生物信息學100個基礎問題 —— 第7題 讀懂FastQC報告 Part II
04-02
Hello 大家好！
今天我們接著昨天的話題來繼續進行與FastQC結果有關的提問。
我們昨天主要是針對FastQC結果中的boxplot進行了相關的探索，boxplot一般是認為FastQC幾張必看的質控圖之一。一般情況下FastQC的結果會包含下面幾個圖，而我們主要會看下圖圈出來的幾個。
接下來的幾天我們就把這些圖來一個一個討論清楚。
我們昨天討論了「Per base sequence quality」，今天先來討論 「Per base sequence content」
問題：
1. 圖1與圖2中橫坐標是什麼意思？縱坐標是什麼意思？
2. 圖1是1個正常的DNA 全基因組測序結果，為什麼前面的幾bp線是波動的？後面的線是平衡的？
3. 圖2是1個特殊RNA建庫的測序結果，4條線出現波動更可能是什麼原因造成的？
4. 在圖1中你能不能看出一個恆定的量？（提示，同一物種間相同，不同物種間一般不同）如果能看出來，這個量是什麼？數值大約是多少？
參考資料：
孟浩巍：20160410 測序分析——使用 FastQC 做質控
硬廣時間：
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3D基因組分析從入門到進階
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