生物信息實用R語言筆記1-軟體安裝與設置

今天折騰了一天,終於在windows電腦上把Y叔的clusterProfiler這個R包安裝上了(linux平台上的反而還沒裝上)。終於體會到為啥說生物信息也是坑了。各種硬體兼容問題,各種軟體安裝問題,各種R更新,各種R包的依賴,除了不用跑來跑去,其實比做濕實驗輕鬆不了多少。

但是兵來將擋,水來土掩,辦法總比問題多。

只要學會手動安裝各種R包,安裝的問題就都能解決。不過我本來希望利用conda來自動配置R包的各種依賴關係,但是嘗試之後發現conda總是在報衝突,而且不同channel的R包軟體版本太多,比手動安裝更費勁。以後有機會會寫寫其中的經歷。

今天第一篇給出的是R的基本安裝,可以作為備忘錄存在電子筆記中,隨時查找。

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