生信分析平台搭建（五）：個性化設置

05-24

生信分析平台搭建（五）：個性化設置

來自專欄基因學院

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將工作環境配置成自己喜歡的樣子，不僅能提高工作效率，而且，一個漂亮的界面會帶給人一種賞心悅目的感覺。沒錯，我就是「以貌取人」。

九：個性化設置

1、安裝vim

系統自帶的vi不好用，不支持語法高亮，還是使用vim方便。切換到root賬戶，利用apt下載vim

apt install -y vim

2、cd /usr/bin目錄下，將原來vi命令修改為vi.bak，直接刪除也可以，然後將vim命令鏈接為vi，這樣以後系統中使用vi命令，默認是使用vim。

3、配置vim，利用vim打開

/etc/vim/vimrc文件，刪除原有內容，將下面這些內容添加進去，保存退出。這些是用來設置vim特性的，我使用的比較簡單，主要就是語法高亮以及設置行號，其實還有非常多個性化的設置。Linux系統命令行軟體沒有圖形化設置菜單，很多東西都是通過文本的配置文件進行設置。要熟悉這種方式。

4、再次打開文件，發現多了行號，文本顏色也發生了變化，表明設置成功了。

5、修改系統源

源是系統默認下載資源的網站，比如前面我們apt命令下載vim，默認從 http://cn.archive.ubuntu.com/ubuntu/

這個站點進行下載，可以切換到國內站點，這樣速度會明顯提升。有時需要添加一些額外站點，這樣才能下載到需要的資源。比如修改為國內的阿里雲的站點。

6、cd /etc/apt目錄下，使用的就是sources.list文件，首先備份一下，cp sources.list sources.list.bak

然後利用vim 修改sources.list，從網上找到新的源網址，複製進去，保存退出，apt update更新一下。

7、默認的命令行界面是白色或者綠色，不是很明顯，Linux的好處就是什麼都可以修改。每個用戶home目錄下的.bashrc 文件中的PS1變數用來控制命令行顯示。

8、vim打開.bashrc文件，找到其中的PS1，將其替換為下面代碼。不同系統.bashrc文件少有差別，有些還包括PS2，這個是子shell，一般不怎麼用。

PS1="[33]2;h:u w0733[33;1m]u 33[35;1m 33[0m [33[36;1m]w[33[0m]
[e[32;1m]$ [e[0m]"

9、source .bashrc刷新一下，或者新開一個Terminal即可看到變化。這樣是不是好了很多，可以自己設置更多的模式。

10、可以通過Edit菜單進行更多個性化設置，例如修改主題顏色，透明度等，可以在透明界面播放NBA，上面敲代碼。

11、alias常用命令，可以將一些常用的複雜命令通過alias添加到.bashrc中，例如ll=ls -lh --file-type ，我一般喜歡用單個字母表示，例如t=top，e=exit，d=display，可以根據個人偏好進行設置。

12、修改PATH，.bashrc中的PATH變數非常重要，這個系統默認搜索程序路徑，別人系統直接敲bwa可以，你的不行，即使你安裝了軟體，這是因為bwa可執行的程序沒有添加到PATH變數中。一般我喜歡將一個點「.」添加進去，這樣省去敲"~/."來運行程序。

Tips:以上所有操作都是用root賬戶完成，使用root賬戶需要小心。