「斑馬魚基因與人類的相似度達87%」，這裡的基因相似度是指的什麼？

02-18

斑馬魚與人類基因相似度87% 能得與人類相同疾病
87%這一數據是怎麼來的，可信否？

可信。基因序列是由成千上萬的鹼基組成的。這句話是說，每100個斑馬魚的基因組的鹼基中有87個與人的基因組的鹼基相同。正因為這種相似性，所以斑馬魚可以在一定程度上用來研究人類疾病。成功的例子如：用斑馬魚模型篩選黑色素瘤藥物。

但是，也必須指出，13%的差別並不小。人和大猩猩夠不一樣了吧。99%相似度。所以1%也會有很大的效果。

底層代碼和注釋全是一樣的，用戶介面、調用函數稍微改了改

這篇可以看下，希望有幫助

The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome

Orthologue genes shared between the zebrafish, human, mouse and chicken genomes,

using orthology relationships from Ensembl Compara 63. Genes shared across species are

considered in terms of copies at the time of the split. For example, a gene that exists in one

copy in zebrafish but has been duplicated in the human lineage will be counted as only one

shared gene in the overlap

1

Howe, K. et al., The
zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome. NATURE496 498 (2013).

是的。我就是用斑馬魚做實驗的。相似度表示兩者的鹼基序列的重複性很高。但是造成形態上的差異有很多原因。因為基因會選擇性表達，不同物種哪怕基因相似度很高，DNA轉錄生成的RNA序列不一樣，導致表達的蛋白質也不一樣。。

細胞的組成很大一部分就是各種蛋白質，這樣就導致了整個生物體的巨大差異。。

就是拿斑馬魚和人的基因組做個blast得出來的。

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi