1987年4月3日，封閉1113年的法門寺地宮重新面世，出土了世上僅存的佛指舍利和唐朝七位皇帝供奉的數千件皇室絕世珍寶，被視為20世紀考古及佛教文化的重大發現。為了保護、研究、陳列這批國寶重器，法門寺博物館隨之興建，並於1988年11月9日建成開放。20多年來，法門寺博物館從單純的文物展示向歷史、文化、佛教等多學科研究發展，已經成為全國知名、走向世界的代表陝西乃至中國的文化符號。
法門寺博物館就在法門寺左側，又名法門寺珍寶館，為仿唐建築，建築面積13768平方米，展覽面積3600平方米。館內主體建築——珍寶閣，是仿照地宮出土的唐代鎏金銅浮屠的式樣建造，高大宏偉，別具一格，與寺院真身寶塔相輝映。
目前，該博物館建有法門寺歷史文化、佛教文化、大唐珍寶、唐密曼荼羅文化、唐代茶文化及法門寺精品文物特展等六大基本陳列。現有文物藏品兩千餘件，其中國家一級文物71件，國家二級文物37件。2000年被評為首屆全國旅遊4A級景點。
先來說說四枚舍利。法門寺唐代地宮內供奉有四枚佛指舍利，現在按發現的先後順序分別稱為第一枚、第二枚、第三枚和第四枚。其中第三枚是釋迦牟尼的真身指骨舍利，又稱靈骨，另三枚是唐代所做的複製品，又稱影骨，四枚舍利在佛教徒心目中是同樣的神聖。它們的關係正如原中國佛教協會會長趙朴初所說：「影骨非一亦非異，了如一月映三江。」出土時，四枚舍利被分別安置在地宮不同位置的不同器皿中。
第一枚舍利(影骨)為玉質，面世於1987年5月5日凌晨1時，為陰曆四月初八，即佛祖釋迦牟尼2552年的誕辰日。是感應還是巧合?真是令人不可思議。這枚舍利安置在唐懿宗所賜、用紅錦袋盛裝的八重寶函內，八重寶函是整個地宮最重要的供奉物，安置在地宮北壁正中位置。
八重寶函依次是：第一重——寶珠頂單檐四門純金塔。 第二重——金筐寶鈿珍珠裝珷玞石寶函。 第三重——金筐寶鈿珍珠裝盝（lù）頂純金寶函。第四重——六臂如意輪觀音曼荼羅盝頂純金寶函。第五重——鎏金如來坐佛說法盝頂銀寶函。第六重——素麵盝頂銀寶函。第七重——鎏金四天王盝頂銀寶函。第八重——銀棱盝頂檀香木寶函。下圖是第七重——鎏金四天王盝頂銀寶函。
最外層（第八重）上面，雕鏤窮奇，描金加彩，雕刻有釋迦牟尼說法圖、極樂世界、禮佛圖等極為莊嚴肅穆壯觀的畫面。第七重有鎏金四天王護衛圖案，頤丰姿壯，生動威武。第六重為素麵盝頂，十分雅緻。第五重為銀寶函，是鎏金如來說法，生動逼真。第四重是盝頂純金寶函，頂部與寶函四周，均以金框寶鈿珠裝飾，頂端四面有八簇寶花，中心為一大簇寶花，四周每面有七片瓣花，圍積成一朵大花。三重疊羅，清凈無染。第一重為最里一重，是一座純黃金塔，四面塔門暢朗，金簡瓦蓋頂，頂部有金質蓮花朵，捧托金珠頂，塔座是純金方台，每部位都有花紋綢縷，維妙維肖，華貴莊嚴。塔座上有一小銀柱，僅11毫米高，盤為細頸鼓腰狀，喇叭口徑處雕12朵如意雲頭，鼓腰上二平行線連為四組三鈷紋桿狀十字團花，襯以珍珠紋，腰底為蓮瓣形，銀柱托底也呈八瓣蓮花狀。間以三鈷紋，柱底還有一墨書小字——「南」，聖物佛指舍利就套在這根小銀柱上。八重寶函出土時，外用一個大紅錦袋包裹著，八重寶函層層相套，鎖鑰俱全。但由於第八重是檀香木寶函，出土時已朽壞，因此，現在只能看到七重寶函。寶函上文化內涵豐富，人物眾多、紋飾華麗、工藝精湛。其上整刻有豐富的密教壇場、造像等，莊嚴肅穆，是研究唐代佛教及密宗曼荼羅的重要資料。
