信分析平台搭建(十九):安裝Galaxy
05-09
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前面我們的應用都使用Ubuntu的終端命令行,如果實在是不喜歡命令行,可以提供一個圖形化的數據分析界面,Galaxy就是這樣一個生物信息分析的圖形化框架,可以進行個性化設置,安裝到伺服器端對外提供服務。
二十四:基本配置
1、安裝vim
git clone -b release_17.09 https://github.com/galaxyproject/galaxy.git
2、cd 到galaxy目錄,運行安裝腳本,這一步比較耗時。
sh run.sh
3、安裝成功之後,默認本地運行,瀏覽器登錄127.0.0.1:8080,默認8080埠(Rstudio使用8787埠)。
4、默認本地運行,如果想放到互聯網上,需要修改配置文件config/galaxy.ini,如果沒有這個文件,拷貝生成
cp galaxy.ini.sample galaxy.ini
host = 0.0.0.0
5、添加管理員賬戶,修改配置文件 vi config/galaxy.ini,將管理員賬戶添加到admin_users關鍵字中。
# this should be a comma-separated list of valid Galaxy users
admin_users = user1@example.com,user2@example.com
6、安裝所需工具
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