一場關於基因測序的「無限戰爭」來了!
當眾人將滅霸控制住後
螳螂女開始觸碰滅霸的大腦……
我緊緊地抓住了
這個鑲嵌了6顆無限寶石的手套
「星爵你別激動,就要成功了,
無限手套我就要扒下來了……
Oh no....」
從睡夢中驚醒,Oh,我居然變成了蜘蛛俠,基因變異了的超級英雄……坐在床頭,繼續回味著夢裡的我。
「如果成了超人,我就可以懲惡揚善,拯救全世界,贏取白富美,走上人生巔峰。想想還有點小激動呢。」
上面說到蜘蛛俠是基因突變造就的英雄,而我所從事的基因檢測工作則是針對基因的一項研究。
雖然還做不到把人改造成超級英雄,但基因檢測已進入實用階段,說到這裡,我想給大家講講關於基因檢測的那些事兒~
基因是什麼?
來來來,我們重溫一下高中生物學:
人類基因組,由23對染色體組成,其中包括22對體染色體、1對性染色體(男性為XY,女性為XX) 。
人類基因組含有約31.6億個DNA鹼基對,鹼基對是以氫鍵相結合的兩個含氮鹼基,以胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)四種鹼基排列成鹼基序列,其中A與T之間由兩個氫鍵連接,G與C之間由三個氫鍵連接,鹼基對的排列在DNA中也只能是A對T,G對C……
這位同學,先別暈,醒醒醒醒,我們繼續…
(此處略過3萬字...)
基因檢測又是什麼?
基因檢測是通過血液、其他體液、或細胞對DNA進行檢測的技術,分析DNA所含有的基因類型和基因缺陷及其表達功能是否正常的一種方法。
舉個栗子
經常被工作掏空的程序員,應當去醫院做一個心腦血管疾病的基因檢測,如果發現自己有遺傳性心律失常的基因(猝死的概率比較高)的話,就應適當地減少工作量,多花點時間去尋找自己的詩和遠方~
基因檢測的主要用途有輔助臨床診斷,指導治療,攜帶者篩查,指導生育,為造血幹細胞移植提供精確的配型信息等。
基因檢測怎麼了?
面臨計算能力的挑戰
測序儀器技術飛速發展,測序原始數據量大幅度提升,使得基因測序行業從原來的「測的沒有算的快」,變為「算的沒有測的快」。
數據分析,解讀效率低
傳統IT計算能力針對單人全測序產生的數據進行分析和解讀,每次計算需要數天時間。
投資高,部署複雜
IT基礎設施成本居高不下,整體IT集群的建設、部署、維護、運營、擴容等非常複雜。
數據的存儲成為瓶頸
1個人的數據為1.5TB,100萬人的數據將有1EB;這麼大數據的傳輸、共享,存儲成本,I/O讀取性能,都會成為業務發展的瓶頸。
怎麼解決呢?
基因測序作為高性能計算的重要應用領域之一,華為高性能計算雲解決方案可以為基因測序應用提供端到端的計算服務:
具體的解決方案有以下幾點:
靈活彈性的高性能雲伺服器:滿足不同HPC應用對計算、內存的配比需求。
卓越性能的裸金屬伺服器:滿足HPC業務按需靈活彈性的需求。
豐富的高性能分散式存儲:滿足用戶不同的數據需求。
Lustre高性能並行文件系統:滿足HPC極致的文件系統性能要求。
分散式可擴展的塊存儲服務:可按需掛載雲硬碟,為HPC計算節點和存儲節點提供存儲空間。
看完我的介紹,是不是也覺得基因檢測是一件能造福人類的事情呢? 有了華為云為這個行業提供技術支持,我們就能更加聚焦地去攻克專業難題,說不定有一天我們就會研究出能將人變成超級英雄的方法呢~
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