【科普】包病毒的原件你認識幾個?
很多同學包病毒的時候一般照著protocol就能完成了,但是卻不知道那些plasmid包括了病毒需要哪些原件。今天給大家科普一下。
用的最廣的是二代包病毒系統,通常由三個部分組成:
- Packaging plasmid:比如 psPAX2,其中包括HIV gag, pol, rev, tat
- tat是用來激活transfer plasmid
- Envelop plasmid: 比如pMD2.G,裡面包括VSV-G
- Transfer plasmid:兩段LTR中間,夾著promoter驅動的cDNA或者shRNA
- 其中5『LTR需要靠tat的表達才能激活下游
- 對於shRNA來說,用的promoter一般是U6或H1,可以驅動Pol
III。
- 對於cDNA來說,用的promoter一般是CMV或者RSV,可以驅動PolII。
接下來是三代包病毒系統,它比二代更加安全,效率卻沒有二代高。
為什麼說它更加安全了呢?
這就要說到病毒感染的本質了。
它的本質是把自己的序列整入宿主的序列。
如果只有transfer plasmid中的序列整入進宿主的話,那麼它是無法再次變成病毒的,因為其他packaging和envelop的序列沒有被整入。
如果要想讓宿主自己產生病毒,需要滿足一個很艱難的條件,就是要把transfer,packaging和envelop三個plasmids中的序列同時recombine進入宿主。
那為什麼說三代更安全呢?
因為三代里把packaging分成了兩個部分,一個有Rev,另一個有Gag和Pol。
因此所有plasmid加在一塊後,就有四個plasmids了,進而加大了四個同時recombine的難度。
同時,通過修改transfer中的5』LTR使其不再依賴HIV tat來激活下游,三代系統摒棄了packaging裡面的tat,因此安全係數進一步提升。
- 這裡注意一下,如果你的vector是三代的(即有不需要依賴tat激活的5『LTR),那麼有沒有tat都無所謂,所以二代系統三代系統都能用。
- 但如果你的vector是二代的,也就是正常的5』LTR,你還是需要tat的表達的,因此只能用二代系統。
問答時間
- Lentivirus 和retrovirus有什麼區別呢?
Lenti是retro的一種,要真說和標準retro的區別的話,那麼就是lenti可以感染non-dividing和dividing的細胞,而retro只能感染dividing的細胞,所以lenti的作用更廣。
二者都用gag,pol,rev來package,但是因為是不同的病毒,所以用的會有細微的差別(不同的isoform)。
2. 你直接用你的lentivector做一個瞬轉成不成?
答案是不推薦。因為很可能由於LTR(比如二代的需要依賴tat),沒有tat的情況下,基因表達量會很低。
最後給大家上一個transfer plasmid中lentivirus原件的表格,對於構建一個transfer plasmid很有用哦。
是不是很簡單呢?科科。
Reference
- Addgene Lentiviral Guide
推薦閱讀:
※這位諾獎得主不僅靠「虐狗」而聞名,還曾用親弟弟做實驗
※傷腦筋,成年後人腦海馬區神經元不再更新 | 前沿
※不同種類的蝸牛吃什麼東西是一樣的嗎?
※古今海怪:海洋生物專輯
※兩個漢字登上Nature背後:最新研究支持亞洲栽培水稻起源新觀點 | 中國發現