iTRAQ技術分析玉米葉片中滲透脅迫以及脫落酸(ABA)調控的磷酸化蛋白質組

iTRAQ技術分析玉米葉片中滲透脅迫以及脫落酸(ABA)調控的磷酸化蛋白質組

基本信息▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼▼

材料：玉米葉片

主要技術：iTRAQ、LC-MS

期刊：Sci. Rep.

影響因子：5.578

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1、文章摘要......

脫落酸(ABA)是調控植物生長發育和脅迫應答反應的激素。蛋白磷酸化及去磷酸化作為重要的翻譯後修飾(PTM)參與了ABA的信號轉導過程。然而，滲透脅迫下的玉米ABA所調控的磷酸化蛋白還未可知。本研究採用玉米突變型vp5(ABA合成缺陷)和野生型Vp5鑒定了滲透脅迫下的ABA調控的葉片磷酸化蛋白。應用多標記的

iTRAQ

定量蛋白組和串聯質譜(LC-MSMS)技術，共鑒定出4052條磷酸化肽段，對應3017個磷酸化蛋白，這4052條磷酸化肽段包含了5723個非冗餘的磷酸化位點，其中512條磷酸化肽段(Vp5中379條，vp5中133條)在滲透脅迫下表現出磷酸化水平上的至少1.5倍的差異(40條磷酸化肽段擁有共同的基因型並且受ABA不同程度的調控)。通過比較野生型和突變型的滲透反應信號通路，發現ABA在mRNA合成、蛋白質合成和光合作用過程中發揮著重要的調控作用。本研究提供了玉米適應滲透脅迫下ABA調控的磷酸化肽段及磷酸化蛋白的全部數據集，將有助於闡明ABA介導的通過觸發磷酸化或去磷酸化反應的玉米抗旱機制。

2、方法流程......

3、小鹿點評......

該實驗是一篇比較有代表性的以iTRAQ技術為核心，結合磷酸化肽段富集策略進行植物特定性狀(乾旱耐受能力)研究的例文。一方面，磷酸化蛋白和很多信號通路相關；另一方面，ABA與植物抗旱也存在著密切關係，所以本文在研究材料選擇上又進一步地聚焦到ABA合成酶突變體和野生型材料。精細的研究材料加上高通量的組學技術使得我們對特定目標性狀有更深入的認識。所以，本文也是一篇以高通量組學技術進行經典分子生物學課題(突變體單基因功能研究)研究的例文。

4、文獻來源......

Hu

X. et al., Quantitative iTRAQ-based proteomic analysis of

phosphoproteins and ABA-regulated phosphoproteins in maize leaves under

osmotic stress. 2015, Sci. Rep.

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