生信分析平台搭建(九):Aspera
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隨著測序數據的大量產出,數據傳輸成為行業發展瓶頸。不過「車到山前必有路」,Asprea是一種高效的數據傳輸解決方案,可以快速在網路間傳輸數據,怎麼來形容呢,迅雷不及掩耳盜鈴之勢……
十三:Aspera
1、下載軟體
wget http://101.96.8.140/d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/connect/bin/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz
2、安裝軟體
tar -zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gzsh aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh
3、軟體默認安裝到home目錄下,在一個隱藏的點.aspera 目錄下。這個是瀏覽器調用的目錄,圖形化界面下可以直接使用瀏覽器調用。
4、軟體使用,asperaconnect為瀏覽器插件,可以直接在瀏覽器中使用。windows系統比較容易安裝,Linux系統安裝之後有可能還需要進行依賴配置。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/download/
5、命令行使用,
6、下載人第一號染色體
.aspera/connect/bin/ascp -i .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --overwrite=diff -QTr -l6000m anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:genomes/H_sapiens/CHR_01/ . (注意後面的點,表示下載到當前目錄)
Tips:Aspera不能使用root賬戶安裝和使用,必須使用普通用戶。
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