第二枚佛指舍利也裝在一套寶函內，原置於地宮中室，由外及里依次為漢白玉靈帳、盝頂鐵函、鎏金雙鳳紋銀棺。1987年5月8日22時20分，考古工作者啟開珍藏於地宮漢白玉靈帳中的盝頂鐵函，鐵函上鎖著大鐵鎖，上面銹跡斑斑。原來開啟八重寶函，是完全按照碑文的記載來進行的。但是，這隻奇異的大鐵函，碑文卻沒有任何記載。為了穩妥起見，在兩日前的一個夜晚，在扶風縣醫院的X光機下對它進行了透視，只發現其中有異物，但由於鐵函鏽蝕嚴重，專家們反覆「會診」，也難確定。
啟開厚厚的函蓋，鐵函內有一個木盒，已經腐爛，被紅黃二色泥土緊緊固定於函中，盒下為糊狀物，檢驗不清。啟開木盒，盒內是彩絹，整整9層，層層花色各異。當取開最後一層彩絹時，發現鎏金銀棺。銀棺狀如棺木，前端雕五彩花冠一頂，中間兩隻拖著長長尾巴的鳳鳥，正在並頭齊飛，後端飾雲頭紋。在銀棺前端中間開著兩扇精緻的小門，掛一把小巧的金鎖，左右兩面門扇上各鑲三排9顆小金釘，門扇上各雕一執幡童子，童子頭上有彩雲數朵。銀棺後檔上雕一對披髮金毛獅，銀棺左右兩側棺板上，各雕一位守衛銀棺的金剛力士，左執劍、右執斧。整個小銀棺置於一座雕花的金棺床上。棺床前後分別有五座壼門（門形似月），左右兩側是雕花簾帷。第二枚舍利就置於鎏金銀棺內，專家們將其命名為「特級二號」。第二枚佛指舍利的形狀、大小、色澤與第一枚基本相似，為玉質，外表是不規則的多面體，上有人為的三條紋理。這枚舍利於1987年5月9日凌晨2時發現。
第三枚佛指舍利是在地宮後室北壁秘龕內發現的。舍利裝在一隻鐵函內，發現時鐵函已銹跡斑斑的，打開鐵函，裡面是一枚45尊造像盝頂銀函，上面放著兩枚碩大的水晶隨球，還有二枚雕花白玉指環、二枚雕花金戒指、一串寶珠、數條繡花綢絹。45尊造像盝頂銀函為正方體，長、寬、高各17厘米，函蓋、函身雕工極為精緻。函身下沿鏨刻「奉為皇帝敬造釋迦牟尼真身寶函」。銀函內放置銀包角檀香木函，函頂、函身均包裹銀雕花包角，以平雕加彩繪手法雕滿各種花卉。上系銀鎖、鑰匙一副。
銀包角檀香木函內為嵌寶石水晶槨子，槨蓋上鑲嵌黃、藍寶石各一枚，體積碩大，眩耀奪目。槨蓋雕觀世音菩薩及寶瓶插花，槨身四面皆雕文殊菩薩坐像及蓮座、花鳥。
水晶槨子內是壼門座玉棺，玉棺內，安奉著一枚舍利。發現這枚舍利時，是1987年5月10日早8時，根據出土的先後順序，專家們將其命名為「特級三號」。
第三枚佛指舍利為骨質的管狀物，外壁為不規則的六面體，上有自然裂紋，呈灰白色。內壁有六道溝槽，呈暗黃色，高3.7厘米。這枚舍利的形狀與地宮內《志文碑》記載的「長一寸二分，上齊下折，高下不等，三面俱平……上下俱通，兩角有紋，紋並不徹」完全相符。這枚舍利經專家鑒定和史料佐證，就是佛教徒苦苦尋找了2000多年的佛祖釋迦牟尼的真身指骨舍利，是當今世界上獨一無二、佛教界至高無上的聖物。這是安奉釋迦牟尼佛真身指骨舍利的白玉棺，有6.5厘米長，棺體小巧，形狀很像沿用到今天的木棺，通體以白玉琢磨而成，呈乳白色，並泛淡青色，玉質細膩柔和，稜角分明，工藝非常精緻。
