如何入門生信Linux

06-13

生物信息的學習離不開Linux系統，不管自己寫命令處理數據，還是使用現有的工具。Linux對我們來講最重要的是它強大的命令行功能，可以快速、批量、靈活的處理數據的提取、統計和整理等耗時耗力的重複性工作。事實上在日常生信分析中，多數整理工作也都是用Linux命令的組合完成的，相比於寫完整的Python或Perl程序更簡便快捷；另外，生信分析用到的工具大都只在Linux下運行，而Linux發行版眾多，更新速度不一，軟體的安裝是一個令人頭大的事情。

但對我們大部分朋友來說，接觸電腦一直都是圖形界面系統，通過單擊、雙擊打開文件、切換目錄、安裝運行軟體都已經運用的得心應手，對文件路徑的概念也不太關注。乍一接觸Linux，會對其組織邏輯不適應，生信寶典公眾號最開始推出Linux教程就是關於文件和目錄的描述，以及與Windows系統的對應，方便做一個快速切換。

隨後結合幾年的學習和分析，從常用的Linux生信分析命令出發，精簡了一批入門命令，常見錯誤，快捷操作，進階操作等，涵蓋了下圖的很多內容。

但作為基礎內容，可以入門Linux，距離生信應用還有些距離，故於2018年3月24日在北京鼓樓推出生信Linux研討活動，希望能把Linux在生信中的應用進一步推廣。

本次Linux研討致力於從最基礎出發，理論與實踐結合，帶你進入Linux系統的思維。這次培訓將會讓你對Linux系統的組織方式有合理的認識，學會生信中最常用的Linux命令及其組合操作和不同的批量操作方式，並應用於生物相關的數據處理；詳細講述Linux下常用軟體安裝的邏輯、方式、使用和遇到問題的解決方法；講述Linux下流程的搭建和並行處理。