滬港通的一大特色，是儘可能以當地市場規則為本，因此香港投資者根據計劃跨境買賣上海A股的交易時間將按照上海證券交易所的交易時間。因應上海與香港證券交易所之間可能出現的輕微時鐘誤差，香港聯合交易所將於內地市場早市及午市開市前五分鐘起接納滬港通訂單，因此，香港的券商可於早上9:10及下午12:55開始輸入滬股訂單。

　　據中國證券網報道，買賣滬股時，投資者只可輸入限價訂單，所有滬股通股票訂單的價格必須在價格限制範圍之內，即不超過或低於該證券前一日收市價的百分之十。所有A股買盤每手股數為100股，賣盤則可接納碎股。現時所有滬股通股票均以人民幣買賣及交收，所有訂單的最低上落價位劃一為0.01元人民幣。投資者買賣上海證券交易所上市證券時，不可進行香港俗稱「即日鮮」的迴轉交易，因為投資者所買入的A股要待下一個營業日才交收，而交收前相關股份是不可轉售的。

　　滬港通交易只適用於兩地市場均為交易日，及兩地的銀行於相應的交收日均營業的日子。具體安排可見以下例子：聖誕節是香港的公眾假期，即使上海證券市場開市，滬股通交易亦會暫停，而在聖誕節前一天，即平安夜12月24日，雖然香港及上海的證券市場都開市，但滬股通交易亦會暫停，因為香港銀行不會在聖誕節提供款項交收服務。內地的交易及結算相關收費及稅項，亦適用於透過滬港通買賣於上海上市的股票。

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