第四枚佛指舍利是1987年5月12日在一尊阿育王塔中發現的，為骨質的管狀物，高3.7厘米，內孔方闊，外形為不規則六面體，灰褐色，其中三面各有一道人為的溝槽，這枚舍利原供奉在地宮前室的三重寶函內。阿育王塔，全稱漢白玉浮雕彩繪阿育王塔，體高78厘米，由塔剎、塔蓋、塔身、塔座四部分組成。銅鑄塔剎，葫蘆狀，安置於蓋心。塔蓋為九層稜台，由上而下逐漸變大，每邊刻一圈如意雲頭二方連續圖案。塔身為四面，四角有立柱。每面中心設門，門上有四排乳釘，各24枚，門設司前，有鎖。每個門扇上各有一尊菩薩。塔座為須彌座，座的台緣均刻流雲紋。
塔內放著一座寶剎單檐銅塔。銅塔為模鑄成型，平面呈方形，分作塔基、塔身、塔剎三部分。塔基為須彌座，其外有三層漸收的護欄，每面護欄正中有弧形踏步。塔身單層，四面各開一門，正面門外左、右各列一力士，門兩側為直欞窗，門額以上鋪作人字形斗拱。頂為單層四角攢尖形，每面鑄出瓦壠，角壠起翹。塔剎高聳，剎底為須彌座，其上6個相輪由下往上依次漸小，相輪以上有寶蓋、圓光、仰月及寶珠，氣象十分莊嚴。塔內盛放銀棺一枚。棺前檔板上刻著兩位坐佛弟子，兩側壁各鏨出兩隻迦陵頻迦神鳥。棺體下有兩層台座，上層台座四周鏨出一圈仰蓮瓣，下層四周鏤空成壼門。當這口銀棺的棺蓋被啟開後，又一枚佛指舍利出現了，於是被命名為「特級四號」。
這個就是鎏金迦陵頻迦鳥紋銀棺，原置於鎏金銅浮屠內，用外羅里絹的絲綢夾袱包裹。棺體兩側壁各鏨出兩隻迦陵頻迦鳥。迦陵頻迦鳥本是一種能發出妙音的鳥，又譯作美音鳥，或妙聲，按佛教經義：「此鳥發聲微妙，勝於余鳥。聽者無厭，喻大行大度眾生。」傳說釋迦牟尼在傳教時，逢供養日，迦陵頻迦鳥來做樂舞。在佛經中迦陵頻迦鳥演變為擬人之鳥，是吉祥的化身。
說完四枚舍利，下面來說說法門寺金銀器。法門寺地宮出土晚唐金銀器121件(組)，其中唐懿宗、唐僖宗父子供養的金銀器就達l000多件。這批器物器形雍容華貴，紋飾精美富麗，代表了當時金銀器製作工藝的最高水平，凝聚著唐代工藝大師們的高超智慧和心血，是研究唐代歷史文化和佛教文化的寶貴資料。這件文物叫迎真身銀金花雙輪十二環錫杖。錫杖為比丘十八物之一，即比丘行路時應攜帶之具，用以驅趕蟲蛇，或乞食時振動有聲，使人聞知。後世則為法器之一。其用法極為嚴格，如見佛像時不得使杖頭有聲，不得以杖指人，或畫地作字。
錫杖是佛教最具權威的法器，有股、環多少之分。《錫杖經》云：迦葉佛為二股十二環，地藏菩薩為二股六環，釋迦佛為四股十二環。這枚迎真身銀金花四股十二環錫杖，出土於地宮後室，為唐懿宗所供奉。四股十二環代表佛教基本教義中的「四諦」和「十二因緣」，應屬釋迦佛所持，是等級最高的。這枚錫杖在研究密教法器及李唐王朝與密教的關係方面具有重要意義。從杖股上的簍文可知，這枚大錫杖是唐咸通十四年（873年）懿宗皇帝為迎送佛指舍利敕令工匠專門製作的。整體造型精美絕倫，古今罕見，比現藏日本正倉院被稱為錫杖之王的白銅頭錫杖等級更高，形制更為宏偉，工藝更顯精巧，堪稱佛門奇寶，是獨一無二的世界錫杖之王。下圖是放大了的「世界錫杖之王」。
