開悟時刻
03-28
最近兩年一直在學生物信息,沒有系統的教材,也沒有老師,自己個摸索。linux,R,Python,Perl,統計分析挨個都來了一便。各種教程買了,各種公開課學了,筆記也做了一大堆,
後來.......零零碎碎的都忘了.........
所以到現在為止,生物信息的水平還在原地打轉。借口就不找了,原因也很明顯,就是沒有剛需,所學不能所用,主觀上也沒有賦予足夠重要的意義。動力不足,兩天打漁三天篩網。其次是不夠系統和深入,看到什麼學點什麼,一會學python一會學R,根本不知道學了有什麼用,一直停留在第一章和第二章。最近終於又重新回頭整理的一下,感覺學習的過程中必須把握住「學以致用」的中心,圍繞中心組織所要學習的內容,這樣才能事半功倍。比如說linux系統,很多教程上來就說生物信息要掌握linux系統,推薦學習《鳥哥的私房菜》。
我還真的入了這個坑,從第三版看起,看了不到一半就扔了再也沒看,後來斷斷續續學了《linux公開課》,看了科普類的《笨笨兔的故事》等書。但是實際上這些東西的收穫,還不如我仔細看兩天Bio-Linux系統的說明書有用。為什麼?因為生物信息入門所需要的linux知識根本不需要那麼多!在這一點上,自己真是走了不少彎路,現在才終於覺悟。順便推薦一個充滿乾貨的生物信息自學網站:基因課-在線生物信息培訓從這裡學短短一個課程的linux知識,就足夠你生物信息菜鳥水平用了。今後的學習中,先不著急Python和R語言的學習,將重心放在RNA-seq分析流程上,先跟著教材過一遍RNA-seq數據的分析,搞清楚基本流程,分析環境,所用到的軟體,然後再有的放矢的根據生物信息學分析的需要學習Python、R語言以及SQL資料庫的知識。
最後給大家再推薦點乾貨:沒有工作站、伺服器如何構建自己的生物信息學習和分析環境?用Bio-Linux Bio-Linux Overview自己學如何安裝,然後把系統自帶的說明文檔《Introduction to Bio-Linux》好好看完,做好筆記,這樣你就掌握了基本的linux操作了。
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