【科普】B細胞的養成之路(二)
這一章我們來討論B細胞抗體的多樣性。
之前我們提到了輕鏈(VJ)和重鏈(VDJ)的基因重組。
那麼,這些基因重組和抗體的多樣性有什麼關聯呢?
從標題的基因圖上我們可以看到紅色黃色藍色的方塊有很多。假設每次你只能從各個顏色里選一個方塊出來進行組合,請問有多少種可能?
讓我們用下面這張圖給出的數量來算一下。
根據圖中的信息:
- 假設Kappa鏈的V區域有35種基因,J區域有5種,那麼Kappa鏈的重組之後的可能性有35 x 5 = 175
- 同理,假設 Lamda鏈的V區域有30種基因,J區域有4種,那麼可能性有30 x 4 =120種
- 假設Heavy鏈種的V區域有40種,那麼可能性有40 x 23 x 6 x 9 = 5520 種
- 因為Kappa和Lamda都屬於輕鏈,只能二選一和重鏈相結合,我們把這兩種鏈的可能性相加,即175+120= 295 種可能性。
- 將重鏈和輕鏈的可能性相結合,即5520 x 295 = 1.6 x 10e6 種可能性
從上面的計算不難看出,基因重組對於抗體的多樣性功不可沒,十分重要。
那麼輕鏈和重鏈的基因是如何重組的呢?
這裡我們來談一談重組的兩個原則:
- 12-23 VDJ/VJ 重組原則
- NHEJ連接原則
首先說12-23 原則
Rag 蛋白會識別12bp spacer 和23bp spacer,並把它們帶到一塊兒,並在V末端和J前端進行剪切。
剪切完了之後如何連接呢?
這就要說到NHEJ連接原則了。過程如下圖。
RAG切完之後會在末端形成發卡結構,並會釋放發卡結構(如圖),TdT此刻會在末端隨機地增添各種鹼基,兩個末端互補的地方這個時候將互相粘連,其餘未粘連的地方也將被填補。
圖中不難看出,每次連接的地方會都會隨機加進來一些鹼基,這進一步增添了其多樣性,大概能再帶來大約3 x 10e7 種可能性。
和我們剛才算的重組1.6 x 10e6四捨五入也就是2 x 10e6的可能性 相乘的話:
單單是 重組+連接 所帶來的可能性就有 (2x 10e6) x (3 x 10e7)
= 6 x 10e13 種!
然而這只是冰山一角,因為此刻B細胞還僅僅停留在骨髓裡面,還未遇到它的那個它(抗原)。
遇到了那個它之後,它的基因將會進一步發生更多的變換。
後面的故事留到下面幾章說。
PS:
- 原來RAG並不是單獨在兩段進行切割,而是把基因一彎,兩段同時切割,然後留下發卡結構。
- 重組帶來的多樣性不過兩個million,而光tdt隨機加入的鹼基帶來的多樣性能達到30個million!tdt太重要了。
- 關於Allelic exclusion,排外性,指的是一個lymphocyte上面只可以表達single-antigen-specific的Ig或者TCR。這也就是為什麼我們可以生產單抗體。
- Rag受post-translation調控,可以被磷酸化,進而被ub標記,並被proteasome消化。
Reference
Janeway『s immunology, 9th edition
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