40%消費級基因檢測可能是錯的，大部分與癌症有關！

隨著測序技術的進步，人類正在試圖解讀自己，醫生通過基因測序對患者進行快速的診斷，普通人則希望解開「身世」之謎：了解家族歷史、遺傳疾病潛在風險，更好的規劃生活，規範行為，這一需求促使著直接面向顧客（direct-to-consumer，DTC）類測序服務的飛速發展，數以百萬計的消費者向生物技術公司提供一點唾液來獲得自身部分的遺傳信息。

但是，根據發表在 3 月份 Nature 子刊 《Genetics in Medicine》上的一份研究顯示 40 %的消費級基因檢測可能是錯的，其中大部分與癌症有關。

圖 | 左圖顯示了 49 例 DTC 數據中有 60% 為真實的致病突變，40% 為假陽性；右圖顯示了與假陽性病例有關的基因，以及此次試驗中這些基因出現的次數

雖然此次研究的樣本量小，但首次揭示了 DTC 測試的解讀與實驗室診斷性基因測試的巨大差異，也提醒消費者不要過度依賴商業測序結果，當出現負面結果時不要過度驚慌，應及時與醫生溝通，選擇進一步的臨床醫療診斷。

測序的原始數據（raw data）對於普通人來說簡直可以算得上是天書，沒有專業的解讀，原始的基因位點信息對於普通消費者來說幾乎沒有任何價值，而目前 FDA 也禁止大多數 DTC 公司提供診斷性的基因檢測。

圖丨此次研究的論文

但是現在，消費者可以通過相應的測序公司或其他第三方公司，根據原始數據為其提供基因分型信息，得知獲得某種疾病的潛在風險。但由於缺少臨床試驗確認，誤讀再所難免，可如果說誤讀居然達到 40%，我們又該如何理性看待呢？

蓬勃發展的測序市場，真假如何？

證明結果是不是可信，要用數據來說話。

在此次研究中，基因診斷公司 Ambry Genetics 的研究人員重新分析了 49 例 DTC 的原始數據，並與臨床試驗數據進行比對。結果發現，只有 60% 的致病突變為真實的，其餘 40% 為假陽性，其中絕大多數都是與癌症相關的基因。除此之外，一些被認定為「高危突變」的基因也被重新認定為良性的「常見突變」。

一般來說，原始數據的解讀很大程度上依賴於資料庫的大小與質量（FDA 並不允許商業測序公司提供健康診斷），消費者對應的人種在資料庫中的數據越少，報告的可信度就越低，一些情況下，如果第三方解讀公司選擇的資料庫質量不佳失之毫釐，最終的報告結果很可能就謬以千里了。

該文章的第一作者、Ambry遺傳諮詢師Stephany Leigh Tandy-Connor在一份聲明中表示，在這項特定研究中，假陽性率如此之高是出乎他們意料的，這也讓他們對現今DTC基因檢測的準確性感到擔憂。

注：Ambry Genetics 是最大、發展最快的基因檢測公司之一，臨床基因診斷和遺傳學軟體解決方案的領導者，擁有 AmbryShare（http://www.AmbryShare.com）疾病特異性基因組測序公共資料庫。

本研究由 Ambry Genetics 研究人員完成。

而這些錯誤也提醒我們正視專家及諮詢師數年來對公眾提出的警告：直接面向消費者的基因測序結果應該在專家的協助下解讀，尤其在設計疾病風險時，更需要進行進一步的臨床檢測。由於疾病是由於基因、環境及生活方式共同作用，遺傳風險並不能「一錘定音」。

儘管此次研究並未提及初始報告的給出公司，但也實在是不難猜測，因為如今 DTC 商業測試市場上撥弄風雲的也不外乎就是這幾家公司：Family Tree DNA, My Heritage, 23andMe, ancestry. com。

單就 23andMe 這家公司而言，這幾年可謂風光無限。這家位於美國加州的基因檢測公司累計融資超過 7 億美元，估值超過 10 億美元，在多年的經營中，已累積超過二百萬名顧客，超過 2 億美元的收入。預計在未來 5 年內，DTC 測序市場的規模將達到 3.4 億美元。

只要願意付出 79 美元和幾口唾沫，消費者就會得到家族歷史的遺傳信息，如果願意再掏出 80 美元，你將在原始數據的基礎上獲得多項解讀，包括遺傳健康風險、血統信息、健康狀況等。如果同時獲取配偶的具體情況，甚至可以算出孩子患有遺傳疾病的概率。

而 23andMe 這隻獨角獸也表明了當仁不讓的態度：2015 年，美國食品及藥物管理局（FDA）批准第一個面向消費者的遺傳病基因（Bloom 綜合征）檢測，該服務由 23andMe 提供；2017 年，FDA 批准首個面向消費者的 10 項疾病的基因檢測，並授權 23andMe 進行檢測，值得一提的是，23andMe 也是唯一一家獲 FDA 批准的直接面向消費者的基因檢測公司。

今年 3 月，美國 FDA 宣布 23andMe 獲得首個直接面向消費者的癌症風險基因檢測授權，主要針對與乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌風險相關特定突變基因的檢測。這種試劑盒可以檢測三種已知可以使人患癌症的基因突變，但仍有數百種的其他突變並未參與檢測。

而 23andMe 首席執行官兼聯合創始人 Anne Wojcicki 則表示，公司提供的DTC基因檢測結果與DNA測序技術的金標準Sanger測序的一致性超過99%，並通過研究證明，重複性和可重複性大於99%，具有極高的準確性和精確性，並能保證安全性和有效性。

Tandy-Connor 也指出，此次研究結果同樣突出了對 DTC 基因檢測結果進行驗證確認的必要性。隨著基因技術的發展，未來 DTC 基因檢測的準確性能夠有大幅提升，但在這個過程中，有關去偽求真的討論不應該停止。