生物信息學100個基礎問題 —— 第4題 Illumina測序技術細節探究 II

我們接著第2個問題,第3個問題接著問。既然我們已經知道的Illumina測序的基本概念,基本過程;也知道了Illumina測序的主要特點。那麼還是要有個細節的探索。

1. Illumina目前主流的測序儀都有哪幾種型號?各自大概的通量是多少?(也就是1個run能跑出多少數據)

2. Illumina目前的測序技術,最核心的就是邊合成邊測序,即我們常說的 Sequencing by synthesis (SBS),那麼為什麼能夠實現SBS?

3. 我們在第1問中,問了大家一個問題「Illumina測序技術為什麼不能像第1代測序技術一樣測500bp以上?」,這裡面主要涉及到兩種錯誤,一種叫phasing,一種叫pre-phasing,分別是什麼意思?

提示與參考資料:

1. 參考資料 高通量測序技術-孟浩巍-illumina 測序原理介紹

2. phasing,pre-phasing的概念很少有人提到,這裡我給大家準備了個英文資料 Diagnosing problems with phasing and pre-phasing on Illumina platforms

推薦閱讀:

生物信息學100個基礎問題 —— 第11題 使用cutadapt去除adapter
生物信息學100個基礎問題 —— 第16題 高通量測序的回貼問題 I
【討論】WGCNA 分析中需要設定多少個模塊比較合理

TAG:生物信息學 | Illumina | 測序 |