為什麼全球那麼多牛人都開始談論基因編輯?看完這些濃縮乾貨你就知道了!
先是Editas宣布在2017年開展CRISPR基因編輯人體實驗;大家的興奮勁兒還沒過,從Great Ormond Street兒童醫院又傳出基因編輯「治癒」白血病的爆炸性新聞;緊接著王力宏同學開始在微博上推介CRISPR基因編輯技術。基因圈那些苦逼的創業青年們抱頭痛哭,「我們終於找到代言人了」。基因真的就這樣火了!
在CRISPR誕生之前,「基因編輯」一詞僅存在於科研人員的世界裡;在CRISPR誕生之後,「編輯生命」似乎變得觸手可及,於是才會有今天人盡皆知的局面。近期臨床和實驗室的研究進展再次表明,基因編輯斗得過癌症和艾滋,還要去治療失明。
基因編輯這種「上得了廳堂,下得了廚房」的能力,依賴于于它強大而穩定的「關閉」、「恢復」和「切換」三大技能。
「關閉」一個基因,打開生命之門
2015年11月5日,Waseem Qasim對外宣布,他們利用Cellectis公司經ZFNs基因編輯技術改造的UCART19細胞株,成功緩解了Layla的不治之症--急性淋巴細胞性白血病(ALL)。
NBCNEWS的報道
急性淋巴細胞性白血病的主要特徵為,免疫淋巴細胞在骨髓內異常增生,導致人體造血功能紊亂,以及大量器官被侵犯。一般情況下,可以通過放化療以及骨髓移植,有效的殺死異常增殖的免疫淋巴細胞,最終達到緩解或者治癒的目的。據統計,Layla這個年齡(1歲左右)患上急性淋巴細胞性白血病的治癒率為25%,但是Layla顯然屬於那不幸的75%,她在接受放化療以及骨髓移植之後,病情仍舊沒有得到緩解。Layla顯然被傳統的治療手段「拋棄」了。就在這種情形下,Layla的父母決定讓Layla嘗試基因編輯療法,儘管這種治療急性淋巴細胞性白血病的方法只在小白鼠身上用過。
幸運的是Layla最終轉危為安。因此才有了前幾天「基因編輯技術成功治癒白血病女孩」的文章席捲朋友圈。但是,Cellectis公司的Qasim卻謹慎地說,「對白血病患者來說,這種治療方法並不是長久之計,實際上它(基因編輯)更像是『緩兵之計』,在找到合適的配型之前,這種方法起到『橋樑』的作用」。
Qasim在言辭間分明在告訴我們,「緩解Layla病情的不止基因編輯」。還有傳說中的CAR-T技術(Chimeric Antigen Receptor T-Cell Immunotherapy,嵌合抗原受體T細胞免疫療法)。
Cellectis公司基於ZFNs基因編輯的CAR-T技術
Layla的醫生髮現,在異常增殖的免疫淋巴細胞表面有CD19蛋白,這個蛋白可以被CAR19蛋白識別,但是沒能找到攜帶CAR19蛋白的合適供體。最終,Layla的醫生跟Qasim取得聯繫,Qasim開發的UCART19細胞(有CAR19蛋白)成為Layla唯一的希望。UCART19細胞儘管具備殺滅Layla體內惡性細胞的能力,但是也不是Layla合適的配型。
UCART19細胞的厲害之處在於,Qasim利用ZFNs基因編輯技術「關閉」了導致排異反應的關鍵基因,這樣一來UCART19就可以安全輸入Layla體內。讓人感到驚喜的是,UCART19將Layla體內惡性增殖細胞消滅乾淨了。至此UCART19的任務全部完成,Layla已經完成了新一輪的骨髓移植(此時有沒有CAR19蛋白已經不重要了)。目前看來Layla已經「痊癒」了,但只有經過一兩年時間的考驗之後,我才敢去掉那個引號。
「恢復」受損基因,才能重見光明
2015年11月3日,Katrine Bosley在劍橋大學召開的EmTech大會上宣布,實驗室數據表明,CRISPR基因編輯技術可以用於治療Leber congenital amaurosis(LCA;利伯先天性黑朦病,一種遺傳性視力衰退疾病),Editas將在2017年開展CRISPR基因編輯人體實驗。
Editas的CEO Katrine Bosley
相比於ZFNs基因編輯技術「治癒」了Layla的白血病,可能會發生於2017年的CRISPR基因編輯人體實驗顯得暗淡無光。但我卻為Editas的CRISPR基因編輯技術感到心潮澎湃。我們先來看看Editas是打算如何做的。
