【好書分享】生信技能學習指南

我在朋友圈看到一位好友曬了一本《Bioinformatics Data Skills：Reproducible and Robust Research with Open Source Tools》。當天看見就下載了，一直到昨天才從頭到尾瀏覽了一遍，寫得相當得棒。下面我們來看看，這本書到底好在哪裡~~

作者簡介

寫書的這位小伙以前是做生信的，現在研究進化遺傳學，是戴維斯加利福尼亞大學從事進化和種群遺傳學研究的@Graham_Coop的博士生。

我們來看書

如果你想學生信，上面的每一章內容都是值得去學的。現在回顧我的生信學習過程，一開始我看得是另外一本叫《Computational Biology:Unix/Linux, Data Processing and Programming》，這本書寫的也是不錯的，主要講的是Linux和perl用來處理生信數據的。當時英語不好呀，所以我就去看《鳥哥的linux私房菜》和《perl語言入門》。

今天推薦的這本書涵蓋了上面那本書的內容，多了生信項目管理、R語言、項目流程、資料庫操作等技能實戰介紹。這本書完全可以作為生信初學者的技能學習指南，5星強烈推薦。對於我來說，可以查漏補缺，例如第九章、第十二章和第十三章的技能，我都沒有完全掌握，在看到這本書之前我在做生信項目的時候知道自己在這幾個方面有所欠缺，現在我可以跟著這位作者好好學習這三項技能。

下面是今年我們生信技能樹團隊舉辦的生信編程實戰課程，如果是生信初學者掌握上面那本書的技能後，可以做下面的題目來鍛煉自己的生信編程能力。課程每道題都會用R/Shell/Python/Perl四門語言來講，現在課程即將結束，大家可以直接購買視頻合集。

課程列表：

生信編程直播第0題-生信編程很簡單

生信編程直播第1題：人類基因組的外顯子區域到底有多長

生信編程直播第2題：探索人類基因組序列

生信編程直播第3題：探索人類基因組注釋文件

生信編程直播第4題：多個同樣的行列式文件合併起來

生信編程直播第5題：根據GTF畫基因的多個轉錄本結構

生信編程直播第6題：下載最新版的KEGG信息，並且解析好

生信編程直播第7題：寫超幾何分布檢驗

生信編程直播第8題：ID轉換大全

生信編程直播第9題-根據指定染色體及坐標得到參考鹼基

生信編程直播第10題：根據指定染色體及坐標得到位置信息

生信編程直播第11題：把文件內容按照染色體分開寫出

生信編程直播第12題：json格式數據的格式化

寫在最後

之前還寫過一篇文章【生信菜鳥經】漫談如何跨越擺在生信入門路上的三大障礙。

【生信技能學習指導書】

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【生信技能編程實戰4個月合集】

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