身體的脂肪酸情況，影響腸道菌群與肥胖 | 熱心腸日報

今天是第763期日報。

組織內的脂肪酸情況影響小鼠腸道菌群和體重

Diabetes[IF:8.684]

① fat-1轉基因小鼠（持續產生ω3多不飽和脂肪酸（PUFA））及野生型同窩對照小鼠分別餵食高脂/高蔗糖飼料或對照飼料；② 與野生型小鼠相比，餵食高脂/高蔗糖飼料的fat-1小鼠的肥胖、葡萄糖不耐受、肝性脂肪變性被顯著抑制，並且維持了正常的腸道屏障功能，內毒素血症顯著減少；③ fat-1小鼠的盲腸菌群多樣性增加，將其糞便菌群移植給野生型小鼠後，可逆轉後者的體重增加，並恢復正常的葡萄糖耐受及腸道通透性。

The Transplantation of ω3 PUFA-Altered Gut Microbiota of Fat-1 Mice to Wild-Type Littermates Prevents Obesity and Associated Metabolic Disorders

05-23DOI:10.2337/db17-1488

Microbiome[IF:8.496]

① 孕期/哺乳期母體內源性n-3多不飽和脂肪酸（ω-3脂肪酸）的產生，顯著改善了高脂飲食餵養的雄性後代的增重和代謝紊亂，對雌性後代的增重無顯著影響；② 雄性後代的代謝表型似乎是菌群組成改變所介導的；③ 減少母體ω-3脂肪酸，導致ε-變形菌綱、擬桿菌屬和Akk菌屬顯著減少，梭菌綱的相對丰度增高；④ 與孕期相比，哺乳期的母體脂肪酸狀態對後代代謝和菌群組成受的影響更大，母體脂肪酸狀態可長期影響高脂飲食餵養的後代菌群組成和功能。

Maternal omega-3 fatty acids regulate offspring obesity through persistent modulation of gut microbiota

05-24DOI:10.1186/s40168-018-0476-6

Nature Immunology[IF:21.506]

① 外周血中分泌IgM和IgA的記憶B細胞及克隆相關的腸固有層成漿細胞，可分泌親和力成熟的人單克隆抗體，通過識別脂多糖（LPS）O抗原防禦肺炎克雷伯菌；② 該抗體在體內有獨特的交叉特異性，可防禦不同血清型的臨床相關肺克，還可識別大量腸道細菌的LPS；③ 該抗原特異性識別多糖，不同於天然抗體和多反應抗體；④ 識別微生物表面大量的最小多糖抗原表位，或為一種高效的體液免疫機制，可利用有限的交叉特異性抗原來管控入侵病原菌和大量共生菌。

Cross-specificity of protective human antibodies against Klebsiella pneumoniae LPS O-antigen

05-14DOI:10.1038/s41590-018-0106-2

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 分析潰瘍性結腸炎（UC）和克羅恩病（CD）等炎症性腸病（IBD）患者和健康對照的唾液菌群；② UC患者中，鏈球菌科/屬和腸桿菌科富集、毛螺菌科和普氏菌屬減少，CD患者中，韋榮球菌科/屬增加、奈瑟氏菌科/屬和嗜血桿菌屬減少；③ 這些變化與全血白細胞計數水平和唾液菌群功能改變相關；④ IBD患者中存在不同的唾液菌群生態型，並篩選出IBD的口腔標誌菌屬；⑤ IBD患者的唾液菌群存在結構、組成和功能失調，這些發現有助於鑒別IBD高危人群。

Dysbiosis and Ecotypes of the Salivary Microbiome Associated With Inflammatory Bowel Diseases and the Assistance in Diagnosis of Diseases Using Oral Bacterial Profiles

05-30DOI:10.3389/fmicb.2018.01136

維生素D受體在IBD中的保護作用（綜述）

Inflammatory Bowel Diseases[IF:4.525]

① 維生素D受體在腸道中高表達，對調節腸道細胞增殖、屏障功能及免疫十分重要，並在IBD中起保護作用；② 編碼VDR的基因中部分SNP與IBD的易感性相關，IBD患者的VDR表達顯著降低；③ 在日照較少的地區，IBD發病率較高，可能與血清中較低的維生素D水平相關；④ VDR信號可促進抗炎症細胞因子的分泌，以及耐受性樹突細胞及調劑性T細胞的分化，以減少炎症；⑤ VDR缺失導致腸道菌群失調，VDR可促進抗菌肽的表達，益生菌可通過活化VDR而緩解結腸炎。

Ancient Nuclear Receptor VDR With New Functions: Microbiome and Inflammation

04-28DOI:10.1093/ibd/izy092

低聚果糖顯著改善非酒精性脂肪性肝炎

European Journal of Nutrition[IF:4.37]

① 在一項隨機對照試驗中，14名非酒精性脂肪性肝炎（NASH）患者分為2組，分別攝入低聚果糖或等熱量的安慰劑，前12周每日8g，後24周每日16g，持續9個月；② 與安慰劑相比，低聚果糖可顯著改善脂肪肝以及總體NAS分數；③ 低聚果糖顯著增加了腸道菌群中的雙歧桿菌屬，而梭菌屬cluster XI及cluster I減少；④ 攝入低聚果糖並未造成不良事件，未來需更大規模的研究來證實低聚果糖對NASH的改善效果。

Histological improvement of non-alcoholic steatohepatitis with a prebiotic: a pilot clinical trial

05-19DOI:10.1007/s00394-018-1721-2

GigaScience[IF:6.871]

① ASaiM是一個模塊化和用戶友好的用於微生物數據分析的框架；② 基於開源Galaxy平台，集成了超過100種分析工具，內置若干參考分析流程，通過Docker方式快速部署；③ 避免了Mothur、QIIME等命令行工具難學難用和MG-RAST、EBI等在線服務缺少透明性的缺點；④ 可用於組裝、提取、探索和可視化宏分類學、宏基因組和宏轉錄組序列中的微生物信息；⑤ ASaiM可在PC機上運行，同時是開源軟體（Apache 2協議），有豐富文檔。

ASaiM: a Galaxy-based framework to analyze microbiota data

05-22DOI:10.1093/gigascience/giy057

Microbiome[IF:8.496]

① 通過將抗生素抗性基因（ARG）宏基因組數據和機器學習方法SourceTracker結合，將來源分為5個生態型：人類糞便、動物糞便、污水處理廠中的活性淤泥、自然環境；② 經全球和特定範圍數據集訓練後，預測656個宏基因組數據集的生態型，準確率可達88%；③ 用於香港、珠江口和南海沉積物中ARG的溯源也得到了新的認識；④ 表明成熟的SourceTracker平台對於評估抗生素耐藥性（AMR）污染有重要價值。

Tracking antibiotic resistance gene pollution from different sources using machine-learning classification

05-24DOI:10.1186/s40168-018-0480-x

感謝本期日報的創作者：沈志勛，女巫，小腸君，mildbreeze，gaoch