染色質免疫共沉澱該怎麼做?這道題我來說下解題思路

簡介

染色質免疫共沉澱技術(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是一種適用於研究蛋白質與生物體細胞中 DNA 相互作用的經典方法,這項技術幫助研究者判斷在細胞核中基因組的某一特定位置會出現何種組蛋白修飾 。

將 ChIP 與第二代測序技術相結合的 ChIP-Seq 技術,能夠高效地在全基因組範圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區段,研究體內轉錄因子和靶基因啟動子區域直接相互作用的方法,對於調控蛋白在基因組上的結合靶點篩選、差異化表觀遺傳變異的原理揭示提供了重要的解決思路。

技術原理

在活細胞狀態下固定蛋白質-DNA 複合物,並將其隨機切斷為一定長度範圍內的染色質小片段,然後通過免疫學方法沉澱此複合體,特異性地富集目的蛋白結合的 DNA 片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質與 DNA 相互作用的信息。

適用研究

1. 篩選調控蛋白在基因組上的結合靶點:針對轉錄因子、DNA/RNA 聚合酶、轉錄複合物等調控因子蛋白進行特異性的富集,分離純化與之結合的靶 DNA 片段並測序,分析篩選到準確有效的靶位點、靶基因數據;

2. 揭示差異化表觀遺傳變異的原理:通過對不同表型組織內組蛋白、轉錄因子蛋白及其他結合蛋白進行染色質免疫共沉澱測序並定量分析靶基因表達調控水平或針對同種組蛋白進行甲基化、磷酸化、泛素化修飾所導致的結合位點變異進行分析,即可準確揭示差異化表觀變異原理;

3. 研究表觀遺傳變異疾病:藉助染色質免疫共沉澱測序技術結合生物信息分析揭示由蛋白與 DNA 相互作用變異而引起的疾病的原理,明確表觀遺傳修飾在癌症等表觀遺傳變異疾病的發生髮展過程中的具體作用機制。

實驗步驟

— 但是—

光了解流程還不夠,還要摸索試劑的濃度,摸索實驗過程細節。但是好不容易得到的樣本經不起浪費,寶貴的時間還要用來思考更重要的實驗方案,來吧,外包吧!

服務及產品推薦

染色質免疫共沉澱技術

價格:8 000~13 000

點此申請

技術優勢

1. 完善的實驗平台:全進口的儀器試劑,高標準甲醇交聯、Bioruptor 超聲打斷;

2. 專業的實驗流程:特有的 ChIP 優化流程,個性化實驗方案,IP 效率高,高成功率(高於 95%);

3. 豐富的實驗經驗:專業的 ChIP 服務部門,實驗人員從事 ChIP 實驗長達 5 年以上,上千次成功 ChIP 實驗經驗,針對不同動植物組織有不同的前處理方式。

交付結果

染色質片段化結果、富集產物濃度、Input 率或 Fold Enrichment、測序 Fasta.q 文件、分析報告

經典案例

(向上滑動查看更多)

在Developmental Cell上發表的《Convergent Transcriptional Programs Regulate cAMPLevels in C. elegans GABAergic Motor Neurons》通過ChIP-seq研究了秀麗線蟲的兩個高度保守轉錄因子UNC-30和UNC-55調控的靶基因,這是首次在多細胞動物中原位表達水平轉錄因子的ChIP-seq實驗。

研究揭示UNC-30和UNC-55這兩個轉錄因子各自均調控近2 000多個基因的表達,而且非常有意思的是,它們共同調控1 300多個編碼和非編碼基因的表達。這些靶基因在多個神經元發育和可塑性具有重要調控作用的信號通路中行使功能。

ChIP-qPCR 檢測

促銷價:180 原價:300

點此申請

活動說明

1. 此費用僅針對ChIP純化富集後DNA-片段的檢測,其它檢測費用另計且不做促銷。

2. ChIP 和QPCR 檢測均委託我司才可享受此促銷價,單項的 QPCR 檢測不參加此活動。

技術優勢

1. 全基因覆蓋:ChIP-Seq可在全基因組範圍對蛋白結合位點進行篩選與鑒定

2. 高靈敏度:每個樣本可獲得數百萬條的序列標籤,可發現研究基因組上稀有的蛋白結合位點

3. 高精確率:可獲得高水平的信噪比數據,準確區分真實事件與噪音,精確定位蛋白結合位點

4. 高性價比:僅需較少的數據量即可鑒定全基因組範圍內的結合位點

交付結果

標準實驗報告、詳細步驟、 測序結果、QPCR 驗證結果、數據分析參考

化學發光成像系統

包郵免費試用

點此申請

現在,你不用出一分錢便可感受這套便捷與高效的系統。

一款無需暗室曝光,可直接進行 ECL 成像的發光成像系統,獲得實驗結果,也適用於核酸檢測。此系統靈敏度可媲美膠片,成像速度更快,且線性範圍更寬。

搭載的智能匹配系統可使用戶在拍攝不同樣品時自動匹配拍攝參數,不再需要人工干預。

配以上海勤翔自主研發的拍攝軟體,使用戶無需揣摩曝光時間,實現「一鍵成像」。可選配多種熒光及濾鏡增加了其運用範圍。

應用範圍

你知道么

你可能知道「生物學霸」是丁香園旗下科研資訊平台,但你知道「生物學霸」隸屬於丁香通么?

丁香通是誰?

丁香通依託於丁香園 550 多萬會員,以及 3 萬多家註冊企業,致力於為臨床和科研用戶提供實驗室用品、課題服務等諮詢和採購交流信息平台。也為生物醫藥企業提供產品展示、品牌建設、招商代理、大數據分析、行業調研以及市場活動運營外包等營銷和諮詢服務。


推薦閱讀:

減肥、降糖,2型糖友應該怎麼做?
預防老年銀屑病該怎麼做
想俘獲男人的心你該怎麼做?》
男女的第一次,到底該怎麼做
家庭銀行理財規劃該怎麼做?如何分配理財資金

TAG:免疫 | 染色 | 該怎麼做 | 怎麼 | 思路 | 解題思路 | 染色質 |