常用科研軟體和計算資料庫鏈接 (持續更新)

04-21

註：本文部分參考了李強的「常用資料庫和鏈接」文章和Aron Walsh課題組Link。(見文末)

如果你覺得有用可以讚賞我的辛苦整理哦！歡迎各位補充！

一、常用科研軟體和下載鏈接

1. Office 2016，Office官網：https://www.office.com/

2. Origin 2016，Origin官網：https://www.originlab.com/

3. Endnote 8.0，Endnote官網：http://endnote.com/

4. 福昕9.0企業版，福昕官網：https://www.foxitsoftware.cn/

5. Zotero 5.0，免費軟體，官網下載鏈接：

https://www.zotero.org/

註：管理文獻非常好的軟體，強烈推薦，也有人使用Mendeley (https://www.mendeley.com/)。

6. Photoshop 2018，下載免費試用版或購買 Adobe 產品 | Adobe 下載

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二、計算常用軟體和資料庫連接

1. 結構查找和建模

(1) Materials Project，https://www.materialsproject.org/

註：需要用郵箱註冊登陸後才可正常使用。

(2) ICSD，https://icsd.fiz-karlsruhe.de/search/index.xhtml

註：需要購買才能正常使用，網頁版註冊後可以試用，查詢的結果不全，對應的桌面版軟體findit 2011破解版可加入364586948QQ群下載。

(3) COD，http://www.crystallography.net/cod/search.html

註：網頁版可以直接使用，貌似也有對應的桌面版軟體。

(4) ChemSpider, http://www.chemspider.com/

註：相比於前面幾個網站用於查找晶體材料的結構，這個網站可以很方便查找化學有機材料的結構。

(5) 晶體結構預測軟體

CALYPSO (particle swarm)，http://www.chemspider.com/

USPEX (evolutionary algorithm)，http://uspex-team.org/en/

2. VASP計算相關資源鏈接

(1) VASP 官方相關網站

VASP 官網，https://www.vasp.at/

VASP官方論壇，http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp-forum/forum.php

VASP 關鍵詞，http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/Index.html

VASP manual, http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/The_VASP_Manual

VASP Workshop Lectures，https://www.vasp.at/index.php/documentation

(2) VASP後處理軟體

vaspkit，https://zhuanlan.zhihu.com/p/29408873

qvasp，https://zhuanlan.zhihu.com/p/29408753

(3) VASP介面或者輔助計算相關軟體

Bader code，http://theory.cm.utexas.edu/henkelman/research/bader/

COHP code，http://schmeling.ac.rwth-aachen.de/cohp/index.php?menuID=2

wannier90，http://www.wannier.org/

NEB (VTST) code，http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/

phonopy，https://atztogo.github.io/phonopy/

(4) VASP高通量軟體

atomate，https://hackingmaterials.github.io/atomate/

ASE，https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/

pymatgen，http://pymatgen.org/

(5) VASP可視化軟體

VESTA，http://jp-minerals.org/vesta/en/

p4vasp，http://www.p4vasp.at/

Gnuplot，http://www.gnuplot.info/

Matplotlib，https://matplotlib.org/

(6) VASP視頻教程

https://zhuanlan.zhihu.com/p/30525917?refer=gangtangdft

(7) 其它相關軟體

生成能帶計算K點的網站：

http://cryst.ehu.es/

http://materials.duke.edu/awrapper.html

https://www.materialscloud.org/work/tools/seekpath

產生三維楊氏模量網站：

http://progs.coudert.name/elate

3. 編程語言學習資源鏈接

(1) python自學網站

http://bbs.fishc.com/forum-243-1.html

https://morvanzhou.github.io/

(2) linux和shell自學網站

http://study.163.com/course/courseLearn.htm?courseId=983014#/learn/video?lessonId=1158207&courseId=983014

http://www.cnblogs.com/90zeng/p/shellNotes.html

4. 其它

(1) Xshell (ssh客戶端)，https://www.netsarang.com/products/xme_overview.html

(2) 元素周期表，https://www.ptable.com/?lang=en

(3) 空間群信息查詢，http://img.chem.ucl.ac.uk/sgp/large/sgp.htm

(4) 雜誌名稱縮寫，http://cassi.cas.org/search.jsp

(5) 離子半徑查詢，http://abulafia.mt.ic.ac.uk/shannon/radius.php

(6) 常用單位轉換，http://halas.rice.edu/conversions

(7) 雜誌影響因子查詢，http://www.letpub.com.cn/index.php?journalid=4285&page=journalapp&view=detail

(8) Handbook of Chemistry and Physics

http://hbcponline.com/faces/contents/ContentsSearch.xhtml

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