發三分文章，這個期刊加這個套路就夠了，更有「+」分心得！

07-16

來自專欄小蘆聊科研

想發文章？你不只要有實力，還要有好多小技巧，比如說挑選一個比較好投的期刊。

小編這裡就給大家推薦一個期刊——《Journal of Cellular Biochemistry》。

先看一下逃不開的影響因子，下面是這個雜誌近10年的影響因子變化情況，常年穩定在3分左右，去年掉到了2.959，對於一些需要3分才能畢業的同學不太友好。

不過，它也有它的優勢，不要版面費（一聽這個都覺得超開心），審稿周期適中，大約3-5個月，雜誌編輯和評審專家都比較負責任，一些投過的同學表示：編輯評審認真負責，建議中肯，對自己提升很大。

對3分要求不是特別敏感的小夥伴可以關注一下，並且它的自引率只有3.8%，17年中國人文章占期刊總數26%，投稿命中率48%，還算不錯，明年分數很有可能漲上去。

咱們說完期刊說套路，一般5分以下的文章套路都非常明顯，方便借鑒。小編這就從那個期刊里找了這麼一個簡單好用、方便借鑒的套路給大家「差異miRNA—靶分子—通路—qRT-PCR驗證」，算是完整的一套流程。

由於測序分析和驗證都可以交給專業的科研服務公司，因此，這個套路對於沒有時間做實驗的小夥伴簡直不要太友好。

裡面選擇的是miRNA，其作為biomarker的研究是一種經典思路，大家可以根據自己研究的疾病來借鑒。

只需要確認研究方向，然後取樣交給科研服務公司，接下來就是坐等數據寫文章啦！

下面就以發表在這個期刊的一篇文章為例講講這個套路（給你講個小秘密：這篇文章的實驗有我們公司的參與哦~）

研究思路

作者使用二代測序技術在PCOS（多囊卵巢綜合征）/HA（雄激素過多症）女性患者與正常女性患者卵泡液中找到有顯著差異的263個miRNA(>2-fold up-regulated or <0.5-fold down-regulated, p<0.05)。已有文獻報道其中7種miRNA與PCOS/HA相關。

根據263個miRNA預測到31770個靶基因，對其進行GO功能富集和KEGG pathway分析發現這些靶基因有參與PCOS/HA。

研究結果

1.PCOS與對照組的臨床特徵型

通過分析本研究中PCOS和對照參與者的特徵，我們發現這兩組在年齡，雌二醇（E2）水平，PRL（催乳素）水平，體重指數（BMI）和FSH（卵泡刺激素）水平等方面沒有差異。

然而，PCOS女性的血清睾酮（T）濃度和黃體生成素（LH）水平顯著升高（p <0.05）。

2.尋找差異表達的miRNA

對PCOS與對照組卵泡液樣本進行miRNA深度測序，共發現6659個差異miRNA，篩選出263個顯著差異的miRNA（>2-fold up-regulated or <0.5-fold down-regulated, p < 0.05)。已有文獻報道其中有6個miRNA（200a-3p、10b-3p, 200b-3p,29c-3p, 99a-3p and 125a-5p)顯著上調，有1個miRNA（miR-105-3p in PCOS）顯著下調。根據263個miRNA做聚類分析和火山圖（如下圖）

圖1 聚類分析與火山圖

3. 驗證差異表達的miRNA型

qRT-PCR結果顯示，上面提到的7個已被報道過的miRNA的表達水平與miRNA測序結果一致，進一步證實了測序結果的可靠性。

圖2 qRT-PCR驗證

4.靶基因的預測與功能分類

根據263個miRNA預測到31770個靶基因，使用GO分析和KEGG pathway分析發現這些靶基因與PCOS中的HA相關， miRNA參與PCOS中的細胞組分（圖3 A）、分子功能（圖3 B）、生物學功能（圖3 C）、細胞組分（圖3 D）的調節

圖3 GO分析和Pathway分析

這篇文章就是典型的「差異miRNA—靶分子—通路—qRT-PCR」做biomarker的套路，基本就是３分上下的水平，想要更高分數也可以在本文的基礎上進階。小編分析比較了其他文獻，給大家總結了這麼幾個進階方法給大家參考。

分數進階心得

1. 在樣本上下功夫，選擇稀缺樣本，增大樣本量，使文章的結論更有信服力。

此文中選擇的卵泡液樣本就比較少見。但是，此文的樣本量只有3個患病加3個正常，可以增大樣本量，表明研究的準確性；也可以挑選兩個（甚至多個）miRNA，研究它們的相互作用。

2. 結合熱點，沒有很深的機制研究也可以發高分。

比如說，選擇外泌體來源的miRNA進行研究。所有的細胞都會分泌外泌體，培養之後分離外泌體就可以，所以外泌體的熱點比較好蹭。

3. 在生物信息分析上下功夫，也可以往更深處進行挖掘。

本文中的生信分析比較基礎，如果可以做更深層次的分析，比如咱們之前講過的高級生信分析系列，分數提高是非常輕鬆的。

4. 進一步研究miRNA的作用機制，使研究更為完整。

文中只進行了靶基因的預測和GO、Pathway分析，接下來其實可以進行靶基因的驗證，進一步探索作用機制，豐富文章的內容。

5. 確認研究的miRNA可以作為biomarker對疾病進行判斷，增加應用價值。

本文中找出了潛在的可作為biomarker的miRNA，但是沒有進一步進行臨床驗證。如果能與傳統臨床手段進行比較一致，那麼文章的重要性就很明顯了。