怎樣用NCBI搜索並下載基因序列?

NCBI是生物學科經常使用的搜索引擎,其收納了大量的基因和蛋白序列,可以對這些序列進行比對、設計引物等,功能非常強大,下面是小編經常使用的一個功能,即基因序列信息的查找和下載。

  • 打開NCBI

百度搜索鍵入「NCBI」,點擊「搜索」,第一個就是官方主頁,點擊打開。

  • 關鍵字查找

以H9亞型流感病毒HA基因下載為例,說明詳細過程。

既然要下載基因序列,需要在欄目內找到「Nucleotide」(核苷酸),搜索欄內填入「Avian influenza virus H9 HA」,點擊「search」。

  • 添加限定詞

點擊搜索後,我們看到頁面中間顯示了很多關於「Avian influenza virus H9 HA」的基因序列,如果其中的一個符合你的要求,就可以下載。如何不符合你的要求,可以繼續在搜索條內添加限定,比如添加「2010」,即2010年分離到的病毒。

  • 序列選定

找到目標基因序列後,我們要將其下載下來。以給出第一個序列為例,點擊序列前面的「小方格」,將其選定。

  • 下載序列

選定後,點擊頁面右上角的「Send to」,選擇「file」,再將format選擇為「FASTA」格式,點擊「Create file」,將序列下載到自定的文件夾內。

  • 用DNAStar打開

下載的序列為FASTA格式,需要使用相關的軟體打開,小編經常使用的是DNAStar中的Editseq,這個功能還是很強大的。


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