癌症精準治療，就是離不開腸道菌群~ | 熱心腸日報

今天是第563期日報。

梅奧學報：癌症精準治療，腸道菌群不可或缺！

Mayo Clinic Proceedings[IF:6.686]

① 長期住院、免疫抑制、多次使用抗生素、化療等因素會導致腸道失調，因而癌症患者是艱難梭菌感染（CDI）的易感人群；② Hefazi等人報告了對23名接受過化療的癌症患者使用糞菌移植（FMT）治療複發性CDI，有效率達86%，且無嚴重不良反應和感染併發症；③ 該研究表明，在高感染風險的癌症患者中，用FMT治療CDI是安全且有效的；④ 腸道菌群和癌症的關係複雜而密切，可以作為生物標記物、診斷工具、治療靶點，是癌症精準治療中不可缺少的因素。

Gut Microbiota and Cancer Patients: A Broad-Ranging Relationship

2017-11-01DOI:10.1016/j.mayocp.2017.09.009

Mayo Clinic Proceedings[IF:6.686]

① 2012-2016年間，23名惡性腫瘤患者接受糞菌移植（FMT）以應對艱難梭菌感染（CDI）；② 患者在FMT前平均12個月接受化療，平均有4次CDI複發且平均接受106天的抗生素治療；③ FMT後60天內，23人的艱難梭菌均為陰性，除3人外無人複發腹瀉，1人在FMT後5天因與FMT無關的心臟驟停而死亡；④ 22人存活60天或以上，11人接受進一步化療，10人使用更多抗生素，2人分別在FMT後14和22月複發CDI；⑤ 所有案例中，無歸因於FMT的其他嚴重不良反應和感染併發症。

Safety and Efficacy of Fecal Microbiota Transplant for Recurrent Clostridium difficile Infection in Patients With Cancer Treated With Cytotoxic Chemotherapy: A Single-Institution Retrospective Case Series

2017-11-01DOI:10.1016/j.mayocp.2017.08.016

Trends in Endocrinology and Metabolism[IF:10.893]

① Zhang等人的研究表明甘露糖具有免疫調節功能，可特異性誘導初始T細胞向調節性T細胞（Treg）分化；② 在小鼠模型中，口服甘露糖可預防和抑制某些自身免疫疾病，包括非肥胖性一型糖尿病和卵清蛋白誘導的呼吸道炎症；③ 甘露糖經SLC2A轉運到細胞內，增強線粒體中脂肪酸氧化產生自由基、上調整合素αVβ8的表達，進而激活TGF-β，誘導產生FoxP3 Treg細胞；④ 該研究表明甘露糖或可用於一型糖尿病等自身免疫疾病的預防和治療，具有臨床意義。

A Sweet Deal for Diabetes

2017-11-01DOI:10.1016/j.tem.2017.10.006

Nature Medicine[IF:29.886]

① D-甘露糖是葡萄糖的差向異構體，存在於植物和水果中；② 細胞實驗表明，甘露糖可以誘導人類和小鼠的初始T細胞向Foxp3 調節性T細胞（Treg）分化；③ T細胞中，甘露糖能提升整合素αVβ8的表達、脂肪酸氧化和自由基水平，促使TGF-β活化，從而增強TGF-β信號，誘導Treg細胞生成；④ 在小鼠中，口服甘露糖能增加Treg細胞的比例，抑制自身免疫性的1型糖尿病和卵清蛋白誘導的呼吸道炎症；⑤ 甘露糖的免疫調節作用具有潛在的臨床應用價值。

D-mannose induces regulatory T cells and suppresses immunopathology

2017-07-24DOI:10.1038/nm.4375

Neurotherapeutics：多發性硬化中的飲食、菌群與維生素（綜述）

Neurotherapeutics[IF:5.166]

① 連接多發性硬化中飲食、腸道菌群、維生素D/A的關鍵是低度炎症；② 高卡路里、高動物脂肪的西式飲食使腸道菌群失調，其引起的腸道炎症導致腸道屏障泄露，從而破壞血腦屏障，最終導致神經炎症；③ 與此相反，富含纖維的素食飲食與腸道生態平衡及健康相關；④ 在低度炎癥狀態下維生素D的水平缺乏，服用高劑量維生素D3可恢復其正常水平；⑤ 維生素D與其受體結合需要維生素A的參與，從而發揮其抗炎症作用，對於維生素缺乏者，這兩種維生素均需提供。

Diet, Gut Microbiota, and Vitamins D A in Multiple Sclerosis

2017-10-24DOI:10.1007/s13311-017-0581-4

GB：不依賴於參考基因組的宏基因組分析演算法——MetaGen

Genome Biology[IF:11.908]

① 開發一種新的統計宏基因組演算法MetaGen，可在不使用參考基因組的情況下，同時鑒定出微生物物種並估計其相對丰度；② 作為取捨，這種演算法需要多個宏基因組樣品（通常需要不少於10個樣品），才能得到高精度的binning結果；③ 與其它不依賴於參考基因組的方法（基於k-mer分布或覆蓋信息的演算法）相比，該演算法的物種binning準確率更高，且在測序覆蓋度較低時仍相當有效；④ 通過模擬及真實宏基因組研究驗證了該演算法的有效性。

MetaGen: reference-free learning with multiple metagenomic samples

2017-10-03DOI:10.1186/s13059-017-1323-y

Nucleic Acids Research[IF:10.162]

① EBI宏基因組提供了一個對特殊環境中的微生物種群測序數據進行分析並歸檔的免費平台；② 在過去的20多年內，EBI宏基因組將其數據集的數量增加了10倍，並且在增加通量的同時，添加了最新的計算分析工具及參考數據集；③ 添加了基於大/小亞基RNA標記基因的分類方法，並添加了宏基因組組裝作為新的分析服務；④ 從公共數據集中產生了超過2400個組裝集合，基於此生成了一個包含超過5000萬序列的可搜索、非冗餘的蛋白資料庫。

EBI Metagenomics in 2017: enriching the analysis of microbial communities, from sequence reads to assemblies

2017-10-23DOI:10.1093/nar/gkx967

American Journal of Pathology[IF:4.057]

① 先前的研究報道，通過敲入自身抗體564的IgH和IgL基因，建立雜合非自身免疫小鼠模型，其自身免疫抗體高表達依賴於TLR7受體；② 與雜合子不同，純合子小鼠不僅表達高水平的自身免疫抗體，還具有高發成熟B細胞腫瘤和細菌易感性更高的特性；③ 更重要的是口服抗生素後，小鼠沒有感染、未發生淋巴瘤，甚至自身免疫癥狀也減輕；④ 該小鼠模型對未來研究自身免疫疾病、淋巴瘤以及腸道菌群之間的聯繫具有重要意義。

Associations of Autoimmunity, Immunodeficiency, Lymphomagenesis, and Gut Microbiota in Mice with Knockins for a Pathogenic Autoantibody

2017-07-17DOI:10.1016/j.ajpath.2017.05.017

感謝本期日報的創作者：mildbreeze，熱心腸先生，沈志勛，王輝