常用生物信息在線工具（一）

根據染色體起始終止點坐標來獲取鹼基序列http://www.bio-info-trainee.com/1049.html熱圖http://sebastianraschka.com/Articles/heatmaps_in_r.html熱圖http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/韋恩圖http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html基因預測http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfindphylogenetichttp://itol.embl.de/index.shtml啟動子區預測http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/蛋白質一級結構分析https://www.predictprotein.org/home蛋白質磷酸化位點http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/信號肽http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/跨膜結構域http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/蛋白質亞細胞定位http://psort.hgc.jp/form2.html蛋白質二級結構分析https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html蛋白質三級結構預測http://swissmodel.expasy.org/interactive短序列拼接http://doua.prabi.fr/software/cap3多序列比對相似性展示http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php繪製GO注釋結果http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl蛋白質domainhttp://pfam.xfam.org/基因組雜合性評估http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2circos圖http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/序列比對musclehttp://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#富集分析http://bioinfo.vanderbilt.edu/webgestalt/login.php富集分析http://amp.pharm.mssm.edu/Enrichr/DNA序列過濾器http://www.bio-soft.net/sms/filter_dna.html序列比對http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#在線DNA和蛋白序列處理工具集http://www.biotrainee.com/thread-363-1-1.htmlannovar對snp位點注釋http://wannovar.wglab.org/Mutation-Assessor對突變位點對基因或者蛋白功能的影響http://www.bio-info-trainee.com/1270.htmlMutationMapper來查看基因突變的分布http://www.bio-info-trainee.com/1270.htmlGO分析https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp構建進化樹http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/格式轉換器http://sequenceconversion.bugaco.com/converter/biology/sequences/fasta_to_phylip.phpGenBank文件特徵序列提取器  http://www.bio-soft.net/sms/feat_extract.htmlGenBank to FASTA  http://www.bio-soft.net/sms/gen_fasta.html隨機DNA序列http://www.bio-soft.net/sms/rand_dna.html反序與補序工具  http://www.bio-soft.net/sms/rev_comp.html打亂DNA序列工具http://www.bio-soft.net/sms/shuffle_dna.htmlDNA序列分組工具  http://www.bio-soft.net/sms/group_dna.html引物顯示工具  http://www.bio-soft.net/sms/primer_show.html限制酶位點與翻譯工具  http://www.bio-soft.net/sms/rest_trans_map.html序列翻譯工具http://www.bio-soft.net/sms/show_trans.html密碼子圖表  http://www.bio-soft.net/sms/codon_plot.html密碼子使用工具  http://www.bio-soft.net/sms/codon_usage.htmlCpG島  http://www.bio-soft.net/sms/cpg_island.htmlDNA特徵序列查找  http://www.bio-soft.net/sms/dna_pattern.htmlDNA統計  http://www.bio-soft.net/sms/dna_stats.htmlORF查找器  http://www.bio-soft.net/sms/orf_find.html位置鹼基頻率  http://www.bio-soft.net/sms/uneven.html限制位點概要  http://www.bio-soft.net/sms/rest_sum.html鹼基比例圖  http://www.bio-soft.net/sms/simple_plot.html測試編碼  http://www.bio-soft.net/sms/testcode.htmlDNA翻譯http://www.bio-soft.net/sms/translate.html蛋白過濾器  http://www.bio-soft.net/sms/filter_prot.htmlGenBank翻譯提取器  http://www.bio-soft.net/sms/trans_extract.html隨機蛋白序列http://www.bio-soft.net/sms/rand_prot.html一到三：單字母氨基酸殘基編碼到三字母編碼序列  http://www.bio-soft.net/sms/oneToThree.html打亂蛋白序列  http://www.bio-soft.net/sms/shuffle_prot.html三到一：三字母編碼的蛋白序列轉換為單字母編碼氨基酸的蛋白序列http://www.bio-soft.net/sms/threeToOne.htmlCOMBOSA  http://www.bio-soft.net/sms/combosa.html蛋白序列分組  http://www.bio-soft.net/sms/group_prot.html多序列對比顯示http://www.bio-soft.net/sms/multi_align.html一致和類似性值  http://www.bio-soft.net/sms/ident_sim.html蛋白序列統計  http://www.bio-soft.net/sms/protein_stats.html蛋白特徵序列查找  http://www.bio-soft.net/sms/prot_pattern.html蛋白分子量  http://www.bio-soft.net/sms/prot_mw.htmlMulti Rev Trans  http://www.bio-soft.net/sms/multi_rev_trans.htmlReverse Translatehttp://www.bio-soft.net/sms/rev_trans.htmlAcknowledgements  http://www.bio-soft.net/sms/ack.htmlBrowser Compatibility  http://www.bio-soft.net/sms/browser_comp.htmlDownload  http://www.bio-soft.net/sms/d_load.html序列比對http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#在線DNA和蛋白序列處理工具集http://www.biotrainee.com/thread-363-1-1.htmlannovar對snp位點注釋http://wannovar.wglab.org/Mutation-Assessor對突變位點對基因或者蛋白功能的影響http://www.bio-info-trainee.com/1270.htmlMutationMapper來查看基因突變的分布http://www.bio-info-trainee.com/1270.htmlGO分析https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp構建進化樹http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/格式轉換器http://sequenceconversion.bugaco.com/converter/biology/sequences/fasta_to_phylip.php
推薦閱讀：