文獻彙報||CXCL17表達預測肝癌預後

文獻彙報||CXCL17表達預測肝癌預後

趨化因子是一類具有趨化作用的細胞因子。CXCL17是2006年發現的CXC族趨化因子中的一個新成員。該因子有明顯的促血管生成作用,由此可促進多種腫瘤的生長;然而在胰腺腫瘤中卻通過抗腫瘤免疫等作用而抑制腫瘤的發生。除了在血管生成和腫瘤發生中的作用外,CXCL17還有抗菌抗炎作用,且在粘膜中有恆定表達,推測其在維持粘膜的無菌性中起一定作用。

CXC配體17(CXCL17)是一種新型的CXC趨化因子,其臨床意義仍未知。本篇研究中,作者分析了CXCL17對肝癌(HCC)患者的預後價值,並評估了CXCL17與免疫浸潤的關係。

研究方法:作者通過免疫組化染色法檢查了227例HCC組織標本中的CXCL17表達,將CXCL17表達量分別與臨床病理學特徵、預後、免疫浸潤密度(CD4T細胞,CD8T細胞,B細胞,自然殺傷細胞,嗜中性粒細胞,巨噬細胞)做了相關分析。

結果:Kaplan-Meier生存分析顯示腫瘤內CXCL17(總生存率[P] = 0.015,無複發生存率[RFS] P = 0.003)和瘤周CXCL17(OS = 0.002,P = 0.001)與較短的OS和RFS有關。 CXCL17低組患者的5年複發率顯著低於CXCL17高組患者(瘤周:53.1%比77.7%,P = 0.001,瘤內:分別為58.6%和73.0%,P = 0.001)。多變數Cox比例風險分析將OS作為獨立預後因素(危險比[HR] = 2.066,95%置信區間[CI] = 1.296-3.292,P = 0.002)和RFS(HR = 1.844,95% CI = 1.218-2.793,P = 0.004)。此外,CXCL17表達與更多的CD68和更少的CD4細胞浸潤相關(均P<0.05)。 CXCL17密度和免疫浸潤的組合可用於進一步將患者分為具有不同RFS預後的亞組。

結論:作者指出研究結果提供了第一個證據,即腫瘤浸潤CXCL17細胞密度是預測HCC中OS和RFS的獨立預後因子。 CXCL17的產生與不良免疫浸潤相關,可能是抗HCC治療的重要目標。

Ⅰ材料及方法

本研究中,研究對象為2007至2010年間在中山大學腫瘤醫院接受根治性切除術治療的227肝癌患者。表1,給出了患者的人口學及臨床指標的統計描述。

本研究隨訪時間的中位數36個月(2~83個月)。1年、3年、5年OS和RFS分別為82.7%、61.8%、51.2%和59.9%、39.2%、34.4%。CXCL17表達按照中位數劃分為高表達組和低表達組。分層分析按照巨噬細胞在瘤內(Intratumor)、瘤周(Peritumoral Stroma)、非腫瘤(Nontumor)中的密度分成三組。

Ⅱ 分析過程

①作者首先利用KM方法分析了 CXCL17與預後之間的關係。

從圖2可見,紅色CXCL17低表達組在OS和RFS下,生存率均比CXCL17高表達組高。

②進一步作者利用COX回歸做了單因素和多因素分析;

表2第2列和第6列是單因素分析結果,以OS結局中和以RFS結局中,AST,AFP,腫瘤大小,分期等均是獨立影響因素;第5列和第9列是最終多因素分析結果。

③最後作者利用卡方檢驗分析了CXCL17與各臨床指標的關係。

點評:本研究目的是研究某個基因位點CXCL17表達量對肝癌預後的影響。文中用到的統計方法屬於隨訪刪失數據中的古典方法,也是腫瘤隨訪數據發文章的經典套路。

基於這篇文獻,我們總結一下,寫預後模型研究文章的常規模板。

① 數據來源,描述研究人群的來源,是否多中心,研究中心的數量和位置,需詳細交代研究對象的納入排除標準,各指標的診斷金標準。例如臨床資料的腫瘤分期版本,隨訪時間,疾病史等。明確研究的日期信息(數據獲得的時間開始時間、結束時間和隨訪時間等)。

② 表1 只是一個統計描述表,用於交代,研究資料的數據分布情況,有些研究,有人會在表1中做一些簡單的比較分析(例如卡方,T檢驗),因為我們的資料屬於隨訪資料,這裡不需要比較分析,除非你做的是類似病例對照研究的數據,在統計描述時需交代病例組和對照組的數據分布情況,且某些指標是均衡的。

③ 對研究關係的因素,如果有必要,可以儘可能的細分,例如本研究的瘤內(Intratumor)、瘤周(Peritumoral Stroma)、非腫瘤(Nontumor)。對於可能影響的其他因素,如果想規避混雜或者交互,也可以做分層分析,但一般分層不建議超過兩層。

④ 研究終點的定義,結局指標及定義(明確定義預測模型的預測結局,包括任何測量以及何時測量,是否使用盲法評價方法),預測指標及定義(明確定義預測模型所用到的所有預測指標,包括任何測量以及何時測量,是否使用盲法評價方法)。

⑤ 如果有必要,需要描述研究的樣本量任何確定。

⑥ 交代缺失數據的處理方法及細節。

⑦ 對於腫瘤預後模型:詳述模型建立的過程,包括預測指標的選擇,描述模型驗證中預測值的計算方法;詳述模型驗證的過程, 研究對象的特徵分析、 內部驗證/外部驗證; 模型預測效果的評估方法, 比較驗證數據集和建立數據集在人口學特徵、臨床指標和預測指標等重要變數上的分布差異;並對不同的預測模型進行比較。

⑧ 如果做了風險分層分析,請描述分層建立的細節。

⑨ 預期結果預測:提供可對個體進行預測的完整預測模型,如所有的回歸係數、模型常數項或某時點的基線生存情況等;描述如何使用預測模型, 並對預測效果進行估計。

⑩ 交代局限性,推廣和應用。



下期:基於本期講解文獻中的實際數據,講解Lasso方法在腫瘤基因位點篩選中的應用。



本公眾號部分精彩歷史文章:

04:如何在R軟體中求一致性指數(Harrellconcordance index:C-index)?

05:Nomogram 繪製原理及R&SAS實現.

06 :Lasso方法簡要介紹及其在回歸分析中的應用

07 : 最優模型選擇中的交叉驗證(Cross validation)方法

08 : 用R語言進行分位數回歸(Quantile Regression)

09 : 樣本數據中異常值(Outliers)檢測方法及SPSS & R實現

10 : 原始數據中幾類缺失值(Missing Data)的SPSS及R處理方法

11 : [Survival analysis] Kaplan-Meier法之SPSS實現

12 : [Survival analysis] COX比例風險回歸模型在SPSS中的實現

13 : 用R繪製地圖:以疾病流行趨勢為例

14 : 數據挖掘方法:聚類分析簡要介紹 及SPSS&R實現

15 : 醫學研究中的Logistic回歸分析及R實現

16 : 常用的非參數檢驗(Nonparametric Tests)總結

17 : 高中生都能看懂的最小二乘法原理

18 : R語言中可實現的常用統計假設檢驗總結(側重時間序列)

19 : 如何根據樣本例數、均數、標準差進行T-Test和ANOVA

20 : 統計學中自由度的理解和應用

21 : ROC和AUC介紹以及如何計算AUC

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