下圖是單輪十二環純金錫杖。
下面這兩件文物叫鎏金卧龜蓮花紋五足朵帶銅熏爐和銀風爐，是一種熏香器。熏香爐是我國古代生活中常見的美化和衛生措施，到了唐代，無論是薦天祭地、供養釋迦，還是禮敬老子、尊宗禮祖，都要點香熏香。唐代時香爐造型開始趨向多元化，熏香器生產也更為發達，從銅而金銀，且式樣豐繁。法門寺地宮出土的這個熏爐及銀風爐充分說明，古代人同樣有著強烈的審美意識，總是千方百計地追求美好的生活方式，這兩件文物真實地反映了當時佛教焚香的風習。其中，銅熏爐原置於地宮後室，由唐懿宗供養。其形制高大，製作精美，為唐代同類金銀器最宏大的一個，精湛的製造工藝和精美的裝飾圖案令人嘆為觀止。熏爐、爐台成組配套出土，在我國尚屬首次。
這件文物叫鎏金雙蛾團花紋鏤空銀香囊，出土於地宮後室，重547克，是唐僖宗所供奉，也是唐代香囊存世品中迄今發現最大的一枚。香囊囊蓋、囊身各作半球狀，上下對稱，以子母扣相扣合，一側以鉸鏈連接，另一側則以勾環相連。在圓球滾動時，內、外平衡環也隨之轉動而香盂的重心始終不變，便香盂面始終保持平衡狀態。這種平衡裝置，與現代運用於航海、航空上的陀螺儀原理完全相同，這種陀螺儀原理與技術，歐洲十七八世紀才掌握，而我們的祖先，早在8世紀之前，就已熟練地掌握了。
這件文物叫鎏金鴛鴦團花雙耳大銀盆，出土於法門寺唐塔地宮後室，是唐僖宗供佛用品，重6265克。此器澆鑄成形，外飾蓮花。盆底外壁，鏨刻「浙西」二字，說明此盆為唐代浙西道(今江蘇鎮江)所生產。浙西道是唐代後期南方金銀器的製作中心。下圖是迎真身金缽盂和鎏金大銀盤。
這尊造像叫捧真身菩薩，出土於地宮中室漢白玉靈帳之後，整個造型由菩薩、蓮台座上下兩部分組成。捧真身菩薩是公元871年唐懿宗39歲生日時，專為其迎送佛指舍利而鑄造，後由僧人澄依在公元873年迎送佛指舍利時供奉，是地宮內唯一有皇帝名號的文物。該菩薩製作精巧，工藝獨特，裝飾華麗，金碧輝煌，特別是人物圖像造型優美，栩栩如生，堪稱地宮出土文物中的極品，確是唐代皇室所供奉之等級最高的器物。
接下來來看唐代秘色瓷。秘色瓷原產於浙江越窯。宋人趙德鱗曾有記載說：「今之秘色瓷器，世言錢氏有國越州燒迸，為供奉之物，臣庶不得用，故云秘色。」1987年4月12日，考古專家在清理法門寺地宮中室文物時，在一朽壞的木箱內發現了13件瓷器，有碗、盤、碟，器形較大而且規整，造型精美，胎質優良，釉色自然，製作精巧，器物口、腹、底渾然一體，宛若天成。地宮內的《物賬碑》明確記載它們為秘色瓷，而其釉色也與古人記載相吻合，這就破解了一直籠罩在秘色瓷身上的種種謎團。
秘色應是一種青中泛湖綠的釉色，它是越窯青瓷中極為罕見的一種色調。由於秘色瓷在制胎施釉及燒造等方面獨具特色，使燒製成型的秘色瓷器似冰類玉，在光線的照射下，盤內無中生有，似盛有水，清澈明亮，玲瓏剔透，給人以「巧剃明月染春水」之感。
