擬南芥植物材料RNA(不含DNA污染)提取
擬南芥植物材料RNA(不含DNA污染)提取方法—包括幼苗、葉片、角果和種子等(O?ate-Sánchez and Vicente-Carbajosa, 2008)
1,用於擬南芥幼苗、葉片和花序材料RNA的提取方法:
首先配製提取液Ⅰ、提取液Ⅱ及7.5 M 醋酸銨,按照如下方法配製。
提取液Ⅰ(100 mL):2% SDS, 68 mM 檸檬酸鈉,132 mM 檸檬酸,1 mM EDTA。
提取液Ⅱ(50 mL):4 M 氯化鈉,16 mM 檸檬酸鈉,32 mM檸檬酸。
1)取30~50 mg的材料,在液氮中研磨成粉,迅速轉移到離心管中。
2)加入300 μL 提取液Ⅰ,充分振蕩,室溫靜置5 min。
3)加入100 μL 提取液Ⅱ,緩慢顛倒混勻,4℃ 冰箱靜置10 min。
4)加入150 μL 三氯甲烷,充分混勻,4℃,12000 rpm,10 min。
5)小心取上清,加入等體積異丙醇,顛倒混勻,4℃,12000 rpm,7 min。
6)去上清,沉澱用70% 乙醇洗一次,超凈工作台吹7 min, 加入30 μL 含有DNase Ⅰ的DEPC 水溶解沉澱,37℃ 消化1 hr。
7)加入70 μL DEPC 水、50 μL 7.5 M 醋酸銨和400 μL 無水乙醇,混勻,4℃,12000 rpm,20 min。
8)RNA 沉澱用70% 乙醇洗一次,乾燥RNA 並用20~50 μL DEPC 水溶解。
2,用於擬南芥角果和種子材料RNA 的提取方法:
首先是提取buffer、8 M 氯化鋰和3 M 醋酸鈉(pH 5.2)的配製。
提取buffer(100 mL):0.4 M 氯化鋰,0.2 M Tris,25 mM EDTA,1% SDS,pH 8.0.
1)取50 mg 角果或種子,液氮研磨至粉末狀,轉移到離心管中,加入550 μL 的提取buffer 和550 μL 的三氯甲烷,充分混勻,4℃,12000 rpm,5 min。
2)將上清轉移到新的離心管中,加入500 μL 水飽和酚和200 μL 三氯甲烷,充分混勻,4℃,12000 rpm,5 min。
3)將上清轉移到新的離心管中,加入1/3 體積的8 M 氯化鋰,充分混勻,4℃ 冰箱過夜或-20 ℃靜置1 hr,4℃,12000 rpm,30 min。
4)加入500 μL DEPC 水,7 μL 3 M 醋酸鈉和250 μL 無水乙醇,混勻,4℃,12000 rpm,10 min沉澱多糖。
5)將上清轉移到新的離心管中,加入43 μL 3 M 醋酸鈉和750 μL 無水乙醇,混勻,-20℃ 冰箱放置 1 hr,4℃,12000 rpm,20 min。
6)RNA 沉澱用70% 乙醇洗一次,超凈工作台乾燥7 min,加入含有30 μL DNase Ⅰ的DEPC 水溶解沉澱,37 ℃消化1 hr。
7)加入70 μL DEPC 水、50 μL 7.5 M 醋酸銨和400 μL 無水乙醇,混勻,4℃,12000 rpm,20 min。
8)RNA 沉澱用70% 乙醇洗一次,乾燥RNA 並用20~50 μL DEPC 水溶解。
參考文獻:
O?ate-Sánchez, L., and Vicente-Carbajosa, J. (2008). DNA-free RNA isolation protocols for Arabidopsis thaliana, including seeds and siliques. BMC Research Notes 1, 93.
http://weixin.qq.com/r/KkQmPuLE17_oraZd9xE4 (二維碼自動識別)
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