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ExAC項目的一些有趣結果

上周,Exome Aggregation Consortium (ExAC)項目(ExAC Browser),也就是目前規模最大的外顯子組測序項目(實際參與人數過9萬,最後收錄6萬多例),它的旗艦文章發表在了Nature上,見:Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans : Nature : Nature Research

該項目傳承了「大數據」項目一貫的優點:得到了一些百分比統計結果。其中部分結論,還是挺有趣的,可能算是組學時代的一些必知的新常識了。

1. 人人都帶有近百個足以失活蛋白功能的PTV(protein-truncating variant)變異,平均每人中有帶85個雜合變異(單拷貝基因失效),35個純合變異(雙份拷貝皆失效)。PTV變異指會導致蛋白編碼發生移碼突變、剪切失敗或提前終止的變異,一般認為該類變異會導致基因產物失去生物學功能。譯者按:然而,絕大部分人都是無表型的正常人

2. 平均每人都帶有約54個已在兩大致病基因資料庫(譯者按:HGMD與ClinVar)中收錄的致病突變,然而絕大部分此類突變都至少在一類地理人口分布中,頻率大於1%,因此很有可能這類突變並不是真正意義上的致病突變。譯者按:提示目前的致病突變資料庫需要大幅改進

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