高分文章和面上項目最常見的五種模式,你都知道嗎?
一、上下游;
二、雙頭蛇;
三、成環路;
四、做對話;
五、調平衡。
一、上下游
這個模式是大家見的最多的,這個模式就是以主要創新點C為中心,分別揭示上游的條件A和因素B對A的調控,以及C對靶基因D和通路E的調節。以大家最為熟悉的microRNA為例,以前多數研究的主題是:新microRNA C通過靶基因D調控E通路在XXX疾病中的功能和機制,主要是做下游的C-D-E;現在大家已經慢慢把研究重點放到上游上來,即條件A與因素B,即在某個條件(比如缺氧)下因素B(比如轉錄因子或者lncRNA)調節新microRNA C的表達。一般來說,根據研究順序,一般有三種闡述模式,我們在文章裡面都能看到:
(1)先做C,再分別往上游和下游展開;
(2)先做E和D,一直往上游做,先確定D被C調控,再做C被B在A條件下調控;
(3)先聯繫條件A和E通路,再補齊B-C-D。
二、雙頭蛇
這個模式用具俗語說就是:花開兩朵,各表一枝。即:創新點A分別通過兩種方式發揮功能,這裡的不同方式可以是兩個靶基因和通路,也可以是兩個表型,也可以是兩種細胞,甚至是組合起來,通過不同的通路影響不同細胞的不同表型,但是最終影響的疾病特徵是一個,比如某個microRNA不僅可以通過調控snail基因表達影響腫瘤細胞EMT,還可以通過調控微環境中CAF細胞分泌VEGF影響血管生成,不過最終影響的都是腫瘤的轉移過程。當然,還有一個雙頭蛇模式的鏡像,即創新點分子A被不同的兩種因素所調控,這兩種因素都可以獨立調控因素A。
三、成環路
這個模式就更好理解了,就是俗話說的「冤冤相報何時了」,信號從分子A通過一系列信號B-C-D……X再回到A,形成所謂的「反饋迴路」或者環路,如果是正反饋迴路,信號就在傳遞過程中被不斷放大。還是以microRNA為例,比如microRNA A通過靶基因B等調控某條通路中X的表達或者活化,而該通路中的X則如何轉錄調控microRNA A,從而形成microRNA A-靶基因B……-轉錄因子X-microRNA A的反饋迴路。
這個模式是模式一的變種,只是上游和下游形成了重疊和迴路,同時也與下面的模式四在某種程度上類似。
四、做對話
這個模式的對話(cross-talk)可以發生在細胞之間,也可以發生在分子和通路之間。即:細胞A通過某種方式影響細胞B,而細胞B以某種(類似或者不同的)方式影響A;也可能出現A-B-C三角戀的關係;還會出現單戀的關係,即細胞A隻影響B,而B不影響A(可能未知或者其它原因),最終影響疾病的某個過程。當然,由於涉及到三個因素的對話過於複雜,一般比較常見的是兩種細胞或者分子、通路之間的對話。如果只涉及到兩類細胞或者分子,模式上就可以歸類為模式三了。舉例,比如腫瘤微環境中的細胞與腫瘤細胞之間的對話(A-B-A),以及間充質幹細胞治療中與靶細胞的對話(A-B)。
五、調平衡
生命在於運動,生命在於靜止,生命在於平衡。
這裡的平衡包含的因素太多了,病理與生理的平衡,如氧化-抗氧化的平衡,分子表達的平衡,免疫細胞的平衡等等。在科研裡面,我們可以看到由於平衡被破壞,比如ROS產生導致的氧化應激,由內外因素導致的基因可變剪接產物變化導致原先的抑癌基因產物變為癌基因產物,Th17與Treg的平衡等等。
五個模式的基本情況就介紹到這裡,大家有沒有從中發現你喜歡的電影或者故事的影子?
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