從法門寺地宮出土的秘色瓷可以看到，唐代越窯在裝燒工藝方面的革新，已取得重大突破，並對唐宋以後的燒制工藝，產生了廣泛深刻的影響。再來看地宮絲綢和琉璃器。據地宮內《物賬碑》記載，地宮內有武則天、魏宗、僖宗、惠安皇太后、昭儀、晉國大人等皇室帝胄供奉釋迦牟尼的各類絲織物700多件，包括綾、羅、綢、緞、錦、綺、絹、綉、紗、繪等30多種品類，堪稱唐代皇家的一座地下絲綢寶庫。這批絲織品幾乎涉及了唐代各個時期、各個類型的絲織品精華，是我國唐代絲綢考古發掘中一次具有劃時代意義的重大發現，對研究中國古代紡織史、服飾史、織造技術史等以及研究中國絲綢在世界歷史上的地位，提供了最為珍貴的實物資料。
這五件絳紅羅地蹙金綉，包括袈裟、拜墊、襽（lán，同襕，古代一種上下衣相連的服裝）、半臂、案裙，是為捧真身菩薩特製的微形衣物，也是地宮內保存最完好的絲綢織物。蹙金綉是用金銀絲盤結成各種圖案，然後將圖案固定在絲綢上的一種刺繡針法。這五件蹙金綉上所用的捻金絲加工複雜，它的中間是一根絲線，外面纏繞金絲，每米蠶絲上繞金箔3000圈，據考證當今世界手工捻金線的最細直徑為0.12毫米，而l000多年前，我們的祖先在這種蹙金綉上所用的捻金絲的最細直徑僅為0.06毫米，比頭髮絲還要細，堪稱古今一絕。它們的刺繡針法精細纖巧，製作工藝精湛，質料考究，作為宮廷加金綉品，雖歷經千載，依然色澤艷麗，燦然如新，不愧為絲綢史上的一大奇蹟。
琉璃即玻璃，法門寺地宮出土的這幾件藍色刻紋玻璃盤，均為深藍色透明玻璃，盤底刻有以植物的枝葉、花為主題的刻紋，線條生動，圖案優美。刻紋玻璃工藝是伊斯蘭玻璃匠從羅馬帝國繼承下來的工藝之一，在伊斯蘭早期流行一時，但像這樣保存下來、完整無損的實屬罕見。這幾件藍色刻紋玻璃盤，對研究中西方文化交流，以及中外玻璃發展史都提供了難得的實物依據。下圖是琉璃茶托茶盞。
最後來看看唐茶禮儀。唐代宮廷茶事興盛，在文人和寺院僧侶茶道的基礎上，形成了一種尚繁縟、群體，重等級、禮儀，表現高度藝術化的茶文化活動和宮廷茶道。法門寺地宮出土的這一套完整的唐皇室金銀茶具，是唐代宮廷茶文化的一個歷史縮影和真實再現。據地宮內《物賬碑》記載，這套茶具是唐僖宗的御用珍品，作為國寶重器奉獻給佛祖真身舍利，以事虔誠禮佛的心愿，與佛教中的茶供養相吻合，可見當時的茶文化已是皇家禮佛的最高禮儀。地宮出土的這套茶具主要包括烘焙、碾羅、貯藏、烹煮、飲用等器皿。這件文物叫鎏金仙人駕鶴紋壺門座茶羅子，仿木製箱匣體結構，由蓋、身、座、羅、屜五部分組成。羅身上部為雙層框羅斗，歲斗兩端有空隙可來回抽動。歲屜用來呈接過羅的茶末，羅的出現是人對茶末的細度有更高要求的結果。唐代以前茶羅從末出土過，此件茶羅為首次發現，彌足珍貴。整件茶羅無論是做工，還是結構質地都呈現出了皇家的氣魄。
這件文物叫鎏金銀龜盒，是貯存茶末所用，既可揭蓋取茶，又可以從龜口倒出。整體造型惟妙惟肖，極富動感，實為稀世之寶。龜在唐人的心目中象徵著吉祥長壽，作為茶具的裝飾圖案，則表現了唐皇室祈求聖壽萬春、聖枝萬葉的心愿，比喻飲茶有益健康長壽。
