用image j測量特定區域面積佔總面積的比例

ImageJ（官網：https://imagej.nih.gov/ij/）是一個基於java的公共的圖像處理軟體，它是由National Institutes of Health（NIH）開發的一款功能強大的免費軟體，在生物及醫學圖像分析中起著非常重要的作用。 ImageJ能夠顯示，編輯，分析，處理，保存，列印8位，16位，32位的圖片， 支持TIFF（默認的文件格式，無損壓縮格式）, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多種格式。Imagej 的高級功能均依靠插件來實現，Imagej插件下載地址https://imagej.nih.gov/ij/plugins/index.html。大家可以根據自己的需要進行相關下載。網上有關Imagej的教程和操作方法有很多，有興趣的朋友可以自行學習。

在此有興趣交流的朋友，歡迎加入ImageJ使用交流互助群，群號碼：557522488，大家一起進步！

下面我們用Imagej來測量特定區域面積佔總面積的比例：

首先將藍色區域進行分離，如下圖：我們將圖片中的藍色完全的提取出來了。

調節閾值，將所有藍色進行選定，選中以後為紅色。

得到藍色區域的面積為48396平方像素。

整個區域進行選定，測量其面積為147373平方像素，由此我們得到了我們的題目要求。

一個其他的例子：

我在土豆網上還上傳了其他的視頻，http://www.tudou.com/my/center/item/itemList.do

1、利用IMaris軟體分析神經元

2、imageJ分析神經突起長度

3、ImageJ中RetFM-J插件分析分析HE染色圖片

4、ImageJ對熒光圖片進行半定量分析

5、IPP劃線看熒光強度用Origin作圖

歡迎各位交流指正。

ps：

熒光共定位分析

追蹤神經元形態：

數細胞，並分割相連細胞：

計算劃痕實驗面積：

多孔粒子的直徑分布：

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