利用深度測序監控白血病治療效果的終極手段

利用深度測序監控白血病治療效果的終極手段

來自專欄 基於基因組學診斷的癌症靶向治療

利用基因組測序來判斷化療是否有效在白血病專家Tim Ley這裡被玩到登峰造極的地步, 他領導的團隊在2015發表了一篇文章,介紹使用深度基因組測序研究化療對白血病病人體內的癌細胞分布的影響。

這個病人體內存在攜帶6種不同基因突變組合的癌細胞,見下圖:

上了化療藥物之後,2,4,6這幾種類型的癌細胞死光了,但是灰色的1號群體對藥物不敏感。

從開始化療到最後複發,病人體內的6種亞群癌細胞的變化見下圖:

這個病人的化療和測序時間跨度超過500天,曾經的優勢亞群因為對藥物敏感而被清除,曾經的弱勢亞群因為對藥物不敏感而最後稱為優勢群體造成癌症複發,見下圖:

即使在美國,以深度測序對白血病的化療進行動態監控目前上因為花費太高還不可推行,這篇文章其實應該算是一個特例(proof of principle),證明從技術上來說是可行的,未來基因組測序成本進一步下降以後應該可以引入臨床治療。

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