科學家發現病毒通訊系統,通過化學信息決定是否攻擊宿主
原文以Do you speak virus? Phages caught sending chemical messages為標題
發布在2017年1月18日的《自然》新聞上
原文作者:Ewen Callaway
噬菌體聆聽同類傳達的信息,以決定如何攻擊宿主。
病毒能感知「前輩」留下的化學信號,以決定是殺死宿主,還是僅僅感染它們。
研究者在攻擊芽孢桿菌屬細菌的病毒中發現了這一現象,這是人類首次發現病毒擁有某種類型的通信系統。但研究者表示,許多其它病毒也能通過自身的「分子語言」與同類交流,可能還包括使人類感染疾病的病毒——如果這一點為真的話,科學家或許就找到了一種阻斷病毒攻擊的新方法。
以色列魏茨曼科學研究所的微生物遺傳學家Rotem Sorek領導的團隊發現了這種秘密的病毒通信。他們的研究成果於1月18日發表在《自然》期刊上。
「這篇論文將會成為一個具有轉折性意義的成果,」英國萊斯特大學的微生物學家Martha Clokie表示,她的研究方向是噬菌體(即感染細菌的病毒)。
感染信號Sorek的團隊原本尋找的是枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)向同類警示噬菌體的證據。研究者知道,細菌會通過分泌和感知一系列化學物質來與同類交流。這一現象被稱為群體感應,使細菌得以根據周圍細菌的數量來調整行為。舉例來說,細菌會通過群體感應來決定是否分裂,或何時感染宿主。
但團隊卻驚訝地發現,一種名叫phi3T的芽孢桿菌噬菌體會製造化學物質來影響其它病毒的行為。
名叫噬菌體的病毒會攻擊細菌,並利用宿主來自我繁殖。現在,研究者發現噬菌體也會彼此交流。
Animated Healthcare Ltd./SPL
一些噬菌體能以兩種方式感染細胞。通常,它們會「劫持」宿主細胞,不斷繁殖,直到宿主爆裂死亡。但有些時候,噬菌體會將自己的遺傳物質插入宿主的基因組,然後進入休眠狀態,直到觸發事件將它們重新喚醒,並再次開始繁殖。
新發現的病毒通信系統會改變phi3T的感染方式。
團隊首先將phi3T注入裝有枯草芽孢桿菌的長頸瓶中,發現該病毒通常會殺死細菌。然後,他們過濾了瓶中的內容,去除了細菌和病毒,但保留了小分子蛋白質,並將新一批細菌和噬菌體裝入這個「條件培養基」中。這改變了噬菌體的行為:噬菌體更有可能將基因組插入細菌,殺死宿主的可能性減小了。團隊將他們認為與此有關的神秘分子命名為「arbitrium」(拉丁語中的「決定」一詞),並決心識別這種分子。
「神煩,但也很棒」在經過兩年半的搜索後,Sorek和他的博士生Zohar Erez發現,arbitrium是受感染細菌死亡後滲出的一種短病毒蛋白。當arbitrium水平升高,也就是大量細胞死亡後,噬菌體便不再殺死餘下的細菌,而開始在細菌基因組中休眠。Sorek、Erez及同事還發現了另外兩種衡量arbitrium水平、並影響隨後的感染行為的phi3T蛋白。
「這的確很有道理,」紐西蘭奧塔哥大學的微生物遺傳學家Peter Fineran說,「如果宿主不夠用了,噬菌體就會嘗試限制殺死宿主的行為,靜靜等待宿主數量重新增長。」
Clokie說,這項新的研究工作「神煩,但也很棒」。「我曾想過開展這樣的實驗,看看培養基里是不是有什麼物質。」她認為,其他研究噬菌體的生物學家還會找到更多的病毒通信系統。Sorek的團隊發現了100多種類似arbitrium的不同系統,絕大多數都在其它芽孢桿菌噬菌體的基因組中。「噬菌體以不同的頻率『廣播』,它們的語言彼此不同,只能聽懂自己的語言。」
他甚至還好奇,感染更為複雜的生物體——比如人類——的病毒是不是也能彼此交流。他指出,HIV和皰疹病毒就既能導致活動性感染,也能造成潛伏感染。「如果能找到一種讓病毒完全進入潛伏狀態的分子,那會是一種不錯的藥物。」?
Nature|doi:10.1038/nature.2017.21313
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