這件文物叫鎏金蕾紐摩竭紋三足架銀鹽台，整件鹽台近似為由一簇荷葉、蓮花、蓮蕊、荷葉稈組成的立體造型，並有摩褐、花草等附件裝飾，新穎別緻。唐人飲茶或調以鹽、姜、椒等，鹽台即為盛放佐料的器具。歷代茶書均未記載鹽台，此器為首次發現。
法門寺地宮出土的這套茶具，向人們全面展示了從烘焙、研磨過篩、貯藏到烹煮、飲用等制茶工序及飲茶的全過程，系統形象地再現了唐代宮廷茶道的歷史風貌，反映了唐代茶文化所達到的最高境界，為我們認識茶文化和佛教文化的關係提供了生動的實物資料，是不可多得的實用價值與審美價值兼具的歷史藝術珍品。在博物館內，還有法門寺唐密曼荼羅地宮。874年正月四日，唐僖宗最後一次送還佛骨時，按照佛教儀軌，將佛指舍利及數千件稀世珍寶一同封入塔下地宮，用唐密曼荼羅結壇供養。這座地宮就是有關專家經過潛心研究之後，於2006年4月重構的唐密曼荼羅。
據密宗經典記載，法身佛大日如來為十地以上菩薩講授《大日經》和《金剛頂經》，在南天鐵塔內外分別傳出了胎藏界（物質世界）和金剛界（精神世界）兩部大法，於公元七世紀分別為印度高僧善無畏和金剛智所承傳。善無畏、金剛智未在印度傳授，而率其弟子不空於唐開元年間先後來到中國長安（史稱開元三大士）結壇傳法並相互傳授，是謂「金善互授」，由始兩部大法互相交流。其後，善、金又將兩部大法傳給印度僧人不空和中國僧人一行，由是一人而傳承兩部大法，謂之「兩部一具」。不空盡得兩部真諦而全傳於中國僧人惠果。一行原是天台學人，側重胎藏界，其《大日經疏》為胎藏界解釋《大日經》之根本論典，台密（日本天台宗所傳之密教）以他為創造台密的實際宗祖。惠果先後任唐朝代宗、德宗、順宗皇帝的國師，他雖融匯兩部大法，卻側重於金剛界，其創繪的金剛界曼荼羅與金剛密號等，是金剛界理解《金剛頂經》之根本依據，其內涵多與中國傳統文化相結合，創立了繼承印密而又別有發展的唐密體系，推動佛教密宗中國化而成為唐密大法，東密（以東寺為根本道場之日本真言密教）公認他為初祖。
原法門寺地宮內建立兩部曼荼羅，放置第一枚影骨的八重寶函，表示胎藏界因曼荼羅；放置第三枚靈骨的密室五重寶函，表示金剛界果曼荼羅。據專家介紹，金剛界曼荼羅是大如來為金剛手、觀音等十地菩薩所示顯的集會等式樣；胎藏界曼荼羅是毗盧遮那佛的大悲願化益眾生現種種身、法、心而示顯的圖像。這兩部曼荼羅把佛教大意和思想內容用圖像表達出來，它網羅宇宙萬象，包括十界聖凡，兼收並蓄，顯密圓融，為宇宙法界之縮影，是大唐文化和佛教文化的歷史寶庫。
法門寺地宮唐密曼荼羅展示的主要是唐密金剛界曼荼羅，以立體景觀的形式，將佛教密宗的「無上法界」栩栩如生地展現出來。
法門寺博物館，彷彿一座薈萃唐代曠世奇珍的豐富寶庫，置身其中，彷彿置身於一座神秘莊嚴的佛教大千世界，彷彿融入大唐盛世奢華高貴的供佛大典，琳琅滿目的唐代曠世奇珍及其所承載的大唐文化和佛教文化內涵折射出的獨特魅力，無不令人讚歎稱奇。
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