生物信息學100個基礎問題：問題及答案目錄

寫在最前面的話

從去年6月開始，我們一直在嘗試著做生物信息學的知乎Live，嘗試著把我們知道的一些基礎的，入門的生物信息學知識分享給大家。在分享的過程中，我們受益頗多，也深感我們自己還有很長的路要走。

今年春天，我們想嘗試一個新的模式，就是把我們自己學習生物信息學過程中遇到的問題整理成100個生物信息學基礎問題分享給大家。我們期待著，通過這100個生信問題的探索，我們能夠成為志同道合的朋友；期待著一些朋友能從小白成長為能夠獨立承擔生信課題的小牛；期待著我們一起去合作，用生物信息學的方法探索點什麼！

本篇文章是各個問題及答案的鏈接目錄，會持續更新。希望大家多多點贊，轉發！

如果，你之前還在畏首畏尾，覺得生信是一個很難的事情，那麼請從現在開始，從今天開始，讓我們一起開始學習！

「種一棵樹，期待著成材，最好的時間是十年前，其次就是現在。」

第1~5題問題及答案

問題

生物信息學100個基礎問題 —— 第1題 FASTQ與FASTA

生物信息學100個基礎問題 —— 第2題 測序技術初探

生物信息學100個基礎問題 —— 第3題 Illumina測序技術細節探究

生物信息學100個基礎問題 —— 第4題 Illumina測序技術細節探究 II

生物信息學100個基礎問題 —— 第5題 測序建庫的adapter

答案

生物信息學100個基礎問題——第1~ 5題 答案公布

第6~10題問題及答案

問題

生物信息學100個基礎問題 —— 第6題 讀懂FastQC報告 Part I

生物信息學100個基礎問題 —— 第7題 讀懂FastQC報告 Part II

生物信息學100個基礎問題 —— 第8題 讀懂FastQC報告 Part III

生物信息學100個基礎問題 —— 第9題 讀懂FastQC報告中的duplicate問題

生物信息學100個基礎問題 —— 第10題 讀懂FastQC報告之adapter與kmer

答案

生物信息學100個基礎問題——第6~ 10題 答案公布

第11~15題問題及答案

問題

生物信息學100個基礎問題 —— 第11題 使用cutadapt去除adapter

生物信息學100個基礎問題 —— 第12題 trim與cutadapt 先用哪個？

生物信息學100個基礎問題 —— 第13題 從雙序列比對開始學起

生物信息學100個基礎問題 —— 第14題 你應該知道的BLAST

生物信息學100個基礎問題 —— 第15題 知道了BLAST，可是你知道BLAT嗎？

答案

生物信息學100個基礎問題——第11~15題 答案公布

第16~20題問題及答案

問題

生物信息學100個基礎問題 —— 第16題 高通量測序的回貼問題 I

生物信息學100個基礎問題 —— 第17題 高通量測序的回貼問題 II (SAM文件與BAM文件)

生物信息學100個基礎問題 —— 第18題 高通量比對的質量MAPQ

生物信息學100個基礎問題 —— 第19題 SAM/BAM中的CIGAR值

生物信息學100個基礎問題 —— 第20題 SAM/BAM中的其它重要信息列

答案尚未公布

第21~25題問題及答案

問題

生物信息學100個基礎問題 —— 第21題 SAM/BAM中的附加標記信息

生物信息學100個基礎問題 —— 第22題 都有了SAM文件，為什麼還需要BAM文件？

生物信息學100個基礎問題 —— 第23題 轉錄組的比對與基因組的比對有何不同？

生物信息學100個基礎問題 —— 第24題 GFF，GTF到底是什麼？

生物信息學100個基礎問題 —— 第25題 GTF/GFF的注釋是怎麼來的，應該從哪裡下載？

答案尚未公布！

番外

生物信息學100個基礎問題 —— 番外1： 不學Linux做什麼生信？

生物信息學100個基礎問題 —— 番外2: 用Anaconda快速搭建生物信息學分析平台

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