聯緊密，還有Thomas Lengauer教授坐鎮，因此最後選擇了去薩爾大學讀碩士。（其實薩爾大學當時還開設帶獎學金的碩博連讀項目，然而當時忘了報名……）

薩爾大學的生物信息碩士畢業要求是修滿足夠的計算機類、生信類和生物類課程的學分，完成實習和thesis。根據目前的學制，整個碩士階段沒有必修課，你可以根據自己的興趣和目標在以上三個框架之下選課；沒有必修課意味著什麼大家應該懂。 生信碩士和計算機學生一起上計算機課程，這些課程多數是馬普所的一線項目負責人和教授開設，其水平不言而喻。這裡的生物課程和生信課程相較之下光芒稍顯黯淡，不過課程設置相比於我的國內母校還是要合理一些。

整個碩士項目計劃畢業時間是兩年，部分學生可能會多花一到兩個學期畢業。整個碩士階段沒有發表文章的要求，學分夠了做完畢設就畢業。但是如果你想發文章也有很多機會。碩士學生可以去馬普所的信息學研究所、軟體研究所和另一個德國著名研究機構Fraunhofer研究中心實習，也可以去薩爾大學生物系的實驗室參加科研項目，如果工作結果出色，很可能獲得發表的機會。此外這些實習工作多數都可以簽研究志願者合同(Hiwi)，獲取一筆實習工資，可以極大地補貼日常開銷。

薩爾大學允許甚至鼓勵碩士生去校外機構做畢業論文，這一點對與學生的未來非常有利，它增加了學生和未來僱主交流的機會。我在修完學分後去了海德堡的德國癌症研究所做了半年的實習和半年的畢業論文，並且在提交論文後通過博士生選拔幸運地成為了該研究所的一名博士生。能拿到offer主要是因為在實習和畢設中付出的努力都得到了導師的認可。將來有空我會寫一篇德國癌症研究所選拔面試的攻略，希望可以幫助到更多有志於投身癌症研究的朋友。

未來寫作計劃：

如何在德國學習計算機科學？

德國國家癌症研究中心（DKFZ）博士面試攻略

如何在德國做一個快樂的留學生

寫在最後：

很高興你能讀到這裡，希望你能從我的文字中有所收穫。我當過學霸也當過學渣，相信我的經歷對多數人都是有參考價值的～無論是有關科研方面的問題，還是其他專業的留德申請和生活方面問題，都歡迎留言交流，更歡迎加入[尖峰時刻]DIY全球留學申請、生活飛躍計劃，獲得為你量身定做的個性化留學DIY服務。

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