精選 | 2018年1月R新包推薦
作者：Joseph Rickert
譯者：黃小偉，先後從事遊戲、社交及金融數據研究及應用相關工作，目前就職網易杭州，期待多交流
2018年1月份，CRAN收錄了200個R新包，本文節選了40個R包做以簡單功能介紹，其餘包可登錄CRAN自行查看，包括類別：數據、數據科學、科學、統計學、時間序列、工具和可視化等。目前，CRAN正在成為一個實用的、來之不易的科學知識庫。（ps：部分包在CRAN收錄後會存在下架的可能，大家在使用時可以稍加註意）
一. 數據
1. cancensus : 使用CensusMapper API 為加拿大人口普查和地理數據提供訪問介面。
2. elevatr : 提供多個針對海拔數據服務的訪問許可權，並且返回空間點數據框（SpatialPointsDataFrame）或者柵格對象。目前支持訪問Mapzen Elevation Service, Mapzen Terrain Service, Amazon Web Services Terrain Tiles和 USGS Elevation Point Query Service等服務商。
3. fabricatr : 提供模擬分層和相關數據的函數。
4. getTBinR : 支持世界衛生組織結核病數據的快速導入，並為探索性數據分析提供可視化功能。
5. homologene : 美國國家生物技術信息中心為同源基因資料庫提供了一個包裝，允許跨物種搜索基因同系物。
6. photobiologyFilters : 純數據包，包含頻譜「透射率」數據，用於頻繁使用的過濾器和材料，包括塑料片、薄膜、光學玻璃和普通玻璃以及一些實驗室器皿。
7. tfdatasets : 為TensorFlow數據集提供訪問介面，支持從簡單的、可重用塊構建複雜的輸入管道。
8. washdata : 支持獲取城市供水和衛生調查數據，該數據由城市貧民清潔水處理聯盟機構(WSUP)提供。
二. 數據科學
1. CRPClustering : 提供一種使用中國餐館過程Pitman（1995）的聚類方法，該方法不需要事先確定聚類數量，同時提供相關函數計算類的模糊性作為熵值Yngvason (1999)。
2. kerasformula : 為Keras神經網路提供一個高級數據介面。
3. multiROC : 通過微觀和宏觀平均計算ROC曲線下面積，提供工具來解決多個類別的分類問題。
4.reinforcelearn : 實現強化學習環境和演算法 Sutton＆Barto（1998）。
5. stranger : 提供一個解決框架，針對無監督異常檢測問題。
6. tidypredict : 提供函數用於解析R模型對象，並返回一個SQL查詢結果。
三. 科學
1. annovarR : 提供功能和資料庫資源，為基因組、轉錄組數據中的遺傳變異注釋提供整合框架,該包裝函數統一了許多已發布的注釋工具的介面，如VEP, ANNOVAR, vcfanno, 和 AnnotationDbi等。
2. pubh : 提供一個工具箱，使流行病學和公共衛生相關學科的學生和專業人員更容易使用R功能。
3. trajr : 提供一個工具箱，用於對二維動物軌跡進行統計分析。
四. 統計
1. dalmatian : 提供一個有效的功能，藉助JAGS自動擬合GLM模型。
2. dirichletprocess : 允許創建Dirichlet過程對象，這些對象可以用作無限混合模型。包括密度估計、泊松過程強度推理、分層建模和聚類等。
3. detpack : 提供部分功能，用於對大數據集進行密度估計，同時使用分布元素樹生成條件/無條件隨機數。
4. gnorm : 提供獲得廣義正態/指數功率分布概率、分位數、密度和隨機偏差的函數。
5. IROmiss : 提供一種通用演算法，即插值正則化優化（IRO）演算法，用於處理高維缺失數據問題。
6. KRIG : 提供Kriging模型和空間統計的各種方法的功能，包括使用再生核希爾伯特空間的多元敏感性分析和Sobol指數的計算。
7. natural : 在高維線性模型中，實現兩種誤差方差估計方法。
8. OpVar : 使用最大似然估計和貝葉斯方法，提供用於針對操作風險建模的函數。
9. netrankr : 實施網路中心性相關分析的方法，主要是通過由鄰域包含或位置優勢獲得的部分排名進行評估。
10. palmtree : 實現PALM樹演算法，這是MOB演算法（partykit包）的擴展，其中一些參數在所有組中都是固定的。
11. PMCMRplus : 提供函數來計算許多不同類型的成對多重比較測試。
12. seminr : 實施用於構建PLS結構方程模型的領域特定語言，兼顧一致性PLS的最新估算方法Dijkstra & Henseler (2015)、交互調整Henseler & Chin (2010)等內容。
五. 時間序列
1. santaR : 為短時間序列分析提供了一個圖形化的自動化流水線功能，旨在適應非同步時間採樣、個體間變異性、雜訊測量和變數較多等問題。
2. TSrepr : 提供時間序列的表示方法（如：降維、預處理、特徵提取等）。
3. TSstudio : 提供一組互動式可視化工具，支持ts、mts、zoo和xts對象的時間序列分析，包括用於預測模型性能、時間序列互動式圖表和季節性圖表的可視化函數等。
六. 工具
1. arrangements : 為排列、組合和分區提供快速生成器和迭代器，使用戶能夠以節省內存的方式生成排列。
2. fs : 在libuv C庫之上，實現文件系統操作的跨平台介面。
3. googlePolylines : 提供使用Google折線編碼演算法對簡單要素（sf）對象和坐標進行編碼的功能。
4. prrd : 對於給定的R包，提供反向排隊函數，支持多個工作人員進行並行測試。
5. rquery : 基於Edgar F. Codd的關係代數和運算符名稱實現查詢生成器，其目的在於增強在大數據量級下使用「SQL」的體驗。
6. tsibble : 提供一個tbl_ts類，用於存儲和管理以數據為中心格式的時間維度數據。
七. 可視化
1. breakDown : 實現分解圖，顯示模型中的每個變數的貢獻。
2. sigmaNet : 藉助Sigma.js，提供創建互動式圖形可視化的功能。
說明：限於個人水平，錯誤之處，懇請批評指正，歡迎多交流~
原文地址：https://rviews.rstudio.com/2018/02/22/jan-2018-top-40-new-package-picks/
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