傻傻分不清楚的R繪圖尺寸，一鍵答疑

遇到以下情景的請點贊：

情景一：當按期刊要求將圖片調整到指定尺寸或像素時……圖片嚴重變形；

情景二：圖片只有放大至400%或縮小至20%才能看清楚……還能不能愉快的玩耍了；

情景三：用R畫圖時，總報邊界太大的錯誤……可明明有時候表現挺好的。

為什麼會出現上述問題？原來是這些概念沒被分清楚~

矢量圖vs點陣圖

矢量圖和點陣圖是常見的兩種圖形，關於二者區別，小編為大家找了一個簡單示例圖，請自行查看。此外網上還有很多詳細的講解，相信聰明的你一看就會。

?英寸 （inch）vs 像素（px，pixels）

像素和寸（在R裡面用英寸）是常見的圖片尺寸。英寸就是實際物理尺寸，一個像素其實就是一個顏色格子。要說二者關係還離不開解析度dpi。

1英寸（in）=25.4毫米（mm）

dpi（Dots Per Inch）表示一英寸內像素點的個數，像素點越多，解析度越高，dpi用於列印或印刷領域。當然它還有個同胞兄弟ppi（Pixel Per Inch），用於屏幕顯示領域。例如照相機在拍照時的解析度單位用ppi，在列印出照片時解析度單位是dpi。當輸出解析度高於攝入解析度時，照片則不清晰。一般期刊雜誌只要求圖片實際寬高、300dpi，並沒有提到像素。其實是由英寸限制了。

英寸*dpi=像素

當在R裡面用png默認參數生成圖片（480*480）時，要保證300dpi的解析度，需換成物理尺寸寬高均為1.6（480/300）inch。如果展示或列印的尺寸超過1.6inch，圖片dpi將低於300dpi，導致圖片不清晰。

1.為什麼是300dpi？

人眼能分辨出的最大解析度是300dpi。超過這個解析度，人眼是無法看出差別的，也就是說300dpi和600dpi在人眼看來是沒有差別的，所以現在的沖印設備最大的設計輸出解析度以及期刊要求，就是300dpi。

2.點陣圖可以直接以英寸做單位嗎？

點陣圖函數可以選擇單位，當設置成英寸時，還要設置解析度才能保證圖像清晰。如png（height =7,width = 7，units = "in"，res=300）。?

pt vs cex

各學術期刊一般對字型大小等均有要求，比如Nature系列，根據位置不同，字型大小不同，一般為5~8pt，線型為0.25~1pt。

pt（point），中文譯為「磅」，是1/72英寸。px與pt不同，只有當圖像解析度為72dpi時px才是1/72英寸。所以期刊在要求6pt字型大小時，肯定會對圖片大小也有限制（如Nature要求單列寬89mm，雙列寬183mm，高247mm或120-136mm），否則會導致圖太大字太小。

在AI，PS裡面可以對矢量圖修改pt值。那點陣圖怎麼辦？當然生成時符合要求就行了。

R中字型大小大小調節參數是cex。在pdf()和png()生成畫布時是由pt設置的，默認pointsize=12，表示12pt。畫圖參數par（ps=12）也可以調整字體大小。而真正繪圖時cex表示縮放的倍數，默認等於1。即當cex=0.5時，字型大小大小則為6pt。期刊要求的線條（Nature要求0.25pt~1pt），可以通過lwd來設置，單位是pt。?

mar vs mai

對於畫圖邊界的設置par()裡面有mar和mai兩種參數。mai是以英寸為單位，mar是以行數為單位，行高是默認值。二者都是實際距離單位，不是相對值，差別在於單位長度不一樣，畫圖時二者只能取其一。當用pdf()畫圖時，默認是7inch。如果為了顯示legend，留白超過7inch，則會報錯。所以繪圖邊界設定時要考慮大小。

?總結

1、圖片的大小在生成圖片時是可以設置的，不需要手動轉換；

2、圖片尺寸和繪圖元素尺寸是匹配的。以像素為單位作為尺寸時，在列印時要注意物理尺寸，否則會影響清晰度；

3、邊界問題就不多說了，如果邊界太大，那就調整畫布大小。

最後提醒一句，不同期刊雜誌的繪圖尺寸大小要求不一樣，一定要查看清楚呦~

文案：生物信息分析部 任雪

設計：胡珊珊

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