【科普】關於Ubiquitination
Ubiquitination是post-translation中重要的一項。
它最被人熟知的功能就是可以引導蛋白的降解。但這只是其中一項而已,它還有很多其它的功能,比如:
- 引導蛋白去哪兒
- 引導蛋白和另一個蛋白的互動
- 將kinase給激活
- 促進receptor的吞噬
- 幫助DNA的修復和複製
- 調節基因的轉錄
由此可見,ubiquitination的調節是非常重要的。
那麼ubiquitination標記的原理是什麼呢?
如上圖,E1將ubiquitin傳給E2,E2之後和E3:目標蛋白相連,E2再將ubiquitin轉給目標蛋白。之後目標蛋白將有一串ubiquitin。
Ubiquitin由76個氨基酸組成。它熱衷於和NH2連在一起,因此在64個氨基酸中,它最喜歡和Lysine(K)中的NH2相連。下圖是Lysine的化學結構。
組成Ubiquitin的氨基酸中有很多Lysine (位置上有K6,11,27,29,33,48,63),因此Ub之間串聯的方式多種多樣。
不同的串聯方式所對應的功能也不一樣。
舉一個K63串聯的例子。
如上圖所示。一串K63的ub形成一個框架,將TAB1/2:TAK1和IKKg(NEMO):IKKa/b的距離拉近,使得TAK1可以將IKKb磷酸化,IKKb進而磷酸化IkB,使得IkB降解,讓NFkB得以釋放而進入細胞核,開啟一系列的因子。
再舉一個K63的例子:
一串K63的ub將NEMO/TANK/Ikk/TBK1激活,進而磷酸化IRF3,使得IRF3進入細胞核,激活一系列的Type1 IFN因子。
總結上面兩個關於K63 Ub的例子,即:
Reference:
Sun SC, Nat Rev Immunol., 2008
Janeways Immunology, 9th edition
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