LCA是一種罕見遺傳病,研究表明有20多種基因變異會導致LCA,例如RPE65和CEP290等。傳統的基因治療十分熱衷於研究LCA,因為這些變異與LCA關係明確,直接通過病毒載體導入正常基因(比如正常的RPE65)即可。但是,一旦遇到跟病毒載體一樣大的基因(比如CEP290)缺陷,傳統的基因治療就束手無策了。
在所有的LCA病例中,CEP290基因缺陷導致的LCA大概佔20%,Editas採用的方法是,利用CRISPR基因編輯技術,直接刪除CEP290基因變異位點左右共1000個鹼基。Editas實驗室的研究表明,刪除CEP290基因的那1000個鹼基之後,CEP290基因的表達恢復正常。CEP290基因變異的患者視力可能恢復正常。
Katrine Bosley詳解CRISPR基因編輯技術治療LCA過程
Editas宣布的2017年人體實驗激動人心之處在於,這有可能是首次人體(in vivo)基因編輯試驗。這項研究成功的意義在於,將CRISPR基因編輯「工具」裝載到病毒體內,再把病毒注射到患處,CRISPR可以自行對患病部位進行基因改造。那麼以後治療Layla那樣的白血病,不用分離T細胞了,直接將改造好的病毒注射到骨髓,就直接將基因異常的骨髓修復了,或者是直接整合目標基因加強其戰鬥力。這樣一來,很多大手術就會變成微創手術,帶來的好處是難以估量的。
在不同人種之間,自由「切換」
2014年3月12日,賓夕法尼亞大學Pablo Tebas教授團隊在新英格蘭醫學雜誌撰文稱,他們利用Sangamo BioSciences開發的ZFNs基因編輯技術,顯著提高了艾滋病患者對艾滋病毒的抵抗能力。
這篇發表於2014年的文章,研究從2009年就開始了,直到2012年才結束。是基因編輯技術首次應用於臨床。目前Sangamo BioSciences基於ZFNs技術治療艾滋病的方法已經進入臨床II期試驗。
之所以能夠使用基因編輯技術治療艾滋病,是因為發現免疫細胞表面的CCR5蛋白是HIV進入免疫細胞的「入口」。而少數北歐人由於CCR5基因「變異」,具備天然的HIV抵抗力(為什麼是他們?)。
HIV在細胞表面的「入口」CCR5蛋白
這個「變異」對於艾滋病患者來說真的很重要,因此研究人員做了很多的研究。有研究表明,北歐人體內的CCR5基因「變異」不是CCR5基因突變的結果,而是在自然界中伴隨著原始高加索人種的出現而出現的,這種「變異」所表現出來的性狀因適應自然環境而保留了下來。自此,我不得不佩服大自然的神奇。也許在世界的任何一個角落裡,造物主都會安放著一個保護人類的重要基因,避免人類因一種疾病的爆發而滅絕。
有了造物主釋放的重要信息,研究人員就動腦子了,「要不把患者的CCR5基因都改成高加索人種那種類型吧」!Tebas團隊做的就是這件事。在體外(ex vivo)利用ZFNs基因編輯技術定點改造免疫細胞的CCR5基因。讓我們靜候Sangamo臨床II期的好消息。
縱觀上述三項研究,你會發現我一直在強調一個事情:體外(ex vivo)和體內(in vivo)。體外基因編輯就是在實驗室里修改目標細胞的基因信息,即使效率低下,仍舊可以通過大量的實驗篩選出改造成功的細胞,接下來只需要擴大培養,在輸入體內即可。而體內編輯是整個編輯的過程在體內進行,這就編輯過程是高效的;另外,攜帶編輯工具的病毒載體一旦注入人體,控制性就變差了,因此對編輯過程的安全性要求非常高。但是正如我在講述CRISPR基因編輯技術所言,一旦能過做到精確高效的編輯,以後很多疾病的治療都變得非常簡單了。
儘管老牌的ZFNs基因編輯技術已經在癌症和艾滋病的治療上嶄露頭角,但是ZFNs能做的事情,對CRISPR來講是「小菜一碟」。今年Editas已經與CAR-T新貴Juno開展合作,相信他們很快會在免疫治療領域取得大突破。體內(in vivo)基因編輯應該才是Editas們的終極夢想。
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