【科普】B細胞の養成之路(六)
在給大家介紹成熟B(也叫naive B)和naive T細胞的相互作用前,我們先來談談為B細胞多樣性做了更多貢獻的兩個機理:
- somatic hypermutation
- class-switch recombination
先說說somatic hypermutation。
它的原理如下:
AID是一種酶,會把GC pair中的C通過酶的催化變成U,接下來會有兩種結果:
- 如果U的錯誤沒有被發現,那麼DNA中的兩條鏈在複製的時候就會有一條是WT,而另一條則會是複製了U而變成了的AT pair
- 如果U的錯誤被發現了,那麼U會被UNG酶切掉,之後會有其他酶把這個缺口增大,同時一種error-prone的DNA polymerase會過來隨意安一些base,而複製之後,一條是WT,另一條則會有一些突變。
接下來說說class-switch recombination。
它的主要步驟如下:
如圖,IgM的constant部分非常長,對它的某個部分的剪切可以使得constant變成其他的isotype。這張圖中,IgM constant中的一部分被裁剪掉了,並通過NHEJ又把斷掉的部分重新相連,於是成為了IgG1的isotype。
那麼如何剪切能使得IgM變成其它的isotype呢?
下面這張圖完美地回答了這個問題。
開頭的VDJ不變,後面的constant的部分通過不斷地進行recombination,從而變成了不同的isotype.
那麼這個recombination是通過哪些酶如何作用的呢?
- AID 會把 C變成U
- UNG/APE1會在U的地方進行切割
- DSB在左右兩段形成
- NHEJ會將兩段align,使其相連。
不難看出,整個過程由AID起始,如果沒有AID,這個過程就會失敗,因此AID非常重要。
那麼AID是如何有選擇性的進行C到U的轉換呢?
這就要涉及最近一個非常有趣的發現了。
類似於Cas9酶和sgRNA的原理,AID酶也需要一個類似於sgRNA的RNA來進行引導。
大致的機理如下:
- RNA polymerase會進行mRNA的合成
- Alternative splicing會把intron 給切出來。(intron的兩端分別由splice donar和splice acceptor作為標記)
- 切出來的intron因為具有大量重複的片斷以及G,會形成G-quadruplex RNA(字面上就是G-四連體,配合圖中RNA的結構,就像有許多層的小架子一樣,由四個角(G)來固定)
- AID酶會和這個四連體相結合,由它引導去在特定的位置進行作用。
這個作用機理是不是和Cas9/sgRNA的很像呢?我們是不是也有可能進一步拓展一下這個機理呢?比如調查非常多的四連體RNA的結構,然後找到他們的共性,利用這個共性我們去合成人工的四連體RNA,之後由U9 promoter驅動,和AID酶共同表達,是否能完成對特定部分的切割呢?而且這個切割是DNA的切割。
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